摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-11页 |
第一章 绪论 | 第11-18页 |
·引言 | 第11-12页 |
·背景及意义 | 第12-15页 |
·本文的主要工作及创新 | 第15-16页 |
·本文的内容安排 | 第16-18页 |
第二章 支持向量机 | 第18-26页 |
·SVM 的理论基础 | 第18页 |
·SVM 的基本思想 | 第18-24页 |
·线性可分的情况 | 第18-22页 |
·线性不可分的情况 | 第22-23页 |
·核函数 | 第23-24页 |
·SVM 方法的特点 | 第24页 |
·SVM 解决实际问题的基本步骤 | 第24-26页 |
第三章 国内外研究现状及分类算法 | 第26-37页 |
·膜蛋白序列的特征提取算法 | 第27-32页 |
·基于氨基酸组成和位置的特征提取方法 | 第28-29页 |
·氨基酸组分(Amino Acid Composition: ACC) | 第28页 |
·熵密度(Entropy Density Profile: EDP) | 第28-29页 |
·残基耦联模型(Residue Couple Model: RCM) | 第29页 |
·基于氨基酸物理和化学特性的特征提取方法 | 第29-32页 |
·自相关函数 | 第30页 |
·伪氨基酸组成(Pseudo Amino Acid Composition: PseAA) | 第30页 |
·Zp 曲线和Zp 参数 | 第30-31页 |
·疏水模式组成(Hydrophobic Pattern: HP) | 第31-32页 |
·类序列顺序作用(Quasi Sequence Order Effect: QSOE) | 第32页 |
·基于数据库信息挖掘的特征提取方法 | 第32页 |
·膜蛋白分类算法 | 第32-33页 |
·基于机器学习的算法 | 第32-33页 |
·模型的构建 | 第33-37页 |
·数据集的构建 | 第33页 |
·模型的检验 | 第33-34页 |
·模型的评估 | 第34-37页 |
第四章 跨膜蛋白预测 | 第37-56页 |
·β桶状跨膜蛋白预测 | 第37-43页 |
·引言 | 第37页 |
·数据和方法 | 第37-40页 |
·数据集 | 第37-38页 |
·SVM 的分类方法 | 第38-39页 |
·基于氨基酸组成位置和物理化学特性的特征 | 第39-40页 |
·结果与讨论 | 第40-42页 |
·检验标准 | 第40-41页 |
·结果 | 第41-42页 |
·结论 | 第42-43页 |
·α螺旋跨膜蛋白预测 | 第43-49页 |
·引言 | 第43页 |
·数据集 | 第43-44页 |
·方法 | 第44-45页 |
·SVM 分类方法 | 第44页 |
·基于氨基酸组成位置和物理化学特性的特征 | 第44-45页 |
·结果与讨论 | 第45-49页 |
·检验标准 | 第45页 |
·结果 | 第45-49页 |
·结论 | 第49页 |
·内在膜蛋白预测 | 第49-56页 |
·引言 | 第49页 |
·数据集 | 第49-50页 |
·方法 | 第50-52页 |
·SVM 分类方法 | 第50页 |
·特征提取 | 第50-52页 |
·基于氨基酸组分和氨基酸残基指数的特征 | 第50-51页 |
·基于位置权重的氨基酸组分和氨基酸残基指数的特征 | 第51-52页 |
·结果与讨论 | 第52-54页 |
·检验标准 | 第52页 |
·结果 | 第52-54页 |
·结论 | 第54-56页 |
第五章 总结与展望 | 第56-60页 |
·工作总结 | 第56-58页 |
·工作展望 | 第58-60页 |
参考文献 | 第60-66页 |
攻读学位期间公开发表的论文 | 第66-67页 |
致谢 | 第67-68页 |