| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| ·水稻Waxy 基因多样性研究进展 | 第13-19页 |
| ·Waxy 基因及其作用 | 第13-14页 |
| ·Waxy 基因的定位和克隆 | 第14-16页 |
| ·Waxy 基因的表达调控研究 | 第16页 |
| ·Waxy 基因在改良稻米品质中的研究与利用 | 第16-18页 |
| ·Waxy 基因在水稻起源进化中的应用 | 第18页 |
| ·Waxy 基因的利用前景 | 第18-19页 |
| ·单核苷酸多态性（SNP）研究进展 | 第19-22页 |
| ·SNP 的概念及特点 | 第19-20页 |
| ·SNP 的发现及检测 | 第20-21页 |
| ·SNP 在植物研究中的应用 | 第21-22页 |
| ·立题的意义和目的 | 第22页 |
| ·本文研究的技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-33页 |
| ·实验材料 | 第23-25页 |
| ·栽培稻来源 | 第23页 |
| ·野生稻来源 | 第23-25页 |
| ·实验方法 | 第25-31页 |
| ·DNA 提取 | 第25-26页 |
| ·Waxy 基因的扩增、检测 | 第26-29页 |
| ·Waxy 基因测序 | 第29-31页 |
| ·直链淀粉含量（AC）的测定 | 第31页 |
| ·数据统计与分析 | 第31-33页 |
| ·序列组装 | 第31页 |
| ·序列比对 | 第31页 |
| ·基因多样性分析 | 第31-32页 |
| ·LD 分析及关联分析 | 第32页 |
| ·系统发育树的构建 | 第32-33页 |
| 第三章 结果与分析 | 第33-55页 |
| ·Waxy 基因的序列多态性分析 | 第33-42页 |
| ·Waxy 基因的SNPs 及InDels | 第33-39页 |
| ·(CT)n 微卫星位点情况及分析 | 第39-41页 |
| ·G/T 多态性位点 | 第41页 |
| ·23bp InDle | 第41-42页 |
| ·Waxy 基因多样性分析 | 第42-44页 |
| ·Waxy 基因的LD 分析及关联分析 | 第44-48页 |
| ·Waxy 基因的LD 分析 | 第44-45页 |
| ·Waxy 基因SNPs 或InDels 与表型直链淀粉含量之间的关联分析 | 第45-48页 |
| ·Waxy 基因系统进化初探 | 第48-55页 |
| ·栽培稻中Waxy 基因位点变异与其地理位置的关系 | 第48-49页 |
| ·栽培稻材料直链淀粉含量与地理的关系 | 第49-50页 |
| ·我国稻种资源Waxy 基因单倍型分析 | 第50-53页 |
| ·我国稻种资源Waxy 基因的DNA 序列聚类分析 | 第53-55页 |
| 第四章 讨论 | 第55-59页 |
| ·我国Waxy 基因多态性及多样性情况 | 第55页 |
| ·Waxy 基因变异位点与表型的关联及其在MAS 育种中的应用 | 第55-56页 |
| ·探索我国Waxy 基因的起源与进化 | 第56-57页 |
| ·我国稻种资源保护的重要性 | 第57-59页 |
| 第五章 全文结论 | 第59-60页 |
| ·我国稻种资源具有较丰富的等位变异，并拥有特有变异 | 第59页 |
| ·G/T 和23bp InDel 多态性位点可作为分子标记用于MAS 育种中 | 第59页 |
| ·我国糯稻变异可能来自广东、广西和海南，支持华南是我国水稻起源中心观点 | 第59页 |
| ·我国野生稻资源和栽培稻地方品种亟待保护 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 作者简历 | 第69页 |
