水稻SNP对蛋白质磷酸化影响的分析
| 缩略语表 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第11-19页 |
| ·SNP研究进展 | 第11-16页 |
| ·SNP的类型 | 第12-13页 |
| ·SNP的查找与应用 | 第13-15页 |
| ·SNP分析的生物信息学工具 | 第15-16页 |
| ·蛋白质磷酸化的研究进展 | 第16-18页 |
| ·蛋白质磷酸化位点与nsSNP的关系 | 第17-18页 |
| ·本文的研究思路 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-27页 |
| ·数据收集 | 第19-22页 |
| ·水稻SNP数据的收集 | 第19-20页 |
| ·水稻蛋白质数据的收集 | 第20-21页 |
| ·经实验验证的水稻蛋白质磷酸化位点的收集 | 第21页 |
| ·水稻异三聚体G蛋白序列的收集 | 第21-22页 |
| ·数据处理 | 第22-24页 |
| ·Ricehap2中转换与颠换SNP的统计分析 | 第22页 |
| ·水稻基因组SNP数据集的构建 | 第22-23页 |
| ·水稻蛋白质组磷酸化位点数据集的构建 | 第23-24页 |
| ·磷酸化位点与nsSNP关系 | 第24-25页 |
| ·异三聚体G蛋白与SNP的关联分析 | 第25-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-50页 |
| ·水稻基因组SNP数据分析 | 第27-31页 |
| ·RiceHap2中SNP的转换和颠换比率分析 | 第27-28页 |
| ·不同版本的水稻基因组的SNP比较分析 | 第28-29页 |
| ·SNP类型分析 | 第29-30页 |
| ·水稻各染色体上蛋白质与SNP的对应关系 | 第30-31页 |
| ·水稻基因组的蛋白质磷酸化位点分析 | 第31-33页 |
| ·蛋白质磷酸化位点的预测 | 第31-32页 |
| ·实验验证的蛋白质磷酸化位点数量统计 | 第32-33页 |
| ·nsSNP与蛋白质磷酸化的关系分析 | 第33-39页 |
| ·经预测的蛋白质磷酸化位点与nsSNP | 第33-38页 |
| ·经实验验证的蛋白质磷酸化位点与nsSNP的关系 | 第38-39页 |
| ·水稻异三聚体G蛋白与nsSNP相关性分析 | 第39-50页 |
| ·NCBI数据库中异三聚体G蛋白的SNP | 第39-40页 |
| ·G蛋白在版本7.0中SNP数据 | 第40-44页 |
| ·异三聚体G蛋白碟酸化修饰与nsSNP间的关系 | 第44-46页 |
| ·SNP对异三聚体G蛋白结构的影响 | 第46-50页 |
| 4 讨论 | 第50-53页 |
| ·水稻基因组的SNP数据集 | 第51页 |
| ·水稻基因组中蛋白质磷酸化修饰位点数据集 | 第51-52页 |
| ·nsSNP对蛋白质磷酸化的影响 | 第52页 |
| ·nsSNP对异三聚体G蛋白磷酸化的影响 | 第52-53页 |
| 5 小结 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
