| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第1章 引言 | 第8-14页 |
| 1.1 龙骨蛏蚌简介 | 第8-9页 |
| 1.2 转录组测序研究概况 | 第9-10页 |
| 1.3 微卫星标记的简介 | 第10-11页 |
| 1.4 种群遗传学研究 | 第11-12页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第12-14页 |
| 第2章 龙骨蛏蚌高通量转录组测序及特征分析 | 第14-28页 |
| 2.1 材料与方法 | 第14-16页 |
| 2.1.1 标本采集、鉴定和保存 | 第14页 |
| 2.1.2 RNA提取和文库构建 | 第14-16页 |
| 2.1.3 功能基因注释和分类 | 第16页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第16-28页 |
| 2.2.1 样本性别 | 第16页 |
| 2.2.2 转录组测序原始数据统计 | 第16-17页 |
| 2.2.3 转录本拼接结果 | 第17-18页 |
| 2.2.4 基因注释结果 | 第18-19页 |
| 2.2.5 GO分类 | 第19页 |
| 2.2.6 龙骨蛏蚌KOG注释及KEGG代谢通路分析 | 第19-28页 |
| 第3章 基于转录组信息龙骨蛏蚌微卫星标记的快速开发与评价 | 第28-44页 |
| 3.1 实验材料 | 第28-30页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 3.1.2 实验仪器和试剂 | 第29-30页 |
| 3.2 实验方法 | 第30-33页 |
| 3.2.1 龙骨蛏蚌基因组DNA提取和检测 | 第30页 |
| 3.2.2 龙骨蛏蚌微卫星引物的设计与合成 | 第30页 |
| 3.2.3 龙骨蛏蚌微卫星引物的初步筛选及最适退火温度的确定 | 第30-32页 |
| 3.2.4 龙骨蛏蚌微卫星引物的再次筛选 | 第32-33页 |
| 3.2.5 龙骨蛏蚌多态性微卫星标记的评价 | 第33页 |
| 3.3 龙骨蛏蚌微卫星标记开发的实验结果 | 第33-42页 |
| 3.3.1 龙骨蛏蚌转录组微卫星序列 | 第33-36页 |
| 3.3.2 龙骨蛏蚌微卫星引物的初步筛选 | 第36页 |
| 3.3.3 龙骨蛏蚌微卫星引物多态性筛选 | 第36-42页 |
| 3.4 讨论 | 第42-44页 |
| 第4章 龙骨蛏蚌野生种群遗传结构及遗传多样性分析 | 第44-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 4.1.1 样本采集 | 第44页 |
| 4.1.2 实验仪器和试剂 | 第44-45页 |
| 4.1.3 龙骨蛏蚌基因组DNA的提取 | 第45页 |
| 4.1.4.龙骨蛏蚌微卫星PCR产物的扩增和筛选 | 第45页 |
| 4.1.5 数据处理 | 第45页 |
| 4.2 结果与分析 | 第45-52页 |
| 4.2.1 基于微卫星标记不同地理种群的遗传多样性分析 | 第45-48页 |
| 4.2.2 基于微卫星标记龙骨蛏蚌遗传结构的分析 | 第48-51页 |
| 4.2.3 分子方差分析 | 第51-52页 |
| 4.2.4 龙骨蛏蚌群体遗传分化 | 第52页 |
| 4.3 讨论 | 第52-55页 |
| 第5章 小结 | 第55-57页 |
| 5.1 主要结论 | 第55页 |
| 5.2 研究展望 | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
