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应用PCR-DGGE技术研究大麻沤麻系统中的细菌多样性

中文摘要第1-4页
Abstract第4-10页
第1章 绪论第10-24页
   ·大麻简介第10-11页
   ·微生物多样性第11-14页
     ·传统培养法在微生物多样性研究中的应用第11-12页
     ·分子生物学方法在微生物多样性研究中的应用第12-14页
       ·基于分子杂交技术的分子标记第13-14页
       ·基于PCR 的分子标记技术第14页
   ·变性梯度凝胶电泳第14-19页
     ·DGGE 技术的基本原理第15-16页
     ·变性梯度凝胶电泳的操作流程第16-17页
     ·DGGE 图谱的系统优化第17-19页
     ·DGGE 技术应用的局限性第19页
   ·PCR-DGGE 技术在微生物多样性研究中的应用第19-22页
     ·PCR-DGGE 的原理和特点第19-20页
     ·PCR-DGGE 技术在微生物多样性中的应用范畴第20-22页
       ·研究微生物类群的多样性第20-21页
       ·用于环境中微生物变化的动态监测第21页
       ·有助于发现新的微生物第21页
       ·揭示环境中的群落构成以及种群相互间的进化关系第21-22页
     ·PCR-DGGE 技术在沤麻系统中的应用第22页
   ·课题研究的目的和意义第22-24页
第2章 材料与方法第24-43页
   ·试验材料第24-31页
     ·供试材料第24页
     ·供试菌种及质粒第24页
     ·扩增引物第24-25页
     ·主要生化及分子生物学试剂第25-29页
       ·DGGE 制胶所用试剂第25-26页
       ·银染所用试剂第26-27页
       ·细菌鉴定所用试剂第27-28页
       ·利用165 rDNA 方法鉴定时所需试剂第28-29页
     ·培养基及试剂盒第29-30页
       ·培养基第29-30页
       ·试剂盒第30页
     ·实验仪器第30-31页
   ·大麻取样第31-32页
     ·沤麻过程中的采样时间及方法第31页
     ·沤麻液中菌种分离第31-32页
     ·形态特征鉴定和生理生化试验第32页
   ·DGGE 电泳第32-42页
     ·总基因组的提取第32-33页
     ·PCR 扩增过程第33-34页
       ·引物设计第33页
       ·DNA 片段扩增第33-34页
       ·PCR 扩增结果的检测第34页
     ·PCR 产物的回收第34-35页
     ·165 rDNA 序列系统发育分析第35-37页
       ·克隆片段的连接与转化第35-37页
       ·克隆结果的快速检测第37页
       ·测序结果分析第37页
     ·DGGE 条件优化第37-38页
       ·凝胶变性梯度范围和电压的确定第37页
       ·DGGE 上样样品的确定第37-38页
       ·丙烯酰胺浓度的确定第38页
       ·DGGE 时间的确定第38页
     ·DGGE 方法检测第38-41页
       ·胶的准备与灌制第38-39页
       ·胶板电泳前的准备第39-40页
       ·电泳第40页
       ·银染方法检测第40-41页
     ·多样性的研究方法第41-42页
   ·条带的测序第42-43页
     ·变性聚丙烯酰胺凝胶的回收第42页
     ·回收片段的克隆与纯化第42页
     ·克隆片段的连接与转化第42页
     ·克隆结果的快速检测第42-43页
第3章 结果与分析第43-66页
   ·细菌形态多样性统计分析第43-48页
     ·传统可培养法分离大麻沤麻液中菌株第43-45页
     ·不同时段沤麻液的菌群种类与数量的初步统计第45-47页
     ·生理生化试验结果第47-48页
   ·16S rDNA 的PCR 扩增产物分析第48-54页
     ·果胶酶产生菌、甘露聚糖酶产生菌、牛肉膏培养基生长菌基因组DNA提取第48-50页
     ·16S rDNA 的PCR 扩增产物分析第50-51页
     ·克隆片段的连接转化及克隆结果的快速检测第51页
     ·系统发育分析第51-54页
   ·细菌菌群结构分析第54-66页
     ·总基因组DNA 的提取第54页
     ·16S rDNA V3 区PCR 扩增及纯化第54-55页
     ·DGGE 条件优化第55-57页
       ·凝胶变性梯度范围和电压的确定第55-56页
       ·DGGE 上样样品的确定第56-57页
       ·丙烯酰胺浓度的确定第57页
       ·DGGE 时间的确定第57页
     ·DGGE 条带序列分析第57-60页
       ·DGGE 条带的回收与扩增第57-58页
       ·克隆结果检测与单一条带验证第58-59页
       ·测序结果分析第59-60页
     ·DGGE 图谱分析第60-66页
       ·DGGE 图谱的丰度与相似度第60-62页
       ·DGGE 图谱条带的吸光度第62-63页
       ·DGGE 图谱条带的优势度第63-65页
       ·DGGE 图谱条带的多样性指数第65-66页
第4章 讨论第66-72页
   ·课题背景第66页
   ·传统可培养法的细菌鉴定第66-67页
   ·变性梯度凝胶电泳技术第67-72页
     ·PCR-DGGE 分析第67-68页
     ·DGGE 凝胶的制备第68-69页
     ·DGGE 条件优化及银染第69-70页
     ·DGGE 条带序列分析第70-71页
     ·DGGE 图谱分析第71-72页
第5章 结论第72-73页
参考文献第73-83页
致谢第83-84页
攻读学位期间发表的学术论文第84页

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