| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1. 文献综述 | 第8-17页 |
| ·基于全基因组测序的基因家族发掘 | 第8页 |
| ·植物基因组的测序 | 第8页 |
| ·基因家族及对基因家族成员的鉴定 | 第8页 |
| ·基因家族系统发育分析 | 第8-9页 |
| ·禾本科比较基因组学研究进展 | 第9-11页 |
| ·基因组的倍增 | 第9页 |
| ·比较遗传图谱 | 第9-11页 |
| ·微共线性 | 第11页 |
| ·选择压力对基因家族进化的影响 | 第11-12页 |
| ·分子进化速率 | 第11-12页 |
| ·基因家族分子进化保守性 | 第12页 |
| ·植物HD-Zip转录因子的研究进展 | 第12-15页 |
| ·植物HD-Zip转录因子概述 | 第12-13页 |
| ·植物HD-Zip转录因子的结构及类型 | 第13-14页 |
| ·植物HD-Zip转录因子的功能 | 第14-15页 |
| ·生物信息学的研究进展 | 第15-17页 |
| ·生物信息学数据库 | 第15页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第15-16页 |
| ·生物信息学的展望 | 第16-17页 |
| 2. 引言 | 第17-19页 |
| ·立项依据及意义 | 第17-18页 |
| ·技术路线 | 第18-19页 |
| 3. 材料与方法 | 第19-22页 |
| ·数据收集与序列结构分析 | 第19-20页 |
| ·基因组数据库序列来源 | 第19页 |
| ·HD-Zip转录因子的鉴定 | 第19页 |
| ·HD-Zip I转录因子序列属性分析 | 第19页 |
| ·HD-Zip I转录因子基因结构分析 | 第19-20页 |
| ·HD-Zip I基因的染色体物理位置定位和基因复制 | 第20页 |
| ·多重序列比对和系统发育分析 | 第20页 |
| ·物种内的微共线性分析 | 第20页 |
| ·物种间的微共线性分析 | 第20-21页 |
| ·复制时间的计算和选择压力分析 | 第21-22页 |
| 4. 结果与分析 | 第22-41页 |
| ·禾本科全基因组中HD-Zip转录因子的鉴定和分类 | 第22-24页 |
| ·禾本科植物HD-Zip I基因家族的系统发育分析 | 第24-26页 |
| ·禾本科植物HD-Zip I基因的结构分析 | 第26-27页 |
| ·内含子和外显子的分布 | 第26-27页 |
| ·结构域和基序分析 | 第27页 |
| ·物种内微共线性分析 | 第27-30页 |
| ·HD-Zip I基因的扩张模式 | 第27-29页 |
| ·复制事件发生的时间 | 第29-30页 |
| ·物种间微共线性分析 | 第30-37页 |
| ·基因复制后环境选择压力 | 第37-41页 |
| 5. 讨论 | 第41-43页 |
| 6. 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 个人简介 | 第52-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第53页 |
