| 摘要 | 第9-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 符号与缩略语说明 | 第16-17页 |
| 前言 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-40页 |
| 第一节 二苯醚类化合物概述 | 第18页 |
| 第二节 二苯醚类化合物的应用范围 | 第18-22页 |
| 第三节 二苯醚的微生物降解研究现状 | 第22-23页 |
| 第四节 多溴代二苯醚(PBDEs)的微生物降解现状 | 第23-25页 |
| 第五节 拟除虫菊酯类杀虫剂及其降解中间产物PBA的微生物降解研究现状 | 第25-30页 |
| 第六节 本论文研究目的和意义 | 第30-33页 |
| 参考文献 | 第33-40页 |
| 第二章 2-PBA降解菌株的分离与分类地位研究 | 第40-84页 |
| 第一节 2-PBA降解菌株的分离筛选 | 第40-48页 |
| 1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 1.1 培养基与试剂 | 第40页 |
| 1.2 降解菌株的富集、分离和纯化 | 第40页 |
| 1.3 菌株的形态特征及生理生化鉴定 | 第40页 |
| 1.4 菌株的16S rRNA基因序列分析 | 第40-42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-48页 |
| 2.1 2-PBA高效降解富集液的获得 | 第42-43页 |
| 2.2 2-PBA降解菌株的获得 | 第43-44页 |
| 2.3 菌株SC_3和SC_4的初步鉴定 | 第44-46页 |
| 2.4 SC_3和SC_4对2-PBA的降解情况 | 第46-48页 |
| 第二节 菌株SC_3的分类地位研究 | 第48-64页 |
| 1 材料与方法 | 第48-53页 |
| 1.1 供试菌株 | 第48页 |
| 1.2 培养基和试剂 | 第48-49页 |
| 1.3 菌落形态观察 | 第49页 |
| 1.4 菌株系统进化树分析 | 第49页 |
| 1.5 API系统鉴定分析 | 第49页 |
| 1.6 其他生理生化性状测定 | 第49-50页 |
| 1.7 抗生素敏感性测定 | 第50页 |
| 1.8 细胞醌类测定(委托云南大学微生物所) | 第50-51页 |
| 1.9 G+C mol%含量测定 | 第51页 |
| 1.10 脂肪酸分析(委托云南大学微生物研究所进行) | 第51-52页 |
| 1.11 极性酯组分分析 | 第52页 |
| 1.12 DNA-DNA同源性测定(委托德国微生物菌种保藏中心DSMZ进行) | 第52页 |
| 1.13 细胞多胺成分分析 | 第52-53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-64页 |
| 2.1 菌株SC_3的形态观察 | 第53页 |
| 2.2 菌株SC_3 16S rRNA基因系统进化树分析 | 第53-57页 |
| 2.3 菌株SC_3生理生化特征 | 第57页 |
| 2.4 其它生理生化特征 | 第57-58页 |
| 2.5 菌株SC_3的细胞化学成分分析 | 第58-62页 |
| 2.6 新种Sphingobium phenoxybenzoativorans的描述 | 第62-64页 |
| 第三节 菌株SC_4的分类地位研究 | 第64-75页 |
| 1 材料与方法 | 第64-65页 |
| 1.1 供试菌株 | 第64页 |
| 1.2 培养基与试剂 | 第64页 |
| 1.3 菌落形态观察 | 第64页 |
| 1.4 菌株系统进化树分析 | 第64页 |
| 1.5 API鉴定系统分析 | 第64页 |
| 1.6 其他生理生化性状测定 | 第64页 |
| 1.7 细胞醌类测定(委托云南大学微生物研究所) | 第64页 |
| 1.8 DNA G+C mol%的测定 | 第64-65页 |
| 1.9 细胞脂肪酸组分分析(委托云南大学微生物研究所) | 第65页 |
| 1.10 细胞极性酯组分分析(委托德国DSMZ) | 第65页 |
| 1.11 DNA-DNA同源性分析(委托广东省微生物研究所) | 第65页 |
| 1.12 细胞多胺组分分析 | 第65页 |
| 2 结果与分析 | 第65-75页 |
| 2.1 菌落SC_4的形态观察 | 第65页 |
| 2.2 菌株SC_4 16S rRNA基因系统发育分析 | 第65-69页 |
| 2.3 菌株SC_4生理生化特征分析 | 第69页 |
| 2.4 其它生理生化特征 | 第69-70页 |
| 2.5 菌株SC_4的细胞化学成分研究 | 第70-74页 |
| 2.6 新种的Sphingobium diphenyletherivorans描述 | 第74-75页 |
| 本章讨论 | 第75-78页 |
| 本章小结 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-84页 |
| 第三章 菌株SC_3的降解特性及对2-PBA、二苯醚的降解途径研究 | 第84-102页 |
| 第一节 菌株SC_3的降解特性研究 | 第84-90页 |
| 1 材料和方法 | 第84-86页 |
| 1.1 菌株与培养基 | 第84页 |
| 1.2 菌株SC_3对2-PBA的降解特性研究 | 第84-85页 |
