| 目录 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词表 | 第13-15页 |
| 前言 | 第15-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-33页 |
| 1. 植物根系形成发育的研究进展 | 第17-23页 |
| ·根的形态结构 | 第17-18页 |
| ·根的发育 | 第18-19页 |
| ·根系形成的分子遗传基础研究 | 第19-23页 |
| 2. 萝卜肉质根形成发育的研究进展 | 第23-31页 |
| ·萝卜肉质根形成的形态学基础 | 第23-25页 |
| ·影响萝卜肉质根形成发育的环境因素 | 第25-26页 |
| ·萝卜肉质根形成发育的生理生化机制 | 第26-29页 |
| ·萝卜肉质根形成发育相关蛋白的研究 | 第29-30页 |
| ·萝卜肉质根形成膨大的差异表达基因研究 | 第30-31页 |
| 3. 本研究的目的和意义 | 第31-33页 |
| 第二章 萝卜肉质根形成膨大过程中蛋白质组学研究 | 第33-53页 |
| 摘要 | 第33-34页 |
| 1. 材料与方法 | 第34-40页 |
| ·材料 | 第34页 |
| ·萝卜肉质根总蛋白质的提取 | 第34页 |
| ·蛋白质的溶解与定量 | 第34-35页 |
| ·双向电泳 | 第35-37页 |
| ·考马斯亮蓝染色 | 第37页 |
| ·图像采集与分析 | 第37页 |
| ·质谱分析与数据库检索 | 第37页 |
| ·编码差异蛋白基因的表达特征分析 | 第37-40页 |
| 2. 结果与分析 | 第40-48页 |
| ·萝卜肉质根不同发育时期蛋白质双向电泳图谱分析 | 第40-43页 |
| ·差异蛋白点的质谱鉴定 | 第43-46页 |
| ·差异调节蛋白质(多肽)的功能分类 | 第46-47页 |
| ·编码差异蛋白基因的表达特征分析 | 第47-48页 |
| 3. 讨论 | 第48-53页 |
| ·差异蛋白质的质谱鉴定 | 第48-49页 |
| ·差异蛋白质的功能分析 | 第49-53页 |
| 第三章 萝卜肉质根形成膨大的差异表达基因分析 | 第53-65页 |
| 摘要 | 第53页 |
| 1. 材料与方法 | 第53-56页 |
| ·材料 | 第53-54页 |
| ·方法 | 第54-56页 |
| 2. 结果与分析 | 第56-62页 |
| ·RNA提取分析 | 第56页 |
| ·萝卜不同生育期肉质根的mRNA差异显示分析 | 第56-57页 |
| ·差异片断的回收再扩增 | 第57-58页 |
| ·差异表达基因片段的同源性分析 | 第58-62页 |
| 3. 讨论 | 第62-65页 |
| 第四章 萝卜肉质根cDNA文库构建及EST分析 | 第65-85页 |
| 摘要 | 第65-66页 |
| 1. 材料与方法 | 第66-67页 |
| ·试验材料 | 第66页 |
| ·总RNA的提取 | 第66页 |
| ·全长cDNA文库的构建及EST的规模化测序 | 第66页 |
| ·EST序列的生物信息学分析 | 第66-67页 |
| 2. 结果与分析 | 第67-82页 |
| ·萝卜肉质根cDNA文库的构建 | 第67-68页 |
| ·EST序列信息的获得及生物信息学分析 | 第68-74页 |
| ·萝卜肉质根EST序列同源性比较分析及基因表达功能分类 | 第74-77页 |
| ·重要基因的鉴定 | 第77-82页 |
| 3. 讨论 | 第82-85页 |
| ·萝卜肉质根cDNA文库质量的评价 | 第82页 |
| ·萝卜ESTs的生物信息学分析 | 第82-83页 |
| ·重要基因的鉴定 | 第83-85页 |
| 第五章 萝卜肉质根形成性状的表达谱分析 | 第85-99页 |
| 摘要 | 第85-86页 |
| 1. 材料与方法 | 第86-90页 |
| ·植物材料 | 第86页 |
| ·植物RNA的提取、纯化及反转录 | 第86页 |
| ·标签文库建立和标签测序 | 第86页 |
| ·标签-基因定位 | 第86-88页 |
| ·标签的差异表达分析 | 第88页 |
| ·基因功能聚类分析 | 第88-89页 |
| ·qRT-PCR进行差异基因表达模式验证 | 第89-90页 |
| 2. 结果与分析 | 第90-98页 |
| ·Solexa标签文库的分析 | 第90-94页 |
| ·差异表达显著的基因功能分类 | 第94-95页 |
| ·qRT-PCR对测序结果的验证 | 第95-98页 |
| 3. 讨论 | 第98-99页 |
| 第六章 基于萝卜cDNA文库EST-SSR标记开发与特征分析 | 第99-111页 |
| 摘要 | 第99-100页 |
| 1. 材料和方法 | 第100-103页 |
| ·材料 | 第100-102页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第102页 |
| ·EST-SSR位点搜索与引物设计 | 第102页 |
| ·引物通用性检测 | 第102页 |
| ·遗传多样性分析 | 第102-103页 |
| 2. 结果与分析 | 第103-109页 |
| ·萝卜EST-SSR的特征分析 | 第103-105页 |
| ·EST-SSR标记的开发及在遗传多样性上的应用 | 第105-106页 |
| ·EST-SSR标记的通用性 | 第106-109页 |
| 3. 讨论 | 第109-111页 |
| 第七章 萝卜蔗糖磷酸合成酶基因克隆与表达特征分析 | 第111-123页 |
| 摘要 | 第111-112页 |
| 1. 材料与方法 | 第112-115页 |
| ·材料 | 第112页 |
| ·基因组DNA和总RNA的提取 | 第112-113页 |
| ·RsSPS1基因基因组DNA及cDNA特异扩增 | 第113页 |
| ·RsSPS1基因克隆与分析 | 第113-115页 |
| ·序列测定及分析 | 第115页 |
| ·RsSPS1基因半定量RT-PCR表达分析 | 第115页 |
| ·RsSPS1基因实时荧光定量表达研究 | 第115页 |
| 2. 结果与分析 | 第115-120页 |
| ·RsSPS1基因DNA与cDNA扩增 | 第115-116页 |
| ·RsSPS1基因的克隆及序列分析 | 第116-118页 |
| ·生物信息学分析 | 第118-119页 |
| ·系统进化分析 | 第119页 |
| ·RsSPS1时空表达分析 | 第119-120页 |
| 3. 讨论 | 第120-123页 |
| 全文结论 | 第123-125页 |
| 创新之处 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-139页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第139-141页 |
| 致谢 | 第141页 |