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基于SVM的跨膜蛋白结构预测应用研究

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 绪论第11-18页
   ·引言第11-12页
   ·背景及意义第12-15页
   ·本文的主要工作及创新第15-16页
   ·本文的内容安排第16-18页
第二章 支持向量机第18-26页
   ·SVM 的理论基础第18页
   ·SVM 的基本思想第18-24页
     ·线性可分的情况第18-22页
     ·线性不可分的情况第22-23页
     ·核函数第23-24页
   ·SVM 方法的特点第24页
   ·SVM 解决实际问题的基本步骤第24-26页
第三章 国内外研究现状及分类算法第26-37页
   ·膜蛋白序列的特征提取算法第27-32页
     ·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法第28-29页
       ·氨基酸组分(Amino Acid Composition: ACC)第28页
       ·熵密度(Entropy Density Profile: EDP)第28-29页
       ·残基耦联模型(Residue Couple Model: RCM)第29页
     ·基于氨基酸物理和化学特性的特征提取方法第29-32页
       ·自相关函数第30页
       ·伪氨基酸组成(Pseudo Amino Acid Composition: PseAA)第30页
       ·Zp 曲线和Zp 参数第30-31页
       ·疏水模式组成(Hydrophobic Pattern: HP)第31-32页
       ·类序列顺序作用(Quasi Sequence Order Effect: QSOE)第32页
     ·基于数据库信息挖掘的特征提取方法第32页
   ·膜蛋白分类算法第32-33页
     ·基于机器学习的算法第32-33页
   ·模型的构建第33-37页
     ·数据集的构建第33页
     ·模型的检验第33-34页
     ·模型的评估第34-37页
第四章 跨膜蛋白预测第37-56页
   ·β桶状跨膜蛋白预测第37-43页
     ·引言第37页
     ·数据和方法第37-40页
       ·数据集第37-38页
       ·SVM 的分类方法第38-39页
       ·基于氨基酸组成位置和物理化学特性的特征第39-40页
     ·结果与讨论第40-42页
       ·检验标准第40-41页
       ·结果第41-42页
     ·结论第42-43页
   ·α螺旋跨膜蛋白预测第43-49页
     ·引言第43页
     ·数据集第43-44页
     ·方法第44-45页
       ·SVM 分类方法第44页
       ·基于氨基酸组成位置和物理化学特性的特征第44-45页
     ·结果与讨论第45-49页
       ·检验标准第45页
       ·结果第45-49页
     ·结论第49页
   ·内在膜蛋白预测第49-56页
     ·引言第49页
     ·数据集第49-50页
     ·方法第50-52页
       ·SVM 分类方法第50页
       ·特征提取第50-52页
         ·基于氨基酸组分和氨基酸残基指数的特征第50-51页
         ·基于位置权重的氨基酸组分和氨基酸残基指数的特征第51-52页
     ·结果与讨论第52-54页
       ·检验标准第52页
       ·结果第52-54页
     ·结论第54-56页
第五章 总结与展望第56-60页
   ·工作总结第56-58页
   ·工作展望第58-60页
参考文献第60-66页
攻读学位期间公开发表的论文第66-67页
致谢第67-68页

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