| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-13页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 1 引言 | 第14-31页 |
| ·朱鹮研究 | 第14-18页 |
| ·生物学习性 | 第14页 |
| ·朱鹮的历史 | 第14-15页 |
| ·朱鹮种群发展 | 第15-17页 |
| ·朱鹮的研究概况 | 第17-18页 |
| ·鸟类性别鉴定 | 第18-21页 |
| ·传统性别鉴定方法 | 第18-19页 |
| ·泄殖腔性别鉴定 | 第18页 |
| ·腹腔镜检法 | 第18-19页 |
| ·类固醇法 | 第19页 |
| ·核型分析法 | 第19页 |
| ·性别鉴定的分子生物学方法 | 第19-21页 |
| ·随机扩增多态DNA | 第19-20页 |
| ·微卫星 | 第20页 |
| ·小卫星 | 第20页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第20页 |
| ·CHD1基因 | 第20-21页 |
| ·鸟类线粒体DNA及异质性 | 第21-23页 |
| ·线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)的结构 | 第21-23页 |
| ·线粒体异质性 | 第23页 |
| ·微卫星DNA标记 | 第23-28页 |
| ·微卫星简介 | 第23-24页 |
| ·微卫星的形成 | 第24-25页 |
| ·微卫星DNA分子标记的特点 | 第25页 |
| ·微卫星标记的获得 | 第25-27页 |
| ·跨物种扩增法(cross-species amplification) | 第26页 |
| ·建立微卫星文库筛选微卫星位点 | 第26-27页 |
| ·微卫星的应用 | 第27-28页 |
| ·主要组织相容性复合体(MHC) | 第28-29页 |
| ·鸟类MHC分子的结构特点 | 第28-29页 |
| ·MHC在保护生物学中的应用 | 第29页 |
| ·本研究的目的、意义及拟解决的问题 | 第29-31页 |
| 2 基于CHD1基因的朱鹮性别鉴定 | 第31-48页 |
| ·实验材料 | 第31-32页 |
| ·主要仪器及试剂配制 | 第32-34页 |
| ·主要仪器 | 第32-33页 |
| ·主要试剂配制 | 第33-34页 |
| ·基因组DNA提取及检测 | 第34-35页 |
| ·CHD1片段扩增 | 第35-36页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第36页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第36页 |
| ·银染 | 第36页 |
| ·PCR产物克隆 | 第36-38页 |
| ·PCR产物的纯化回收 | 第36-37页 |
| ·PCR产物克隆 | 第37-38页 |
| ·测序及数据分析 | 第38页 |
| ·研究结果 | 第38-44页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第38-39页 |
| ·引物2550F/2718R用于朱鹮性别鉴定 | 第39-40页 |
| ·P2/P8用于朱鹮性别鉴定 | 第40-41页 |
| ·朱鹮CHD1相关序列 | 第41-44页 |
| ·讨论 | 第44-48页 |
| ·CHD1基因朱鹃性别鉴定 | 第44页 |
| ·鸟类性别鉴定引物 | 第44-48页 |
| 3 线粒体异质性研究 | 第48-60页 |
| ·实验材料 | 第48-49页 |
| ·主要仪器及试剂配制 | 第49页 |
| ·基因组DNA提取及检测 | 第49-50页 |
| ·线粒体DNA控制区扩增测序 | 第50-51页 |
| ·线粒体控制区异质性的基因型分型 | 第51-52页 |
| ·荧光引物设计及扩增 | 第51页 |
| ·基因分型 | 第51-52页 |
| ·数据分析 | 第52页 |
| ·研究结果 | 第52-56页 |
| ·线粒体DNA序列分析 | 第52页 |
| ·长度多态和异质性 | 第52-55页 |
| ·长度多态性和异质性的传递 | 第55-56页 |
| ·讨论 | 第56-60页 |
| ·朱鹮线粒体DNA控制区长度异质性检测 | 第56-57页 |
| ·朱鹮线粒体DNA控制区多态 | 第57页 |
| ·朱鹮线粒体DNA长度多态和异质性的起源 | 第57-58页 |
