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水稻第四号染色体特异DNA芯片的研制及水稻第四号染色体基因的表达谱和籼粳稻之间差异表达谱分析

目录第1-4页
摘要第4-8页
第一章 用多模板多引 PCR 的方法进行籼稻广陆矮四号第四号染色体物理图克隆延伸第8-39页
 一、引言第8-11页
 二、材料和方法第11-22页
 三、结果第22-34页
  1. 构建混合BAC 质粒的POOLED DNA库第23-24页
  2. 用多模板多引物PCR 鉴定阳性克隆以延伸物理图第24-33页
  3. BAC克隆H418F10 鸟枪法测序第33-34页
 四、讨论第34-39页
  1. 多模板多引物PCR 是延伸籼稻广陆矮四号第四号染色体物理图的一个补充方法第34-35页
  2. 影响多模板多引物PCR 的因素第35-37页
  3. 多模板多引物PCR 是物理图克隆延伸的一种有效手段第37-39页
第二章 利用水稻4 号染色体特异芯片研究粳稻第四号染色体的基因表达谱和粳籼稻之间的表达差异第39-88页
 一、引言第39-44页
 二、材料和方法第44-56页
 三、结果第56-76页
  1. 构建覆盖整条水稻第四号染色体的TILING 芯片第56-58页
  2. 芯片分析结果为大部分水稻四号染色体注释基因提供了表达上的证据第58-62页
  3. 水稻第四号染色体上无注解基因区的转录活性的检测第62页
  4. 组织特异的表达谱反映出水稻的发育和生理特征第62-65页
  5. 发育过程中水稻基因转录事件在染色体水平上可能的调控模式第65-67页
  6. 水稻四号染色体的常染色质区富集了和拟南芥高度同源的基因第67-69页
  7. 转座相关基因在生殖生长期的转录活性增高第69-71页
  8. 日本晴和广陆矮4 号的芯片比较结果提供了水稻第四号染色体上可能的粳籼稻差异表达基因第71-76页
 四、讨论第76-88页
  1. 大规模制备基因组片段PCR 产物的困难第76-78页
  2. 实验设计方案中标记样品没有采用荧光交换的说明第78-80页
  3. 水稻四号染色体tiling 芯片用依次相互重叠的基因组片段覆盖整条染色体第80-82页
  4. 芯片研究是基因注解工作的重要补充第82-83页
  5. 基因转录活性在染色体水平上的调控第83-86页
  6. 日本晴和广陆矮4号的差异表达基因与发育和组织特异性存在相关性第86-88页
结语第88-91页
参考文献第91-104页
发表文章第104-105页
致谢第105-106页

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