| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-38页 |
| 1. 表观遗传学 | 第14-16页 |
| 1.1 表观遗传学的概念 | 第14-15页 |
| 1.2 表观遗传学调控的研究内容 | 第15-16页 |
| 2. DNA甲基化作用 | 第16-24页 |
| 2.1 DNA甲基化作用的概念 | 第16-17页 |
| 2.2 DNA甲基化分布模式与基因调控 | 第17-20页 |
| 2.3 DNA甲基化水平的常规检测 | 第20-23页 |
| 2.4 DNA甲基化抑制剂 | 第23-24页 |
| 3. DNA C5-胞嘧啶甲基化转移酶(DNA nucleotide methyltransferase,Dnmt) | 第24-30页 |
| 3.1 Dnmts的分子结构 | 第24-25页 |
| 3.2 Dnmts在不同生物中的存在情况 | 第25-27页 |
| 3.3 Dnmts的生物学功能研究 | 第27-30页 |
| 4. 转录组测序(RNA-sequencing)研究基因表达与DNA甲基化的关系 | 第30-32页 |
| 5. 二斑叶螨红色型与绿色型的概述 | 第32-38页 |
| 5.1 二斑叶螨红色型与绿色型的生物学特征 | 第32-33页 |
| 5.2 二斑叶螨红色型与绿色型的危害 | 第33-34页 |
| 5.3 二斑叶螨红色型与绿色型的分类地位的研究 | 第34-38页 |
| 第二章 二斑叶螨中甲基化转移酶3 (Tudnmt3)基因的克隆与基因结构的生物信息学分析 | 第38-52页 |
| 1. 材料与方法 | 第39-45页 |
| 1.1 供试材料的采集与鉴定 | 第39页 |
| 1.2 供试材料的饲养 | 第39-40页 |
| 1.3 供试材料的收集 | 第40页 |
| 1.4 二斑叶螨的甲基化转移酶3(Tudnmt3)基因的克隆 | 第40-44页 |
| 1.5 二斑叶螨的Tudnmt3基因的生物学信息分析 | 第44-45页 |
| 2. 结果与分析 | 第45-50页 |
| 2.1 二斑叶螨RNA质检结果 | 第45-46页 |
| 2.2 二斑叶螨的Tudnmt3基因克隆结果 | 第46页 |
| 2.3 二斑叶螨的Tudnmt3基因初级结构的分析结果 | 第46-48页 |
| 2.4 二斑叶螨的TuDNMT3蛋白二级与三级结构预测结果 | 第48-50页 |
| 3. 讨论 | 第50-52页 |
| 第三章 二斑叶螨的雌雄不同发育时期中甲基化转移酶3 (Tudnmt3)基因的表达量研究 | 第52-82页 |
| 1. 材料与方法 | 第53-65页 |
| 1.1 供试材料 | 第53页 |
| 1.2 供试材料不同发育时期的样品收集 | 第53-54页 |
| 1.3 叶螨总DNA与RNA的提取 | 第54-55页 |
| 1.4 cDNA的合成 | 第55-56页 |
| 1.5 SYBR Green荧光定量PCR检测 | 第56-57页 |
| 1.6 RNA整体原位杂交 | 第57-61页 |
| 1.7 MSAP分析 | 第61-65页 |
| 1.8 数据处理与分析 | 第65页 |
| 2. 结果与分析 | 第65-79页 |
| 2.1 DNA与RNA质检结果 | 第65-66页 |
| 2.2 内参基因的稳定性检测结果 | 第66页 |
| 2.3 标准曲线的制作结果 | 第66-67页 |
| 2.4 二斑叶螨雌雄螨不同发育阶段中Tudnmt3表达量的结果 | 第67-68页 |
| 2.5 二斑叶螨雌雄成螨中Tudnmt3基因原位杂交结果 | 第68-70页 |
| 2.6 二斑叶螨雌雄成螨中DNA甲基化水平与模式的分析结果 | 第70-79页 |
| 3. 讨论 | 第79-82页 |
| 第四章 二斑叶螨雌雄成螨中甲基化转移酶3蛋白(TuDNMT3)的表达水平分析 | 第82-96页 |