| ·线粒体DNA控制区多态性和异质性的传递 | 第58-60页 |
| 4 多态微卫星位点筛选及群体遗传多样性 | 第60-103页 |
| ·实验材料 | 第60-61页 |
| ·主要仪器及试剂配制 | 第61页 |
| ·基因组DNA提取及检测 | 第61页 |
| ·微卫星标记来源 | 第61-63页 |
| ·已有朱鹮微卫星位点 | 第61-62页 |
| ·近缘种微卫星位点 | 第62-63页 |
| ·磁珠富集文库法筛选朱鹮微卫星位点 | 第63-66页 |
| ·合成接头(Linker) | 第63-64页 |
| ·基因组DNA酶切 | 第64页 |
| ·选择性扩增 | 第64-65页 |
| ·磁珠富集微卫星DNA片段 | 第65页 |
| ·PCR产物克隆测序,设计引物 | 第65-66页 |
| ·PCR-SSCP | 第66页 |
| ·PCR产物测序,基因分型 | 第66页 |
| ·数据分析 | 第66-71页 |
| ·微卫星遗传多样性分析 | 第67-68页 |
| ·哈代-温伯格平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE) | 第68-69页 |
| ·连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD) | 第69-70页 |
| ·瓶颈效应 | 第70页 |
| ·F统计量 | 第70页 |
| ·群体遗传结构 | 第70-71页 |
| ·研究结果 | 第71-98页 |
| ·磁珠富集文库法筛选位点 | 第71-74页 |
| ·基因pool | 第71页 |
| ·预扩增 | 第71-72页 |
| ·富集片段扩增 | 第72-73页 |
| ·克隆测序 | 第73页 |
| ·新引物扩增 | 第73-74页 |
| ·多态性微卫星位点 | 第74-76页 |
| ·可用于朱鹮性别鉴定的微卫星位点 | 第76-77页 |
| ·微卫星多态性检测 | 第77-82页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检验 | 第82-83页 |
| ·累积亲权分配率 | 第83页 |
| ·瓶颈效应 | 第83-86页 |
| ·群体遗传距离及聚类分析 | 第86-90页 |
| ·群体遗传结构分析 | 第90-97页 |
| ·北京动物园饲养种群 | 第97-98页 |
| ·讨论 | 第98-103页 |
| ·微卫星位点筛选 | 第98-99页 |
| ·群体遗传多样性 | 第99-100页 |
| ·种群遗传分化 | 第100-101页 |
| ·人工种群繁殖管理 | 第101-103页 |
| 5 朱鹮MHC Ⅱ类B基因exon 2多态性 | 第103-119页 |
| ·实验材料 | 第103页 |
| ·主要仪器及试剂配制 | 第103页 |
| ·基因组DNA提取及检测 | 第103页 |
| ·PCR扩增引物设计,直接测序 | 第103-104页 |
| ·PCR-SSCP | 第104-105页 |
| ·数据分析 | 第105页 |
| ·研究结果 | 第105-112页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因双拷贝的分离 | 第105-108页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因exon 2多态性 | 第108-111页 |
| ·PCR-SSCP | 第108-109页 |
| ·BLB1/BLB2 exon 2新等位基因及遗传多样性分析 | 第109-111页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因β结构域氨基酸序列 | 第111-112页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因exon 2等位基因间的系统发生 | 第112页 |
| ·讨论 | 第112-119页 |
| ·朱鹮MHC Ⅱ类B基因双拷贝的首次发现 | 第112-114页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因exon 2的进化 | 第114-116页 |
| ·MHC Ⅱ类B基因的多样性 | 第116-119页 |
| 6 结论 | 第119-121页 |
| 参考文献 | 第121-139页 |
| 个人简介 | 第139-140页 |
| 导师简介 | 第140-141页 |
| 成果清单 | 第141-142页 |
| 致谢 | 第142-143页 |
