| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第13-20页 |
| 1.1 DNA序列k-mer研究现状 | 第13-15页 |
| 1.1.1 DNA序列k-mer分析 | 第13页 |
| 1.1.2 k-mer多峰分布 | 第13-14页 |
| 1.1.3 研究背景 | 第14-15页 |
| 1.2 核小体研究现状 | 第15-17页 |
| 1.2.1 核小体结构 | 第15-16页 |
| 1.2.2 核小体定位(Nucleosome positioning) | 第16-17页 |
| 1.3 CpG岛 | 第17-18页 |
| 1.4 章节安排 | 第18-20页 |
| 第二章 研究的理论基础 | 第20-25页 |
| 2.1 人类DNA序列8-mer的三峰分布 | 第20-22页 |
| 2.2 XY分类及结论 | 第22-23页 |
| 2.3 三个理论猜想 | 第23页 |
| 2.4 本文研究问题 | 第23-25页 |
| 第三章 酵母全基因组8-mer相对模体数随频次分布 | 第25-39页 |
| 3.1 数据与方法 | 第25-26页 |
| 3.1.1 数据集 | 第25页 |
| 3.1.2 k-mer相对模体数随频次分布 | 第25-26页 |
| 3.1.3 k-mer中m-mer的相对频率 | 第26页 |
| 3.2 8-mer相对模体数随频次分布 | 第26-28页 |
| 3.3 8-mer集合的XY二核苷分类 | 第28-31页 |
| 3.4 XY分类中m-mer使用比较 | 第31-38页 |
| 3.5 小结 | 第38-39页 |
| 第四章 基于新对称相对熵分析m-mer使用差异 | 第39-42页 |
| 4.1 新对称相对熵定义 | 第39页 |
| 4.2 m-mer使用差异 | 第39-41页 |
| 4.3 小结 | 第41-42页 |
| 第五章 基于其它方法分析m-mer使用差异 | 第42-47页 |
| 5.1 距离差和弧度差定义 | 第42-43页 |
| 5.2 距离差分析 | 第43-44页 |
| 5.3 弧度差分析 | 第44-46页 |
| 5.4 小结 | 第46-47页 |
| 第六章 总结与展望 | 第47-50页 |
| 6.1 全文工作总结 | 第47-48页 |
| 6.2 工作展望 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 攻读硕士期间完成的学术论文 | 第56页 |