| 致谢 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩写表 | 第15-22页 |
| 1 绪论 | 第22-38页 |
| 1.1 逆境胁迫对植物生理的影响 | 第22-26页 |
| 1.1.1 植物逆境胁迫 | 第23-24页 |
| 1.1.2 植物逆境抗性 | 第24-25页 |
| 1.1.3 紫外光B对植物生理的影响 | 第25-26页 |
| 1.2 药用植物的研究 | 第26-32页 |
| 1.2.1 药用植物研究现状 | 第26-27页 |
| 1.2.2 转录组学在药用植物次生代谢研究中的应用 | 第27-29页 |
| 1.2.3 代谢组学在药用植物次生代谢研究中的应用 | 第29-31页 |
| 1.2.4 蛋白质组学药用植物次生代谢研究中的应用 | 第31-32页 |
| 1.3 香豆素研究进展 | 第32-34页 |
| 1.3.1 香豆素药理活性研究 | 第32-33页 |
| 1.3.2 香豆素生物合成研究进展 | 第33-34页 |
| 1.4 圆锥铁线莲介绍 | 第34-35页 |
| 1.5 本文的研究内容与意义 | 第35-38页 |
| 2 圆锥铁线莲叶片响应光酶诱导的代谢组学分析 | 第38-60页 |
| 2.1 引言 | 第38-39页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第39-45页 |
| 2.2.1 植物材料来源 | 第39页 |
| 2.2.2 实验试剂及耗材 | 第39-40页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第40页 |
| 2.2.4 实验过程 | 第40-45页 |
| 2.2.4.1 标准品配制 | 第40页 |
| 2.2.4.2 圆锥铁线莲叶片代谢物的提取 | 第40-41页 |
| 2.2.4.3 用于GC-MS分析的样品处理方法 | 第41-42页 |
| 2.2.4.4 预实验部分 | 第42页 |
| 2.2.4.5 数据处理 | 第42-43页 |
| 2.2.4.6 正交偏最小二乘法-判别分析 | 第43页 |
| 2.2.4.7 UPLC-MSMS分析的样品代谢物提取方法 | 第43-44页 |
| 2.2.4.8 UPLC-MSMS分析 | 第44-45页 |
| 2.3 实验结果 | 第45-56页 |
| 2.3.1 Target化合物定性结果 | 第45-48页 |
| 2.3.2 GC-MS预实验结果 | 第48页 |
| 2.3.3 模型建立及多变量分析 | 第48-49页 |
| 2.3.4 UV-B诱导及黑暗胁迫对圆锥铁线莲叶片初生代谢途径的影响 | 第49-50页 |
| 2.3.5 UV-B诱导前后圆锥铁线莲叶片代谢物变化分布分析 | 第50-51页 |
| 2.3.6 UV-B诱导前后圆锥铁线莲叶片代谢物变化的聚类分析 | 第51-56页 |
| 2.4 讨论 | 第56-58页 |
| 2.4.1 UV-B诱导增强了圆锥铁线莲的逆境防御能力 | 第56页 |
| 2.4.2 UV-B诱导及黑暗培养诱导了香豆素的特异合成 | 第56-58页 |
| 2.5 本章小结 | 第58-60页 |
| 3 圆锥铁线莲叶片响应光酶诱导的转录组学分析 | 第60-74页 |
| 3.1 引言 | 第60-61页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第61-64页 |
| 3.2.1 植物材料来源 | 第61页 |
| 3.2.2 实验试剂及耗材 | 第61页 |
| 3.2.3 实验仪器 | 第61-62页 |
| 3.2.4 实验过程 | 第62-64页 |
| 3.2.4.1 RNA提取及文库构建 | 第62页 |
| 3.2.4.2 文库构建及上机测试 | 第62页 |
| 3.2.4.3 数据处理与分析 | 第62-64页 |
| 3.3 实验结果 | 第64-71页 |
| 3.3.1 转录组测序及数据处理 | 第64页 |
| 3.3.2 De novo拼接与功能注释 | 第64-69页 |
| 3.3.3 差异表达酶的聚类分析 | 第69页 |
| 3.3.4 圆锥铁线莲次生代谢途径分析 | 第69-71页 |
| 3.4 讨论 | 第71-73页 |
| 3.5 本章小结 | 第73-74页 |
| 4 基于组学的圆锥铁线莲叶片响应光酶诱导的系统性研究 | 第74-96页 |
| 4.1 引言 | 第74页 |
| 4.2 实验材料与方法 | 第74-79页 |
| 4.2.1 植物材料来源 | 第74-75页 |
| 4.2.2 实验试剂及耗材 | 第75页 |
| 4.2.3 实验仪器 | 第75页 |
| 4.2.4 实验过程 | 第75-79页 |
| 4.2.4.1 叶片蛋白的提取 | 第75-76页 |
| 4.2.4.2 圆锥铁线莲叶片总蛋白纯化、酶解和质谱分析 | 第76页 |
| 4.2.4.3 叶片总蛋白鉴定和分析 | 第76-77页 |
| 4.2.4.4 转录组数据处理 | 第77页 |
| 4.2.4.5 代谢组数据处理 | 第77页 |
| 4.2.4.6 清除自由基活性试验 | 第77-78页 |
| 4.2.4.7 γ-氨基丁酸含量检测 | 第78页 |
| 4.2.4.8 酶学活性试验 | 第78-79页 |
