中文摘要 | 第5-9页 |
ABSTRACT | 第9-13页 |
第一章 蜘蛛毒腺转录组的研究进展 | 第18-37页 |
1.1 转录组与转录组学 | 第18页 |
1.2 测序技术的发展 | 第18-25页 |
1.2.1 传统测序方法:第一代DNA测序技术 | 第18-20页 |
1.2.2 高通量测序技术 | 第20-25页 |
1.3 蜘蛛毒腺转录组的研究现状 | 第25-32页 |
1.3.1 特异性cDNA测序获取蜘蛛毒素全长序列 | 第26-27页 |
1.3.2 EST测序获取蜘蛛毒素序列 | 第27-28页 |
1.3.3 454测序获取蜘蛛毒素序列 | 第28-32页 |
1.3.4 Illumina测序获取蜘蛛毒素序列 | 第32页 |
1.4 蜘蛛毒腺转录组中其它成分 | 第32-33页 |
1.5 蜘蛛毒腺转录组与其它方法整合 | 第33-37页 |
第二章 虎纹捕鸟蛛毒素组学及功能多样性分析 | 第37-64页 |
2.1 前言 | 第37-38页 |
2.2 材料、试剂和仪器 | 第38-39页 |
2.2.1 实验材料与试剂 | 第38页 |
2.2.2 实验仪器 | 第38-39页 |
2.3 实验方法 | 第39-43页 |
2.3.1 分离蜘蛛的毒腺和总RNA的提取 | 第39页 |
2.3.2 m RNA的纯化 | 第39-40页 |
2.3.3 454转录组文库的构建与测序 | 第40-42页 |
2.3.4 数据处理 | 第42-43页 |
2.4 结果 | 第43-58页 |
2.4.1 高质量RNA的提取和454转录组文库的高效构建 | 第43页 |
2.4.2 454 测序和序列拼接 | 第43-44页 |
2.4.3 序列分类 | 第44-45页 |
2.4.4 功能注释 | 第45-47页 |
2.4.5 蜘蛛毒素转录子分析 | 第47-50页 |
2.4.6 毒素前体分类 | 第50-57页 |
2.4.7 毒素I、II、XVIII超家族不同的进化策略 | 第57-58页 |
2.5 讨论 | 第58-64页 |
第三章 海南捕鸟蛛毒素组学研究 | 第64-91页 |
3.1 前言 | 第64-65页 |
3.2 材料与方法 | 第65-66页 |
3.2.1 实验材料 | 第65页 |
3.2.2 实验仪器 | 第65-66页 |
3.3 实验方法 | 第66-69页 |
3.3.1 分离蜘蛛的毒腺和总RNA的提取 | 第66页 |
3.3.2 m RNA纯化 | 第66页 |
3.3.3 454转录组文库的构建与测序 | 第66页 |
3.3.4 数据处理 | 第66页 |
3.3.5 海南捕鸟蛛毒素的分离纯化 | 第66-67页 |
3.3.6 MALDI-TOF质谱分析 | 第67页 |
3.3.7 生理活性和药理特征测定 | 第67-69页 |
3.4 结果 | 第69-85页 |
3.4.1 高质量RNA的提取和454转录组文库的高效构建 | 第69页 |
3.4.2 454 测序和序列拼接 | 第69-70页 |
3.4.3 序列分类 | 第70-71页 |
3.4.4 功能注释 | 第71-73页 |
3.4.5 蜘蛛毒素转录子的分类 | 第73-79页 |
3.4.6 不同Class中毒素的丰度 | 第79-81页 |
3.4.7 毒素前体突变体 | 第81-82页 |
3.4.8 多肽毒素的修饰和加工 | 第82-83页 |
3.4.9 蜘蛛毒素功能多样性分析 | 第83-85页 |
3.5 讨论 | 第85-91页 |
第四章 两种捕鸟蛛粗毒对心肌细胞电生理影响 | 第91-109页 |
4.1 前言 | 第91页 |
4.2 材料 | 第91-93页 |
4.2.1 动物 | 第91-92页 |
4.2.2 溶液的配制 | 第92页 |
4.2.3 实验仪器 | 第92-93页 |
4.3 方法 | 第93-96页 |
4.3.1 乳鼠心肌细胞的提取 | 第93-94页 |
4.3.2 膜片钳检测 | 第94-96页 |
4.3.3 数据处理 | 第96页 |
4.4 结果 | 第96-107页 |
4.4.1 两种蜘蛛粗毒对乳鼠心肌细胞动作电位时程的影响 | 第96-97页 |
4.4.2 蜘蛛粗毒对INa的影响 | 第97-99页 |
4.4.3 蜘蛛粗毒对心肌钾电流的影响 | 第99-106页 |
4.4.4 蜘蛛粗毒对心肌钙离子通道的影响 | 第106-107页 |
4.5 讨论 | 第107-109页 |
第五章 海南捕鸟蛛和虎纹捕鸟蛛毒素序列比较分析 | 第109-123页 |
5.1 前言 | 第109-110页 |
5.2 海南捕鸟蛛和虎纹捕鸟蛛毒素序列的比较 | 第110-121页 |
5.2.1 海南捕鸟蛛和虎纹捕鸟蛛毒素序列分析 | 第110-116页 |
5.2.2 海南捕鸟蛛和虎纹捕鸟蛛毒素半胱氨酸框架分析 | 第116-121页 |
5.2.3 海南捕鸟蛛和虎纹捕鸟蛛毒素进化分析 | 第121页 |
5.3 讨论 | 第121-123页 |
进一步研究设想 | 第123-124页 |
参考文献 | 第124-135页 |
攻读博士学位期间发表的论文目录 | 第135-137页 |
缩写表 | 第137-138页 |
致谢 | 第138页 |