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食源微生物耐药基因水平传播抑制研究

摘要第1-8页
Abstract第8-16页
第一章 绪论第16-37页
   ·抗生素的使用及其危害第16-18页
     ·抗生素在医疗中的应用第16-17页
     ·抗生素在农业和畜牧业中的应用第17-18页
   ·滥用抗生素的危害第18-20页
     ·抗生素残留第18页
     ·耐药菌的出现第18-20页
   ·细菌的耐药基因传播元件第20-27页
     ·转座子介导的耐药基因传播第20-22页
     ·质粒介导的耐药性第22-23页
     ·整合子系统介导的耐药性第23-27页
   ·RNAi——抑制耐药基因水平传播新途径第27-35页
     ·RNAi的发现第27-28页
     ·RNAi的作用机制及特点第28-31页
     ·siRNA的制备方法第31-34页
     ·RNAi在原核生物细胞中的应用前景第34-35页
   ·本项目的研究意义和必要性第35-37页
第二章 整合子介导的耐药基因体外水平传播第37-58页
   ·引言第37-38页
   ·实验材料与设备第38-42页
     ·主要仪器设备第38-39页
     ·主要试剂第39页
     ·实验质粒和菌株第39-40页
     ·实验引物第40页
     ·培养基和常用溶液配制第40-42页
   ·实验过程与方法第42-50页
     ·实验流程第42页
     ·实验方法第42-45页
     ·质粒DNA的提取第45-46页
     ·体外耐药基因水平传播实验第46页
     ·PCR验证整合菌株第46-49页
     ·DNA测序及序列解析第49-50页
     ·整合率的测定第50页
   ·结果与讨论第50-57页
     ·转化R388 进入BL21(DE3)中第50-51页
     ·转化pGC系列质粒进入DH5α中第51-52页
     ·接合实验第52-53页
     ·实验PCR扩增结果第53-54页
     ·耐药基因盒体外整合实验PCR扩增产物测序比对结果分析第54-56页
     ·整合效率的测定第56-57页
   ·本章小结第57-58页
第三章 整合子介导的耐药基因在体内小鼠肠道中的传播第58-75页
   ·引言第58-59页
   ·实验材料与设备第59-61页
     ·主要仪器设备第59页
     ·主要试剂第59-60页
     ·实验动物第60页
     ·实验质粒和菌株第60页
     ·实验引物第60页
     ·培养基和常用溶液配制第60-61页
   ·实验流程第61页
   ·实验方法第61-64页
     ·实验对象分组第61-62页
     ·接种第62页
     ·小鼠一般表现观察第62页
     ·收集样本第62页
     ·提取质粒第62-63页
     ·耐药基因盒的体内整合实验第63页
     ·整合产物的PCR验证第63页
     ·PCR产物的纯化第63页
     ·DNA测序及其序列分析第63-64页
     ·整合率的测定第64页
   ·结果与讨论第64-73页
     ·筛选合格小鼠第64-66页
     ·供体菌在小鼠肠道中定殖验证第66-67页
     ·接合菌株质粒提取第67-68页
     ·耐药基因盒在小鼠肠道整合实验PCR扩增结果第68-70页
     ·PCR扩增产物测序比对结果分析第70-71页
     ·整合菌株在小鼠肠道中的稳定性第71-72页
     ·耐药基因在体内和体外的整合效率比较第72-73页
   ·本章小结第73-75页
第四章 siRNA干扰整合子介导的耐药基因水平传播效率第75-86页
   ·引言第75-76页
   ·实验材料与设备第76-78页
     ·主要仪器设备第76页
     ·主要试剂第76-77页
     ·实验引物第77页
     ·实验质粒和菌株第77页
     ·siRNA实验原理第77-78页
     ·培养基和常用溶液配制第78页
   ·实验过程和方法第78-81页
     ·siRNA的设计第78-80页
     ·实验流程第80页
     ·实验方法第80页
     ·抗生素筛选第80-81页
     ·PCR验证第81页
     ·整合率的测定第81页
     ·siRNA的抑制效率第81页
   ·结果与讨论第81-84页
     ·筛选高活性siRNA第81-82页
     ·siRNA的使用量第82-83页
     ·siRNA的加入方式第83-84页
     ·共培养时间第84页
   ·本章小结第84-86页
第五章 Real-time PCR检测siRNA对整合效率和intI1 mRNA水平的影响第86-102页
   ·引言第86页
   ·实验设备与材料第86-89页
     ·主要材料与设备第86-87页
     ·主要试剂第87页
     ·实验菌株和质粒第87-88页
     ·实验引物和实验用siRNA第88页
     ·培养基和常用溶液配制第88-89页
   ·实验流程第89-90页
     ·实验前准备第89-90页
     ·实验流程第90页
   ·实验方法第90-94页
     ·质粒标准品的构建第90-93页
     ·RNA的提取第93页
     ·总质粒的提取第93页
     ·Real-time PCR第93-94页
   ·结果与讨论第94-100页
     ·总RNA的提取第94-95页
     ·相对定量检测siRNA对整合效率的影响第95-96页
     ·siRNA对intI1 mRNA水平的影响第96页
     ·绝对定量测定整合效率第96-100页
   ·本章小结第100-102页
结论与展望第102-105页
 结论第102-103页
 创新点第103-104页
 展望第104-105页
参考文献第105-115页
附录第115-118页
攻读博士学位期间取得的研究成果第118-119页
致谢第119页

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