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基于转录组测序的翘嘴鳜微卫星标记的开发及MCH class Ⅰ基因的克隆表达

摘要第4-6页
abstract第6-8页
引言第11-13页
文献综述第13-22页
    1 翘嘴鳜研究现状第13-14页
        1.1 国内外对翘嘴鳜的基础生物学研究第13页
        1.2 翘嘴鳜分子生物学研究第13-14页
    2 微卫星分子标记及Illumina/Solexa转录组测序第14-17页
        2.1 微卫星分子标记第14-15页
        2.2 Illumina/Solexa转录组测序第15-17页
    3 MHC基因的研究现状第17-20页
        3.1 鱼类MHC基因的结构和功能第18-19页
        3.2 鱼类MHC class I基因的研究第19-20页
    4 本课题的选题依据和研究意义第20-22页
试验一 基于转录组测序信息的翘嘴鳜SSR标记开发、验证第22-39页
    1 材料与方法第23-25页
        1.1 材料来源第23页
        1.2 试验方法第23-25页
    2 结果与分析第25-35页
        2.1.转录本序列功能注释第25-27页
        2.2 翘嘴鳜转录组中EST-SSR的分布及频率第27-29页
        2.3 翘嘴鳜转录组EST-SSR引物扩增产物的多态性检测第29-30页
        2.4 翘嘴鳜4个养殖群体遗传多样性检测第30-34页
        2.5 群体间遗传相似度和遗传距离第34-35页
    3 讨论第35-38页
        3.1 Illumina高通量测序和转录组装第35-36页
        3.2 利用转录组测序技术开发翘嘴鳜微卫星标记第36-37页
        3.3 翘嘴鳜转录组EST-SSR的分布和频率第37页
        3.4 翘嘴鳜4个养殖群体的遗传多样性检测第37-38页
    4 小结第38-39页
试验二 基于EST-SSR标记的翘嘴鳜生长性状相关分析第39-45页
    1 材料与方法第40页
        1.1 材料来源第40页
        1.2 EST-SSR引物第40页
        1.3 试验方法第40页
    2 结果与分析第40-43页
        2.1 表型性状的分布检测第40-41页
        2.2 生长性状显著相关位点、基因型的分析第41-43页
    3 讨论第43-44页
        3.1 微卫星标记与生长性状的关联分析第43-44页
    4 小结第44-45页
试验三 翘嘴鳜MHC class I基因克隆及表达分析第45-60页
    1 材料与方法第45-50页
        1.1 材料来源第45-46页
        1.2 试验方法第46-50页
    2 结果与分析第50-58页
        2.1 翘嘴鳜MHC class I基因的RACE结果及cDNA全长序列第50-51页
        2.2 翘嘴鳜MHC class I基因与其他物种的同源序列比对及系统进化树分析第51-55页
        2.3 翘嘴鳜MHC class I基因编码蛋白的生物信息学分析第55-57页
        2.4 翘嘴鳜MHC class I基因在不同组织的表达分布第57-58页
    3 讨论第58页
        3.1 翘嘴鳜MHC class I基因序列特征及与其他物种同源性第58页
        3.2 翘嘴鳜MHC class I基因在不同组织中的表达第58页
    4 小结第58-60页
结论第60-62页
参考文献第62-73页
攻读学位期间公开发表的论文第73-74页
致谢第74-75页

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