| 1. 材料与方法 | 第83-90页 |
| 1.1 供试材料 | 第83页 |
| 1.2 雌雄成螨的收集 | 第83页 |
| 1.3 多肽抗体的合成 | 第83-85页 |
| 1.4 Western blot检测 | 第85-89页 |
| 1.5 免疫荧光检测 | 第89-90页 |
| 1.6 数据处理与分析 | 第90页 |
| 2. 结果与分析 | 第90-94页 |
| 2.1 多克隆抗体效价 | 第90-91页 |
| 2.2 Western blot检测二斑叶螨雌雄成螨中TuDNMT3蛋白的表达量结果 | 第91-92页 |
| 2.3 甲基化转移酶3蛋白在雌雄叶螨体内的分布及定位 | 第92-94页 |
| 3. 讨论 | 第94-96页 |
| 第五章 二斑叶螨红色型与绿色型不同发育时期中甲基化转移酶3(Tudnmt3)基因的表达量研究 | 第96-102页 |
| 1. 材料与方法 | 第97-98页 |
| 1.1 供试材料 | 第97-98页 |
| 1.2 叶螨的收集 | 第98页 |
| 1.3 叶螨总RNA的提取 | 第98页 |
| 1.4 cDNA的合成 | 第98页 |
| 1.5 SYBR Green荧光定量PCR检测 | 第98页 |
| 1.6 相对表达量的数据分析 | 第98页 |
| 2. 结果与分析 | 第98-100页 |
| 2.1 二斑叶螨红色型与绿色型中Tudnmt3扩增片段的结果 | 第98-99页 |
| 2.2 二斑叶螨红色型与绿色型不同发育阶段中Tudnmt3的相对表达量 | 第99-100页 |
| 2.3 二斑叶螨红色型与绿色型不同日龄的成螨中Tudnmt3的相对表达量 | 第100页 |
| 3. 讨论 | 第100-102页 |
| 第六章 二斑叶螨红色型与绿色型差异表达的色素基因与DNA甲基化的关系 | 第102-134页 |
| 1. 材料与方法 | 第104-113页 |
| 1.1 供试材料 | 第104页 |
| 1.2 供试材料的收集 | 第104页 |
| 1.3 叶螨总RNA的提取与质检 | 第104页 |
| 1.4 转录组测序、拼接与注释 | 第104-106页 |
| 1.5 基因的表达量计算及差异分析 | 第106-107页 |
| 1.6 差异表达的功能富集分析 | 第107页 |
| 1.7 参考转录组中色素基因的鉴定 | 第107页 |
| 1.8 转录组数据的qRT-PCR验证 | 第107-110页 |
| 1.9 亚硫酸氢盐PCR检测基因的甲基化水平 | 第110-111页 |
| 1.10 DNA甲基化抑制剂的处理 | 第111-113页 |
| 2. 结果与分析 | 第113-130页 |
| 2.1 二斑叶螨红色型与绿色型总RNA质量检测 | 第113页 |
| 2.2 测序数据质量评估的结果 | 第113-115页 |
| 2.3 转录组数据结果统计 | 第115-116页 |
| 2.4 基因的注释结果 | 第116-118页 |
| 2.5 基因表达水平的分析结果 | 第118-119页 |
| 2.6 二斑叶螨红色型与绿色型中的差异表达基因情况 | 第119-120页 |
| 2.7 差异表达基因的GO富集结果 | 第120-121页 |
| 2.8 侯选的色素基因 | 第121-123页 |
| 2.9 色素基因的定量验证结果 | 第123-124页 |
| 2.10 二斑叶螨红、绿色型体色变化阶段中色素基因表达水平的检测 | 第124-126页 |
| 2.11 差异表达的色素基因的甲基化水平检测 | 第126-129页 |
| 2.12 5-AZA处理后基因表达量变化的结果 | 第129-130页 |
| 3. 讨论 | 第130-134页 |
| 全文总结 | 第134-136页 |
| 参考文献 | 第136-156页 |
| 附录 | 第156-162页 |
| 在读期间论文发表及奖励情况 | 第162-164页 |
| 致谢 | 第164页 |