| 4.3 实验结果 | 第79-91页 |
| 4.3.1 蛋白质与代谢的整合 | 第79-86页 |
| 4.3.1.1 UV-B诱导及黑暗培养对圆锥铁线莲叶片代谢物的影响 | 第79-80页 |
| 4.3.1.2 UV-B诱导及黑暗培养对圆锥铁线莲叶片蛋白质的影响 | 第80-81页 |
| 4.3.1.3 代谢组学与蛋白质组学的整合分析 | 第81-82页 |
| 4.3.1.4 共同变化蛋白质的聚类和功能分析 | 第82-86页 |
| 4.3.2 蛋白质与转录的整合 | 第86-91页 |
| 4.3.2.1 差异表达基因的功能分布分析 | 第86-88页 |
| 4.3.2.2 UV-B诱导及黑暗培养对圆锥铁线莲叶片三羧酸循环的影响 | 第88-90页 |
| 4.3.2.3 UV-B诱导及黑暗培养对圆锥铁线莲叶片抗氧化活性的影响 | 第90-91页 |
| 4.4 讨论 | 第91-94页 |
| 4.4.1 UV-B诱导和黑暗胁迫增强了圆锥铁线莲叶片氨基酸代谢作用 | 第91-92页 |
| 4.4.2 UV-B诱导和黑暗胁迫增强了圆锥铁线莲叶片自由基清除能力 | 第92-93页 |
| 4.4.3 UV-B诱导和黑暗胁迫增强了圆锥铁线莲叶片的次生代谢能力 | 第93页 |
| 4.4.4 UV-B诱导和黑暗培养激活了圆锥铁线莲叶片的三羧酸循环途径 | 第93-94页 |
| 4.5 本章小结 | 第94-96页 |
| 5 香豆素合成机制研究 | 第96-116页 |
| 5.1 引言 | 第96-97页 |
| 5.2 实验材料与方法 | 第97-101页 |
| 5.2.1 植物材料来源 | 第97页 |
| 5.2.2 实验试剂及耗材 | 第97页 |
| 5.2.3 实验仪器 | 第97-98页 |
| 5.2.4 实验过程 | 第98-101页 |
| 5.2.4.1 试剂的配制 | 第98页 |
| 5.2.4.2 数据获取 | 第98页 |
| 5.2.4.3 酶学活性实验 | 第98-99页 |
| 5.2.4.4 化合物的NMR分析 | 第99页 |
| 5.2.4.5 PPO活性检测分析 | 第99-100页 |
| 5.2.4.6 总黄酮含量的测定 | 第100页 |
| 5.2.4.7 叶片细胞亚显微结构分析 | 第100页 |
| 5.2.4.8 叶片喷施实验 | 第100-101页 |
| 5.2.4.9 实时荧光定量分析 | 第101页 |
| 5.3 实验结果 | 第101-109页 |
| 5.3.1 基于UV-B的诱导胁迫激活了香豆素的特异性合成 | 第101-102页 |
| 5.3.2 PPO催化了由顺式咖啡酸合成七叶亭的过程 | 第102-105页 |
| 5.3.3 体内和体外实验分析香豆素的合成过程 | 第105-107页 |
| 5.3.4 基于UV-B诱导的双重胁迫对黄酮途径的影响 | 第107-108页 |
| 5.3.5 圆锥铁线莲叶片表型的变化 | 第108-109页 |
| 5.4 讨论 | 第109-114页 |
| 5.4.1 香豆素合成途径的预测 | 第110-112页 |
| 5.4.2 ppo是香豆素合成的关键酶 | 第112-114页 |
| 5.5 本章小结 | 第114-116页 |
| 6 圆锥铁线莲叶绿体基因组序列分析 | 第116-136页 |
| 6.1 引言 | 第116页 |
| 6.2 实验材料与方法 | 第116-122页 |
| 6.2.1 植物材料来源 | 第116-117页 |
| 6.2.2 实验试剂与耗材 | 第117页 |
| 6.2.3 实验仪器 | 第117页 |
| 6.2.4 实验过程 | 第117-122页 |
| 6.2.4.1 试剂的配制 | 第117-118页 |
| 6.2.4.2 叶绿体的分离 | 第118-119页 |
| 6.2.4.3 叶绿体DNA的提取 | 第119页 |
| 6.2.4.4 叶绿体测序文库的构建 | 第119页 |
| 6.2.4.5 末端修复 | 第119-120页 |
| 6.2.4.6 3'端加A | 第120页 |
| 6.2.4.7 加接头反应 | 第120-121页 |
| 6.2.4.8 上机测序 | 第121页 |
| 6.2.4.9 叶绿体基因组序列组装及全长序列的获得 | 第121-122页 |
| 6.3 实验结果 | 第122-132页 |
| 6.3.1 叶绿体基因组基本特征 | 第122-124页 |
| 6.3.2 简单序列重复分析 | 第124-128页 |
| 6.3.3 基因的变异分析 | 第128-130页 |
| 6.3.4 IR区边界分析 | 第130页 |
| 6.3.5 系统进化分析 | 第130-132页 |
| 6.4 讨论 | 第132-134页 |
| 6.4.1 叶绿体基因组的组成变异 | 第132-133页 |
| 6.4.2 系统进化关系 | 第133-134页 |
| 6.4.3 叶绿体基因组测定的意义 | 第134页 |
| 6.5 本章小结 | 第134-136页 |
| 7 全文总结与展望 | 第136-140页 |
| 7.1 全文总结 | 第136-138页 |
| 7.2 不足与展望 | 第138-140页 |
| 附表/图 | 第140-162页 |
| 参考文献 | 第162-184页 |
| 作者简介 | 第184-186页 |
