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猪流行性腹泻病毒ORF3基因的变异分析及其荧光定量RT-PCR检测方法的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
英文缩略词表第8-13页
第一部分 文献综述第13-25页
    1 PEDV概述第13-19页
        1.1 PEDV的形态结构第13页
        1.2 PEDV基因组结构特点第13-17页
            1.2.1 复制酶多聚酶基因第14-15页
            1.2.2 结构基因第15-16页
            1.2.3 ORF3基因第16-17页
        1.3 PEDV病原学特性第17页
        1.4 PEDV致病机理第17-18页
        1.5 PEDV临床症状第18页
        1.6 PEDV病理变化第18页
        1.7 PEDV流行情况第18-19页
    2 PEDV诊断方法研究进展第19-24页
        2.1 病原学检测第19页
            2.1.1 分离鉴定第19页
        2.2 免疫学方法第19-21页
            2.2.1 免疫电镜法第19-20页
            2.2.2 免疫荧光法第20页
            2.2.3 血清中和试验第20页
            2.2.4 酶联免疫吸附试验第20-21页
            2.2.5 免疫胶体金技术第21页
        2.3 分子生物学技术第21-24页
            2.3.1 核酸探针杂交技术第21页
            2.3.2 RT-PCR法第21-22页
            2.3.3 逆转录-环介导等温核酸扩增技术第22页
            2.3.4 原位PCR法第22页
            2.3.5 巢式PCR第22-23页
            2.3.6 限制性片段长度多态性分析第23页
            2.3.7 实时荧光定量RT-PCR第23-24页
    3 本研究的目的与意义第24-25页
第二部分 研究内容第25-61页
    第一章 PEDV ORF3基因的变异分析第25-40页
        1 材料第25页
            1.1 菌株、质粒第25页
            1.2 主要试剂第25页
            1.3 主要仪器第25页
        2 方法第25-30页
            2.1 引物设计第25-26页
            2.2 PEDV ORF3基因的克隆第26-30页
                2.2.1 PEDV RNA的提取第26页
                2.2.2 PEDV PCR第26-27页
                2.2.3 PEDV ORF3基因的克隆第27-30页
                2.2.4 PEDV ORF3基因遗传进化分析第30页
        3 结果第30-38页
            3.1 RT-PCR鉴定结果第30-31页
            3.2 PEDV ORF3基因序列分析第31-34页
            3.3 PEDV ORF3基因遗传进化树构建第34-38页
        4 讨论第38-39页
            4.1 关于PEDV的流行情况第38页
            4.2 PEDV ORF3基因的变异分析第38-39页
        5 小结第39-40页
    第二章 Eva Green荧光定量RT-PCR检测PEDV方法的建立第40-61页
        1 材料第40页
            1.1 菌株、质粒第40页
            1.2 主要试剂第40页
            1.3 主要仪器设备第40页
        2 方法第40-44页
            2.1 引物设计第40-41页
            2.2 Eva Green荧光定量检测PEDV方法的建立第41-44页
                2.2.1 PEDV ORF3基因的标准质粒制备第41-42页
                2.2.2 EG-qRT-PCR反应条件的优化第42页
                2.2.3 EG-qRT-PCR标准曲线和熔解曲线的建立第42页
                2.2.4 EG-qRT-PCR特异性试验第42页
                2.2.5 EG-qRT-PCR重复性试验第42页
                2.2.6 EG-qRT-PCR灵敏度试验第42-43页
                2.2.7 EG-qRT-PCR的临床应用第43-44页
        3 结果第44-57页
            3.1 PEDV ORF3基因标准质粒的构建第44-45页
            3.2 EG-qRT-PCR退火温度及引物浓度优化结果第45-46页
            3.3 EG-qRT-PCR标准曲线和熔解曲线的制作第46-48页
            3.4 EG-qRT-PCR特异性试验结果第48-49页
            3.5 EG-qRT-PCR重复性实验结果第49-51页
            3.6 EG-qRT-PCR敏感性试验结果第51-52页
            3.7 EG-qRT-PCR临床病料检测结果第52-54页
            3.8 PEDV商品疫苗病毒含量的检测第54页
            3.9 PEDV不同组织病毒含量检测第54-57页
        4 讨论第57-60页
        5 小结第60-61页
参考文献第61-73页
致谢第73-74页
附录第74-77页
攻读学位期间发表的学术论文目录第77页

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