DNA图谱分析算法与软件研究
第一章 绪论 | 第1-14页 |
§1.1 DNA的结构与功能 | 第8-11页 |
§1.2 DNA测序技术 | 第11-12页 |
§1.3 选题根据与国内外研究现状 | 第12-14页 |
§1.3.1 选题根据 | 第12-13页 |
§1.3.2 国外在图谱分析方面的现状与进展 | 第13页 |
§1.3.3 国内在图谱分析方面的现状 | 第13-14页 |
第二章 系统结构 | 第14-22页 |
§2.1 DNA测序仪的工作原理 | 第14-16页 |
§2.1.1 电泳分离 | 第14-15页 |
§2.1.2 信号检测 | 第15-16页 |
§2.2 DNA测序仪的基本结构 | 第16-19页 |
§2.2.1 荧光激发与检测结构 | 第16-18页 |
§2.2.2 实验装置 | 第18-19页 |
§2.3 DNA图谱处理流程 | 第19-22页 |
§2.3.1 预处理 | 第20页 |
§2.3.2 四色校正 | 第20-21页 |
§2.3.3 后处理 | 第21页 |
§2.3.4 碱基排序 | 第21-22页 |
第三章 预处理 | 第22-38页 |
§3.1 数据段选取 | 第22-23页 |
§3.2 基线调整 | 第23-26页 |
§3.2.1 分段法 | 第23-24页 |
§3.2.2 柱状图法 | 第24-26页 |
§3.3 噪声滤除 | 第26-29页 |
§3.3.1 中值滤波 | 第26-27页 |
§3.3.2 高斯滤波 | 第27-28页 |
§3.3.3 小波滤波 | 第28-29页 |
§3.4 峰值识别 | 第29页 |
§3.5 预处理结果与讨论 | 第29-38页 |
§3.5.1 数据段选取 | 第30页 |
§3.5.2 基线调整 | 第30-31页 |
§3.5.3 噪声滤除 | 第31-37页 |
§3.5.4 峰值识别 | 第37-38页 |
第四章 四色校正 | 第38-49页 |
§4.1 转换模型 | 第38-39页 |
§4.2 串扰矩阵分析 | 第39-44页 |
§4.2.1 峰值法 | 第39-40页 |
§4.2.2 斜率法 | 第40-42页 |
§4.2.3 四维空间聚类法 | 第42-44页 |
§4.3 四色校正结果与讨论 | 第44-49页 |
§4.3.1 斜率法 | 第45页 |
§4.3.2 四维空间聚类法 | 第45-47页 |
§4.3.3 模型改进 | 第47-49页 |
第五章 后处理 | 第49-58页 |
§5.1 去卷积 | 第49-52页 |
§5.2 迁移率校正 | 第52-53页 |
§5.3 归一化 | 第53-54页 |
§5.4 后处理结果与讨论 | 第54-58页 |
§5.4.1 去卷积 | 第54-56页 |
§5.4.2 迁移率校正 | 第56页 |
§5.4.3 归一化 | 第56-58页 |
第六章 结果与讨论 | 第58-65页 |
§6.1 软件界面 | 第58-59页 |
§6.2 软件实现 | 第59-64页 |
§6.2.1 单色图谱 | 第59-61页 |
§6.2.2 四色图谱 | 第61-64页 |
§6.3 总结与展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-68页 |
致谢 | 第68页 |