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基于转录组学的油菜镉胁迫响应机制研究

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
第1章 文献综述第13-25页
    1.1 植物对镉的吸收、运输和积累第13-16页
        1.1.1 植物对镉的吸收和外排第14页
        1.1.2 植物对镉的运输第14-15页
        1.1.3 植物对镉的积累第15-16页
    1.2 镉对植物的毒害效应第16-19页
        1.2.1 镉对植株生长发育的影响第17页
        1.2.2 镉对植物必需元素代谢的影响第17-18页
        1.2.3 镉对植物细胞的影响第18-19页
    1.3 植物对镉的响应机制第19-21页
        1.3.1 细胞壁固定化第19-20页
        1.3.2 螯合解毒及液泡区隔第20页
        1.3.3 抗氧化胁迫第20-21页
        1.3.4 外排与再分配第21页
    1.4 植物修复与镉超积累植物第21-22页
        1.4.1 植物修复技术第21-22页
        1.4.2 镉超积累植物第22页
    1.5 转录组学及其在植物研究中的应用第22-25页
        1.5.1 转录组学及RNA-Seq第22-23页
        1.5.2 转录组学在植物响应非生物胁迫研究中的应用第23-25页
第2章 引言第25-27页
    2.1 研究目的和意义第25-26页
    2.2 研究内容第26页
    2.3 技术路线第26-27页
第3章 材料与方法第27-35页
    3.1 实验材料第27页
        3.1.1 供试土壤第27页
        3.1.2 供试油菜第27页
    3.2 油菜镉处理与样品采集第27-28页
        3.2.1 油菜盆栽试验与镉处理第27页
        3.2.2 样品采集与生理指标测定第27-28页
    3.3 金属元素及脂肪酸组成测定第28页
        3.3.1 镉及矿质元素测定第28页
        3.3.2 脂肪酸组成测定第28页
    3.4 油菜总RNA提取第28-30页
        3.4.1 总RNA提取样品第28页
        3.4.2 总RNA提取试剂盒及实验器材第28-29页
        3.4.3 总RNA提取流程第29-30页
    3.5 RNA质量检测第30-31页
        3.5.1 RNA吸光度检测第30-31页
        3.5.2 RNA电泳检测第31页
    3.6 qRT-PCR第31-33页
        3.6.1 实验器材及试剂第31页
        3.6.2 去除基因组DNA反应第31-32页
        3.6.3 反转录反应第32页
        3.6.4 Real Time PCR第32-33页
    3.7 转录组测序及数据分析第33-35页
        3.7.1 转录组测序第33页
        3.7.2 转录组测序结果及生物信息学分析第33-35页
第4章 结果与分析第35-63页
    4.1 镉胁迫对油菜生长及生物量的影响第35-37页
        4.1.1 镉胁迫对株高和有效分枝数的影响第35页
        4.1.2 镉胁迫对生物量的影响第35-36页
        4.1.3 镉胁迫对光合作用的影响第36-37页
    4.2 油菜对镉的积累特征第37-40页
        4.2.1 油菜各组织镉含量第37-39页
        4.2.2 油菜对镉的生物累积量第39-40页
    4.3 镉对油菜籽粒的影响第40-42页
        4.3.1 油菜籽粒镉含量第40-41页
        4.3.2 镉对油菜籽粒脂肪酸组成的影响第41-42页
    4.4 镉胁迫对油菜矿质元素含量的影响第42-49页
        4.4.1 镉对油菜钙含量的影响第42-43页
        4.4.2 镉对油菜镁含量的影响第43-45页
        4.4.3 镉对油菜铁含量的影响第45-46页
        4.4.4 镉对油菜锰含量的影响第46-47页
        4.4.5 镉对油菜锌含量的影响第47-48页
        4.4.6 镉对油菜铜含量的影响第48-49页
    4.5 镉转运相关蛋白的表达情况第49-54页
        4.5.1 候选基因确定与引物设计第50页
        4.5.2 内参基因第50-51页
        4.5.3 ABCC家族表达情况第51页
        4.5.4 CET家族表达情况第51-53页
        4.5.5 HMA家族表达情况第53-54页
        4.5.6 NRAMP家族表达情况第54页
    4.6 甘蓝型油菜镉胁迫转录组分析第54-63页
        4.6.1 测序质量分析第55-56页
        4.6.2 油菜叶片镉胁迫响应基因鉴定第56页
        4.6.3 差异表达基因的GO富集分析第56-60页
        4.6.4 差异表达基因的KEEG代谢途径分析第60-61页
        4.6.5 金属离子转运蛋白基因的筛选第61-62页
        4.6.6 差异表达基因的qRT-PCR验证第62-63页
第5章 结论与展望第63-65页
    5.1 结论第63-64页
    5.2 展望第64-65页
参考文献第65-75页
致谢第75-77页
发表学术论文第77页

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