| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-14页 |
| 缩略语 | 第14-15页 |
| 前言 | 第15-27页 |
| 1 鼠疫菌的流行概况 | 第15-16页 |
| 2 鼠疫菌的研究概况 | 第16-19页 |
| ·鼠疫菌的生物学特征 | 第16-17页 |
| ·鼠疫菌的毒力因子以及与宿主细胞的相互作用 | 第17-19页 |
| 3 病原与宿主的蛋白相互作用网络 | 第19-22页 |
| 4 鼠疫菌T3SS内蛋白相互作用的研究 | 第22页 |
| 5 LcrG对鼠疫菌T3SS调控作用的研究 | 第22-23页 |
| 6 本研究的目的与主要内容 | 第23-24页 |
| 参考文献 | 第24-27页 |
| 第一章 鼠疫菌毒力相关蛋白与人蛋白相互作用的初步研究 | 第27-72页 |
| 第一部分 鼠疫菌毒力相关蛋白与人蛋白相互作用的筛选及验证 | 第29-51页 |
| 1 实验材料 | 第29-30页 |
| 2 实验方法 | 第30-42页 |
| ·确定可能与人蛋白相互作用的鼠疫菌蛋白 | 第30-31页 |
| ·Y2H系统筛选人脾脏cDNA文库 | 第31-38页 |
| ·Y2H系统筛选结果验证及可信度评价 | 第38-42页 |
| 3 结果 | 第42-48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 第二部分 蛋白相互作用的数据分析、网络构建及功能挖掘 | 第51-71页 |
| 1 分析方法与工作平台 | 第51页 |
| 2 结果与讨论 | 第51-70页 |
| ·鼠疫菌与人 PPI 网络的可视化分析和拓扑结构分析 | 第51-53页 |
| ·鼠疫菌与人 PPI 网络的功能分析 | 第53-59页 |
| ·新相互作用的功能挖掘 | 第59-70页 |
| 小结 | 第70-71页 |
| 参考文献 | 第71-72页 |
| 第二章 鼠疫菌III型分泌系统内蛋白相互作用的研究 | 第72-89页 |
| 1 实验材料 | 第73页 |
| 2 实验方法 | 第73-75页 |
| ·构建酵母克隆 | 第73-74页 |
| ·诱饵和猎物阵列筛选 | 第74-75页 |
| ·验证 | 第75页 |
| 3 实验结果 | 第75-81页 |
| 4 讨论 | 第81-86页 |
| ·伴侣分子和分泌底物的相互作用 | 第82-83页 |
| ·分泌调控复合体的相互作用 | 第83-84页 |
| ·其他相互作用 | 第84-86页 |
| 小结 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-89页 |
| 第三章 鼠疫菌T3SS负调控因子LcrG对T3SS基因表达影响的研究 | 第89-110页 |
| 1 材料与方法 | 第91-97页 |
| ·细菌菌株和细胞培养 | 第91页 |
| ·构建lcrG突变株和lcrG回复株 | 第91-92页 |
| ·肿瘤坏死因子α(TNF-α)分泌实验 | 第92-93页 |
| ·计算鼠疫菌在BALB/c小鼠中的半数致死量 | 第93页 |
| ·鼠疫菌201株和lcrG突变株的比较转录谱学分析 | 第93-95页 |
| ·实时荧光定量PCR分析 | 第95-96页 |
| ·免疫印记分析 | 第96-97页 |
| 2 结果 | 第97-104页 |
| ·lcrG突变株对小鼠和HeLa细胞毒性明显减弱 | 第97-99页 |
| ·Yop毒力元在突变株中上调 | 第99-104页 |
| ·lcrG突变株转录组学可能与毒力减弱相关的其他性质 | 第104页 |
| 3 讨论 | 第104-107页 |
| 小结 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-110页 |
| 附录 | 第110-120页 |
| 附录1：常用试剂配方 | 第110-114页 |
| 附录2：主要仪器设备 | 第114-115页 |
| 附录3: 实验挑选的鼠疫菌诱饵蛋白 | 第115-120页 |
| 综述 | 第120-146页 |
| 个人简历 | 第146-147页 |
| 致谢 | 第147-148页 |
