| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 前言 | 第11-19页 |
| 1. 人体胃肠道微生态概况 | 第11-12页 |
| 2. 三联抗 H.pylori 疗法联合益生菌治疗对人体微生态的作用 | 第12-15页 |
| 3. 相关基因高通量测序技术的研究 | 第15-19页 |
| 一、材料和方法 | 第19-38页 |
| 1. 研究对象 | 第19-21页 |
| 1.1 纳入标准 | 第19-20页 |
| 1.2 排除标准 | 第20页 |
| 1.3 诊断标准 | 第20-21页 |
| 2. 研究方案 | 第21-24页 |
| 2.1 研究分组 | 第21-22页 |
| 2.2 实验用药 | 第22-23页 |
| 2.3 研究指标 | 第23-24页 |
| 3. 实验材料 | 第24-27页 |
| 3.1 仪器设备 | 第24-26页 |
| 3.2 试剂耗材 | 第26-27页 |
| 4. 实验方法 | 第27-34页 |
| 4.1 益生菌药品检验 | 第27-28页 |
| 4.2 H.pylori 的检测 | 第28-29页 |
| 4.3 胃液 pH 测定 | 第29-30页 |
| 4.4 粪便 DNA 提取及检验 | 第30-32页 |
| 4.5 16S rDNA 测序 | 第32-34页 |
| 5. 数据分析 | 第34-38页 |
| 5.1 基本统计学分析 | 第34页 |
| 5.2 生物信息学分析 | 第34-38页 |
| 二、结果 | 第38-77页 |
| 1. 一般资料 | 第38-42页 |
| 1.1 不良反应情况 | 第38-40页 |
| 1.2 疗效评价 | 第40-42页 |
| 2. 益生菌药品检验 | 第42-43页 |
| 3. 测序前质控 | 第43-44页 |
| 4. 16S rDNA 测序三联组肠道菌群 | 第44-61页 |
| 4.1 测序数据处理 | 第44页 |
| 4.2 样品复杂度分析（α-diversity） | 第44-47页 |
| 4.3 OTUs 分析及物种注释 | 第47-56页 |
| 4.4 物种丰度聚类 | 第56-57页 |
| 4.5 所有样品的物种分类 | 第57-58页 |
| 4.6 多样品比较分析 | 第58-61页 |
| 5. 16S rDNA 测序益生菌组肠道菌群 | 第61-74页 |
| 5.1 测序数据处理 | 第61页 |
| 5.2 样品复杂度分析 | 第61-63页 |
| 5.3 OTU 分析及物种注释 | 第63-71页 |
| 5.4 物种丰度聚类 | 第71页 |
| 5.5 所有样品的物种分类 | 第71-72页 |
| 5.6 多样品比较分析（β-diversity） | 第72-74页 |
| 6. 两种疗法的肠道菌群比较 | 第74-77页 |
| 6.1 在菌群丰度上的比较 | 第75页 |
| 6.2 门水平上的比较 | 第75-76页 |
| 6.3 属水平上的比较 | 第76-77页 |
| 三、讨论 | 第77-88页 |
| 1. 临床指标研究评价 | 第77-81页 |
| 1.1 抗 H.pylori 的治疗讨论 | 第77页 |
| 1.2 联合益生菌疗法的临床效果 | 第77-80页 |
| 1.3 胃液 pH 的变化 | 第80-81页 |
| 2. 肠道菌群多样性探讨 | 第81-88页 |
| 2.1 肠道菌群影响因素 | 第81-82页 |
| 2.2 三联抗 H.pylori 疗法对肠道菌群的影响研究 | 第82-85页 |
| 2.3 联合益生菌的抗 H.pylori 治疗对肠道菌群的影响 | 第85-88页 |
| 四、结论 | 第88-90页 |
| 1. 临床部分结论 | 第88页 |
| 2. 肠道菌群部分结论 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-99页 |
| 文献综述 | 第99-113页 |
| 参考文献 | 第107-113页 |
| 主要英文缩略词表 | 第113-114页 |
| 学位期间发表文章（第一作者） | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
