整合氨基酸与转录组数据的代谢网络模型分析与应用
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 课题研究背景 | 第10-11页 |
| 1.2 课题研究意义 | 第11页 |
| 1.3 课题研究思路和方法 | 第11-13页 |
| 1.3.1 全基因组规模代谢网络构建 | 第11-12页 |
| 1.3.2 模型分析方法 | 第12-13页 |
| 1.4 论文主要创新 | 第13-14页 |
| 1.5 论文组织结构 | 第14-16页 |
| 第二章 构建全基因组规模代谢网络模型 | 第16-21页 |
| 2.1 构建代谢网络模型的参考数据库 | 第16-17页 |
| 2.2 基于RAVEN的代谢网络模型半自动化构建 | 第17-18页 |
| 2.3 代谢网络模型的修饰 | 第18-19页 |
| 2.4 代谢网络模型转化为数学模型 | 第19页 |
| 2.5 指状青霉代谢网络模型 | 第19-20页 |
| 2.6 本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 整合外部环境变量的动态流平衡分析 | 第21-36页 |
| 3.0 COBRA工具箱 | 第21-22页 |
| 3.1 流平衡分析法 | 第22-25页 |
| 3.2 算法设计与实现 | 第25-27页 |
| 3.3 实验结果分析 | 第27-34页 |
| 3.3.1 实验数据 | 第27-28页 |
| 3.3.2 实验结果分析 | 第28-34页 |
| 3.4 软件支持 | 第34-35页 |
| 3.5 本章小结 | 第35-36页 |
| 第四章 整合氨基酸多态性的代谢网络模型 | 第36-45页 |
| 4.1 氨基酸多态性 | 第37页 |
| 4.2 算法设计与实现 | 第37-40页 |
| 4.3 实验结果分析 | 第40-42页 |
| 4.4 软件支持 | 第42-44页 |
| 4.5 本章小结 | 第44-45页 |
| 第五章 整合转录组测序数据与代谢网络预测基因 | 第45-56页 |
| 5.1 整合转录组测序数据与代谢网络的预测模型 | 第45-46页 |
| 5.2 算法设计与实现 | 第46-50页 |
| 5.3 实验结果分析 | 第50-54页 |
| 5.4 本章小结 | 第54-56页 |
| 第六章 总结与展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
