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拟南芥胁迫诱导microRNA的分离和功能研究及microRNA启动子分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 引言第11-39页
   ·microRNA 研究进展概述第11-28页
     ·microRNA 的发现第11页
     ·microRNA 的概念及特点第11-14页
       ·microRNA 的概念第11页
       ·microRNA 的特点第11-13页
       ·miRNA 与siRNA 的关系第13-14页
     ·microRNA 的生物合成第14-17页
       ·microRNA 的产生及加工成熟过程第14-16页
       ·动、植物microRNA 的产生过程比较第16-17页
     ·microRNA 加工成熟过程中的酶及功能蛋白质第17-19页
       ·Drosha 酶第17页
       ·Dicer(Dicer-like)酶第17-18页
       ·microRNA 加工过程中的辅助蛋白第18-19页
       ·Agonaute 蛋白家族第19页
     ·microRNA 的作用机制第19-20页
       ·miRNA 对靶基因剪切第20页
       ·miRNA 的翻译抑制作用第20页
       ·miRNA 与转录沉默第20页
     ·microRNA 参与的基因表达调控第20-28页
       ·microRNA 与植物的生长发育第21-22页
       ·miRNA 与生长素信号转导第22-23页
       ·microRNA 与植物抗胁迫反应第23-28页
         ·microRNA 与氧化胁迫第23-24页
         ·microRNA 与营养胁迫第24-26页
         ·microRNA 与干旱和盐胁迫第26-27页
         ·microRNA 与抗冷胁迫第27页
         ·其它非生物胁迫调节下的小分子RNA第27-28页
   ·microRNA 相关实验方法第28-35页
     ·miRNA 的分离第28-31页
       ·直接克隆法第28-29页
       ·正向遗传学方法第29页
       ·生物信息学方法第29-31页
         ·miRNA 数据库第29-30页
         ·生物信息学方法预测miRNA第30-31页
     ·miRNA 靶基因的预测及生物学鉴定第31-35页
       ·生物信息学第33-35页
         ·miRU 法第34页
         ·Microlnspector 法第34-35页
       ·mRNA 表达芯片第35页
       ·miRNA 靶基因的生物学验证第35页
   ·microRNA 的启动子研究第35-38页
     ·生物信息学研究第36-37页
     ·生物学研究第37-38页
   ·本课题的目的和意义第38-39页
2 材料与方法第39-49页
   ·实验材料第39-41页
     ·植物材料第39页
     ·菌株与质粒第39页
     ·酶与各种生化试剂第39页
     ·实验用的引物和寡核苷酸第39-41页
   ·实验方法第41-49页
     ·拟南芥miRNA 芯片实验第41-42页
       ·组织块和细胞RNA 的提取第41页
       ·miRNA 的分离第41页
       ·miRNA 样品的荧光标记第41-42页
       ·杂交与清洗第42页
       ·芯片扫描第42页
       ·数据分析第42页
     ·拟南芥miRNA 表达模式的RT-PCR 半定量检测第42-43页
     ·拟南芥miRNA 启动子的克隆第43-46页
       ·DNA 片段与克隆载体的连接第43页
       ·大肠杆菌感受态细胞的制备第43页
       ·大肠杆菌细胞的转化第43-44页
       ·克隆载体的酶切鉴定第44页
       ·质粒DNA 的提取第44-45页
       ·凝胶电泳中DNA 片段的回收第45-46页
       ·拟南芥转化表达载体的构建第46页
     ·植物表达载体的转化第46-47页
       ·根癌农杆菌GV3101 感受态细胞的制备第46页
       ·冻融法转化农杆菌第46-47页
       ·农杆菌的培养第47页
       ·农杆菌介导转化拟南芥第47页
     ·转基因植物的GUS 组织化学染色分析第47-49页
3 结果与分析第49-62页
   ·拟南芥miRNA 表达芯片分析第49-53页
     ·胁迫响应miRNA 的获得第50-53页
     ·胁迫响应miRNA 的分类第53页
   ·芯片结果验证第53-54页
   ·胁迫诱导miRNA 时序性表达分析第54-55页
   ·miRNA 基因前体上游序列分析第55-56页
   ·胁迫诱导miRNA 的启动子分析第56-62页
     ·miRNA 上游序列的分离和表达载体构建第56-57页
     ·转基因拟南芥的获得第57-62页
       ·miRNA 基因上游序列具有启动子活性第57-58页
       ·miRNA 基因启动子调控模式分析第58-62页
4 讨论第62-66页
   ·外源环境胁迫可以诱导miRNA 的表达第62-63页
   ·miRNA 可以同时参与植物的生长发育过程和胁迫响应过程第63-64页
   ·胁迫诱导miRNA 的表达模式可能与其启动子中富含的胁迫响应元件有关第64页
   ·miRNA 上游序列具有启动子活性第64-65页
   ·miRNA 启动子可能具有和功能基因启动子类似的调控模式第65-66页
5 结论第66-67页
6 参考文献第67-80页
7 附录第80-83页
致谢第83-84页
攻读学位期间发表的学术论文:第84页

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