| 中文摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-27页 |
| ·转录组研究概况 | 第14-17页 |
| ·转录组研究主要方法 | 第14-16页 |
| ·Rhodococcus sp.R04转录组测序研究 | 第16-17页 |
| ·红球菌联苯代谢及相关同工酶 | 第17-19页 |
| ·红球菌R04联苯代谢研究进展 | 第17页 |
| ·联苯代谢相关同工酶 | 第17-19页 |
| ·苯甲酸代谢及中间代谢产物 | 第19-21页 |
| ·苯甲酸代谢 | 第19-20页 |
| ·对羟基苯甲酸-3-羟化酶 | 第20-21页 |
| ·原儿茶酸 | 第21页 |
| ·本课题研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 参考文献 | 第22-27页 |
| 第二章 联苯培养条件下红球菌R04的转录表达 | 第27-40页 |
| ·材料 | 第27-28页 |
| ·菌株、培养基和生长条件 | 第27-28页 |
| ·主要化学试剂 | 第28页 |
| ·主要仪器设备 | 第28页 |
| ·方法 | 第28-31页 |
| ·静息细胞的制备及菌体收集 | 第28页 |
| ·总RNA的提取及cDNA的合成 | 第28-29页 |
| ·转录组测序分析 | 第29页 |
| ·Q-RT-PCR分析 | 第29-31页 |
| ·结果与讨论 | 第31-37页 |
| ·红球菌R04总RNA的提取 | 第31-32页 |
| ·联苯培养条件下红球菌R04基因的差异表达概述 | 第32-33页 |
| ·抗氧化酶类的差异表达 | 第33-34页 |
| ·细胞分裂相关蛋白的差异表达 | 第34页 |
| ·双组分调节系统的差异表达 | 第34页 |
| ·核糖体结合蛋白的差异表达 | 第34-35页 |
| ·气囊蛋白的差异表达 | 第35页 |
| ·Q-RT-PCR实验结果 | 第35-37页 |
| 参考文献 | 第37-40页 |
| 第三章 联苯培养条件下红球菌R04联苯代谢途径解析 | 第40-50页 |
| ·材料 | 第40-41页 |
| ·菌株、培养基和生长条件 | 第40页 |
| ·主要化学试剂 | 第40页 |
| ·主要仪器设备 | 第40-41页 |
| ·方法 | 第41-43页 |
| ·总RNA的提取及cDNA的合成 | 第41页 |
| ·Q-RT-PCR分析 | 第41页 |
| ·转录组测序分析 | 第41-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-48页 |
| ·红球菌R04总RNA的提取 | 第43页 |
| ·Q-RT-PCR分析结果 | 第43-44页 |
| ·联苯代谢途径上游基因的差异表达 | 第44-46页 |
| ·联苯代谢过程中其他同工酶的差异表达 | 第46页 |
| ·红球菌R04在联苯压力下的苯甲酸代谢 | 第46-48页 |
| ·讨论 | 第48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 第四章 原儿茶酸的生物转化 | 第50-64页 |
| ·材料 | 第50-51页 |
| ·菌株、载体及培养基 | 第50页 |
| ·主要酶和化学试剂 | 第50-51页 |
| ·主要仪器设备 | 第51页 |
| ·方法 | 第51-54页 |
| ·对羟基苯甲酸-3-羟化酶重组质粒的构建 | 第51页 |
| ·重组质粒转化及IPTG诱导表达重组大肠杆菌 | 第51-52页 |
| ·对羟基苯甲酸和原儿茶酸的光谱特性以及标准曲线的测定 | 第52页 |
| ·原儿茶酸的生物转化 | 第52页 |
| ·生物转化过程的条件优化 | 第52-53页 |
| ·转化率及回收率 | 第53-54页 |
| ·结果 | 第54-61页 |
| ·重组质粒的构建 | 第54-55页 |
| ·重组质粒转化及IPTG诱导表达重组大肠杆菌 | 第55-56页 |
| ·对羟基苯甲酸和原儿茶酸的光谱特性以及标准曲线的测定 | 第56-57页 |
| ·产物的检测 | 第57-58页 |
| ·生物转化过程的条件优化 | 第58-61页 |
| ·回收率 | 第61页 |
| ·讨论 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-64页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 个人简况及联系方式 | 第66-67页 |
| 承诺书 | 第67-68页 |
