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鸡的性比及性分化早期胚胎性别差异表达基因研究

缩略词表1第1-10页
缩略词表2第10-11页
摘要第11-13页
ABSTRACT第13-16页
第一章 文献综述第16-36页
 1 引言第16-17页
 2 鸡的性比及性别控制第17-21页
   ·性比及适应性性别分配第17-18页
   ·影响鸡性比的因素第18-19页
   ·鸡性比调控的研究现状第19-21页
 3 禽类性别决定与性腺分化第21-28页
   ·禽类的性别决定第21-25页
   ·禽类的性腺分化第25-26页
   ·禽类性腺发育相关基因第26-28页
 4 功能基因组学研究方法及在性腺发育研究中的应用第28-31页
   ·基于mRNA水平的基因表达研究方法第28-29页
   ·基于生物信息学的基因功能探讨第29-30页
   ·基于突变体的基因功能研究第30页
   ·基于蛋白质组学的基因功能研究第30-31页
 5 利用抑制消减杂交技术分离差异表达基因第31-34页
   ·抑制消减杂交技术的发展历程第31页
   ·抑制消减杂交技术的原理和基本操作过程第31-33页
   ·抑制消减杂交在分离差异表达基因中的应用第33-34页
 6 本研究的目的和意义第34-36页
第二章 早期鸡胚性别鉴定及鸡群子代性比分析第36-52页
 1 前言第36页
 2 材料与方法第36-41页
   ·实验材料第36-38页
     ·实验样品第36-37页
     ·主要仪器和设备第37页
     ·主要药品及试剂第37页
     ·缓冲液和常用试剂的配制第37-38页
   ·实验方法第38-41页
     ·基因组DNA的提取第38-39页
     ·双重PCR鉴定鸡的性别第39-40页
     ·种蛋孵化、胚胎发育阶段划分及性别鉴定第40-41页
     ·数据统计及分析第41页
 3 结果与分析第41-46页
   ·性别鉴定分子方法的建立及准确性验证第41-43页
   ·早期死亡鸡胚的性别判定第43-44页
   ·鸡群子代性比分析第44-45页
   ·高繁殖力母鸡亲本性比分析第45页
   ·孵化过程中死亡鸡胚性比分析第45-46页
 4 讨论第46-52页
   ·禽类的性别鉴定第46-47页
   ·性别鉴定中性染色体连锁特异片段的选择第47-48页
   ·早期鸡胚性别鉴定的可行性及其应用第48-49页
   ·子代性比偏向的原因第49页
   ·性别偏向性死亡的原因第49-50页
   ·鸡的性比调控第50-51页
   ·小结第51-52页
第三章 性分化早期鸡胚性别差异表达基因的分离第52-83页
 1 前言第52页
 2 材料和方法第52-65页
   ·实验材料第52-54页
     ·实验样品第52页
     ·主要仪器和设备第52-53页
     ·试剂盒、主要试剂及酶、载体及菌株第53-54页
     ·缓冲液和常用试剂的配制第54页
     ·主要分子生物学软件第54页
     ·主要参考数据库第54页
   ·实验方法第54-65页
     ·胚胎性腺组织总RNA的提取第54-55页
     ·鸡胚性腺mRNA的分离第55-57页
     ·抑制消减杂交第57-62页
     ·消减文库的构建第62-63页
     ·消减cDNA文库的斑点杂交筛选第63-65页
     ·阳性克隆cDNA片段测序及序列分析第65页
 3 结果与分析第65-78页
   ·胚胎性腺总RNA的提取和检测第65-66页
   ·抑制消减文库构建第66-69页
     ·Driver cDNA和Tester cDNA的制备第66-67页
     ·抑制性消减杂交产物及消减效率第67-69页
     ·消减cDNA文库插入片段的鉴定第69页
   ·斑点杂交第69-70页
   ·差异表达克隆序列分析第70-78页
     ·差异表达克隆的序列比对第70-71页
     ·差异表达克隆的同源基因第71-75页
     ·差异表达基因在鸡基因组中的分布第75-76页
     ·差异表达克隆cDNA片段与鸡性腺文库的同源EST比较第76-78页
 4 讨论第78-83页
   ·抑制消减杂交的质量检测第78-79页
   ·斑点杂交筛选阳性差异表达克隆第79页
   ·已分离的差异表达基因的特征第79-81页
     ·染色质水平(转录前水平)起作用的基因第79-80页
     ·转录水平起作用的基因第80-81页
     ·线粒体基因第81页
   ·与性腺发育相关的基因第81-82页
   ·小结第82-83页
第四章 鸡胚性腺发育相关候选基因的表达谱分析第83-104页
 1 前言第83页
 2 材料和方法第83-92页
   ·实验材料第83-85页
     ·实验样品第83-84页
     ·主要仪器和设备第84页
     ·主要试剂和酶第84页
     ·缓冲液和常用试剂的配制第84-85页
   ·实验方法第85-92页
     ·半定量RT-PCR分析基因表达谱第85-88页
     ·Real-time定量PCR分析基因表达谱第88页
     ·整体组织原位杂交(WISH)第88-92页
 3 结果与分析第92-101页
   ·功能候选基因的发育表达谱第92-95页
   ·消减文库中差异表达基因的发育表达谱第95-100页
   ·SMARCE1基因的组织原位杂交分析第100-101页
 4 讨论第101-104页
   ·功能候选基因在鸡与哺乳动物性腺发育中的表达第101页
   ·消减文库中差异表达基因的发育表达谱第101-102页
   ·SMARCE1基因在鸡胚中原位组织表达第102-103页
   ·小结第103-104页
第五章 两个鸡性别差异表达基因的克隆及序列特征分析第104-117页
 1 前言第104页
 2 材料和方法第104-107页
   ·实验材料第104页
     ·实验样品第104页
     ·主要试剂第104页
   ·实验方法第104-107页
     ·SMART cDNA的合成第104-106页
     ·RACE-PCR克隆差异表达的基因的cDNA全长第106-107页
     ·RACE-PCR产物的回收和纯化、克隆及测序第107页
     ·序列分析第107页
 3 结果与分析第107-114页
   ·基因F071 cDNA的克隆及分析第107-111页
     ·5′-RACE和3′-RACE第108页
     ·基因F071核苷酸序列和推导的氨基酸序列分析第108-109页
     ·基因F071核苷酸序列和氨基酸序列比对分析第109-111页
   ·A041 cDNA全长的克隆及分析第111-114页
     ·5′-RACE和3′-RACE第111-112页
     ·A041分子的核苷酸序列和推导的氨基酸序列分析第112页
     ·A041分子的核苷酸序列比对分析第112-114页
 4 讨论第114-117页
   ·蛋白的结构域及其功能位点的预测分析第114页
   ·F071基因与HMG-14基因第114-115页
   ·A041与非编码RNA第115-116页
   ·小结第116-117页
第六章 结论与展望第117-119页
 1 已经取得的结果第117-118页
 2 需进一步研究的工作第118-119页
参考文献第119-131页
在读期间已发表论文题录第131-132页
致谢第132页

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