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盐胁迫下玉米基因表达谱分析

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-10页
第一章 前言第10-27页
   ·玉米在国内外的生产概况第10页
   ·影响玉米产量的生物和非生物因素第10-11页
   ·盐胁迫对植物的伤害与植物耐盐的生理生化机制第11-12页
     ·抗离子的胁迫机制第11-12页
     ·抗渗透胁迫的机制第12页
     ·程序性死亡调节机制第12页
   ·植物抗盐机理及其在植物基因工程的研究第12-13页
   ·植物在盐胁迫下信号转导及其转录应答第13-14页
   ·抗渗透胁迫基因工程研究进展第14页
   ·提高和改良玉米抗盐能力的措施和方法第14-15页
   ·表达序列标签技术第15-21页
     ·EST技术产生及其发展历程第15-16页
     ·EST技术的特点及其应用第16-21页
       ·构建遗传学图谱第17-18页
       ·分离与鉴定新基因第18-19页
       ·用于基因表达谱研究第19-20页
       ·用于比较基因组学研究第20页
       ·用于准备cDNA微阵列第20-21页
   ·DNA微阵列技术第21-25页
     ·DNA微阵列技术简介第21-22页
     ·DNA微阵列制备方法第22-23页
     ·微阵列技术在植物基因研究中的应用第23-25页
       ·基因表达谱研究第23页
       ·寻找新基因第23-24页
       ·基因表达水平检测第24页
       ·后基因组学研究第24-25页
     ·DNA微阵列技术在国内外研究进展第25页
   ·基于微阵列数据用MapMan软件对植物代谢途径分析方法简介第25-26页
   ·本研究的目的第26-27页
第二章 材料与方法第27-41页
   ·材料第27-28页
     ·玉米材料第27页
     ·溶液配方和主要试剂第27-28页
   ·方法第28-41页
     ·玉米幼苗培养及其胁迫处理第28-29页
     ·光合作用参数的测定第29页
     ·RNA抽提第29页
     ·cDNA阵列的制备第29-30页
       ·用于cDNA阵列制备的克隆挑取第29页
       ·cDNA克隆的PCR扩增与质量控制第29-30页
       ·PCR产物纯化和点样前处理第30页
       ·cDNA阵列制备第30页
     ·cDNA阵列杂交探针的制备第30-31页
     ·cDNA阵列的杂交和数据提取第31-34页
       ·预杂交和杂交第31页
       ·洗膜第31-32页
       ·cDNA阵列杂交数据提取和分析第32-33页
       ·t检验方法及其差异表达基因筛选方法第33-34页
     ·系统聚类(Hierarchical clustering)及K-means均值聚类第34-35页
     ·实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR)分析第35页
     ·差异表达基因的代谢途径(Pathway)分析方法第35-41页
       ·软件的下载与安装第36页
       ·分类图谱(Mappings)的建立第36-38页
       ·代谢途径(Pathways)的建立第38页
       ·实验数据的文档格式(Experiment Data format)建立与导入第38-39页
       ·Mappings、Experiment Data与Pathways的相互结合第39-41页
第三章 结果和分析第41-74页
   ·盐胁迫对玉米表型特征的影响第41-42页
   ·盐胁迫对玉米叶片光合特性的影响第42-43页
   ·用于制备cDNA阵列杂交探针的总RNA的提取第43-44页
   ·cDNA阵列杂交信号数据分析第44-51页
   ·差异表达基因的鉴定及其荧光定量PCR的验证第51-54页
   ·叶和根在盐胁迫下的表达谱比较分析第54-56页
   ·盐胁迫下不同功能类别基因的响应第56-57页
     ·叶中功能基因的响应第56-57页
     ·根中功能基因的响应第57页
   ·撤胁迫48h不同功能类别基因的响应第57-61页
     ·叶中功能基因的响应第57页
     ·根中功能基因的响应第57-61页
   ·差异表达基因功能分析第61-65页
     ·与光合作用相关的差异表达基因功能分析第61-63页
     ·盐胁迫下与物质能量代谢相关基因的响应第63-65页
       ·叶中与物质能量代谢相关基因的响应第63-65页
       ·根中与物质能量代谢相关基因的响应第65页
   ·撤胁迫下与物质能量代谢相关基因的响应第65-66页
     ·叶中与物质能量代谢相关基因的响应第65-66页
     ·根中与物质能量代谢相关基因的响应第66页
   ·盐胁迫及其撤胁迫下与信号转导相关基因的响应第66-68页
   ·盐胁迫下其它基因的响应第68-69页
     ·叶中其它基因响应第68页
     ·根中其它基因响应第68-69页
   ·差异表达基因代谢途径(Pathway)分析第69-74页
     ·叶中差异表达基因代谢途径分析结果第69-73页
     ·根中差异表达基因代谢途径分析结果第73-74页
第四章 讨论第74-77页
   ·玉米cDNA阵列的制备及其杂交技术探讨第74页
   ·盐胁迫对三叶期玉米光合作用影响及其光合响应基因调节第74-75页
     ·三叶期玉米在盐胁迫下光合指标变化第74-75页
     ·三叶期玉米在盐胁迫下与光合作用相关基因表达变化第75页
   ·盐胁迫下cDNA阵列检测玉米叶和根的基因表达第75-76页
   ·盐胁迫及其撤胁迫下玉米叶和根的基因表达模式比较第76页
   ·盐胁迫下差异表达基因的代谢途径分析第76-77页
参考文献第77-85页
附录第85-89页
 补充表1第85-87页
 补充表2第87-88页
 补充表3第88-89页
致谢第89-90页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第90页

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