第一章 前言 | 第1-14页 |
1.1 课题开发的背景,意义及其发展现状 | 第9-12页 |
1.1.1 课题开发的背景 | 第9-10页 |
1.1.2 课题开发的意义 | 第10-11页 |
1.1.3 课题发展的国内外现状 | 第11-12页 |
1.2 课题研究目的 | 第12页 |
1.3 主要工作及本文内容安排 | 第12-14页 |
1.3.1 主要工作 | 第12-13页 |
1.3.2 本文内容安排 | 第13-14页 |
第二章 跨膜蛋白结构预测的相关概念 | 第14-16页 |
2.1 膜蛋白基本概念 | 第14-15页 |
2.2 膜蛋白结构预测的特殊性 | 第15-16页 |
第三章 PRED-TMR算法 | 第16-27页 |
3.1 PRED-TMR算法出现的背景 | 第16页 |
3.2 PRED-TMR算法的概要 | 第16-17页 |
3.3 PRED-TMR算法的流程图 | 第17-18页 |
3.4 PRED-TMR算法的具体实现 | 第18-23页 |
3.5 PRED-TMR算法的测试结果 | 第23-25页 |
3.6 对PRED-TMR算法的讨论 | 第25-27页 |
第四部分 OrtinTM算法 | 第27-37页 |
4.1 OrtinTM算法的出现背景 | 第27页 |
4.2 OrtinTM算法的概要 | 第27-29页 |
4.3 OrtinTM算法的流程图 | 第29-30页 |
4.4 OrtinTM算法的具体实现步骤 | 第30-32页 |
4.5 OrtinTM算法的测试结果以及讨论 | 第32-37页 |
第五章 TMHMM算法 | 第37-53页 |
5.1 TMHMM算法的出现背景 | 第37页 |
5.2 TMHMM算法的概要 | 第37-38页 |
5.3 TMHMM算法的具体步骤 | 第38-43页 |
5.4 TMHMM算法的测试结果以及讨论 | 第43-53页 |
5.4.1 数据集的采集 | 第43-44页 |
5.4.2 介绍交叉验证 | 第44-45页 |
5.4.3 正确与错误预测的分析 | 第45页 |
5.4.4 非膜蛋白和膜蛋白的辨别 | 第45-48页 |
5.4.5 TMHMM在信号酸氨酸和孔蛋白中的测试 | 第48-49页 |
5.4.6 TMHMM在膜蛋白的基因组(尺度和范围)的分析 | 第49-51页 |
5.4.7 TMHMM算法的讨论 | 第51-53页 |
第六章 三种算法的比较及实现 | 第53-63页 |
6.1 三种算法用于三种蛋白质上的测试 | 第53-54页 |
6.2 PRED-TRM算法和TMHMM算法的具体比较 | 第54-58页 |
6.2.1 数据和方法 | 第54-55页 |
6.2.2 对预测方法的比较 | 第55-58页 |
6.3 三种算法在网上的实现 | 第58-63页 |
结论 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-67页 |
声明 | 第67-68页 |
致谢 | 第68页 |