| 1.3 菌株SC_3对3-PBA和4-PBA的降解 | 第85-86页 |
| 1.4 菌株SC_3对其它苯环类物质的降解 | 第86页 |
| 2 结果与分析 | 第86-90页 |
| 2.1 菌株SC_3对2-PBA和二苯醚的降解及菌株的生长情况 | 第86-87页 |
| 2.2 温度对SC_3降解2-PBA的影响 | 第87页 |
| 2.3 pH对SC_3降解2-PBA的影响 | 第87-88页 |
| 2.4 接种量对SC_3降解2-PBA的影响 | 第88-89页 |
| 2.5 2-PBA的初始浓度对SC_3降解2-PBA的影响 | 第89页 |
| 2.6 菌株SC_3对2-PBA同分异构体的降解 | 第89页 |
| 2.7 菌株SC_3对其它苯环类物质的降解 | 第89-90页 |
| 第二节 菌株SC_3对2-PBA和二苯醚降解代谢产物鉴定 | 第90-98页 |
| 1 材料与方法 | 第90-91页 |
| 1.1 培养基、试剂与菌株 | 第90页 |
| 1.2 细胞静息液的制备 | 第90页 |
| 1.3 菌株SC_3降解2-PBA和二苯醚的代谢产物制备 | 第90-91页 |
| 1.4 代谢产物HPLC检测 | 第91页 |
| 1.5 代谢产物的质谱鉴定分析 | 第91页 |
| 2 结果与分析 | 第91-98页 |
| 2.1 代谢产物的HPLC分析 | 第91-93页 |
| 2.2 代谢产物的LC-MS鉴定 | 第93-98页 |
| 本章讨论 | 第98-100页 |
| 本章小结 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-102页 |
| 第四章 菌株SC_3降解2-PBA的角度双加氧酶基因克隆与功能验证 | 第102-140页 |
| 第一节 菌株SC_3的基因组框架图测序 | 第102-106页 |
| 1 材料与方法 | 第102-103页 |
| 1.1 试剂与培养基 | 第102页 |
| 1.2 菌株SC_3基因组DNA的提取 | 第102-103页 |
| 1.3 全基因组测序 | 第103页 |
| 2 结果与分析 | 第103-106页 |
| 2.1 菌株SC_3对2-PBA降解功能的验证 | 第103-104页 |
| 2.2 菌株SC_3的基因组DNA的提取 | 第104页 |
| 2.3 基因组测序及其分析情况 | 第104-106页 |
| 第二节 角度双加氧酶基因dpeA1A2的克隆与功能验证 | 第106-133页 |
| 1 材料与方法 | 第106-116页 |
| 1.1 试剂与培养基 | 第106页 |
| 1.2 所用菌株与质粒 | 第106-107页 |
| 1.3 双加氧酶基因的查找 | 第107-108页 |
| 1.4 疑似双加氧酶基因的功能验证 | 第108-111页 |
| 1.5 2-PBA双加氧酶大亚基基因的插入突变 | 第111-113页 |
| 1.6 2-PBA和二苯醚对dpeA1A2的诱导条件下的诱导 | 第113-116页 |
| 2 结果与分析 | 第116-133页 |
| 2.1 双加氧酶基因的查找及生物信息学分析 | 第116-118页 |
| 2.2 双加氧酶验证功能质粒构建 | 第118-119页 |
| 2.3 双加氧酶基因簇的异源表达 | 第119-123页 |
| 2.4 dpeA1A2基因簇分析 | 第123-126页 |
| 2.5 dpeA1A2侧翼序列及苯酚降解基因簇ORF分析 | 第126-129页 |
| 2.6 双加氧酶大亚基的插入突变及功能验证 | 第129-131页 |
| 2.7 2-PBA和二苯醚对dpeA1A2的诱导转录 | 第131-133页 |
| 本章讨论 | 第133-137页 |
| 本章小结 | 第137-138页 |
| 参考文献 | 第138-140页 |
| 第五章 角度双加氧酶Dpe电子传递体基因的克隆与DpeA1A2BC全酶功能验证 | 第140-164页 |
| 1 材料与方法 | 第140-147页 |
| 1.1 试剂与培养基 | 第140页 |
| 1.2 供试菌株、质粒和引物 | 第140-141页 |
| 1.3 电子传递体铁氧还蛋白基因的发现 | 第141-142页 |
| 1.4 dpeA1A2及可能的铁氧还蛋白和还原酶基因的扩增 | 第142页 |
| 1.5 表达载体的构建 | 第142-144页 |
| 1.6 重组菌的诱导表达和纯化 | 第144-146页 |
| 1.7 DpeA1A2BC全酶对2-PBA和二苯醚的降解活性测定 | 第146-147页 |
| 2 结果与分析 | 第147-155页 |
| 2.1 电子传递体铁氧还蛋白基因的发现 | 第147-148页 |
| 2.2 DpeA1、DpeA2、DpeB和DpeC的异源表达及纯化 | 第148-153页 |
| 2.3 菌株SC_3对2-PBA(二苯醚)的降解途径及相关基因分析 | 第153-155页 |
| 本章讨论 | 第155-161页 |
| 本章小结 | 第161-162页 |
| 参考文献 | 第162-164页 |
| 第六章 全文结论与展望 | 第164-168页 |
| 第一节 全文结论 | 第164-166页 |
| 第二节 创新点 | 第166-167页 |
| 第三节 今后展望 | 第167-168页 |
| 附录 | 第168-176页 |
| 博士期间发表论文和专利申请 | 第176-178页 |
| 致谢 | 第178页 |
