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以LpxC为靶标的抑制剂N-Hydroxyamide衍生物的设计,合成及结构—抗菌活性关系研究

提要第1-5页
摘要第5-7页
Abstract第7-14页
第一章 绪论第14-30页
   ·抗生素治疗的重要性第14-15页
   ·作为抗生素靶点的脂质A 的生物合成路线第15-20页
     ·脂质A(Lipid A)的生物合成路线第16-17页
     ·LpxC 脱乙酰酶的抑制剂第17-20页
   ·LpxC 脱乙酰酶的结构第20-23页
     ·LpxC 脱乙酰酶的基因序列第20-21页
     ·LpxC 脱乙酰酶的结构第21-22页
     ·LpxC 脱乙酰酶的活性部位(active site)第22-23页
   ·LpxC 脱乙酰酶的催化机理第23-24页
   ·LpxC 脱乙酰酶的结合模式(binding model)第24-28页
     ·LpxC 脱乙酰酶与抑制剂TU-514 的结合体在溶液中的结构第24-25页
     ·LpxC 脱乙酰酶与抑制剂BB-78485 结合体的晶体结构第25-26页
     ·Aquifex aeolicus LpxC 脱乙酰酶与抑制剂CHIR-090 结合体的结构第26-28页
   ·设计优化 LpxC 脱乙酰酶抑制剂的机遇与挑战第28-29页
   ·本论文的研究目的和工作意义第29-30页
第二章 LpxC 脱乙酰酶与抑制剂的结合体的结构研究第30-50页
   ·以丁二炔基为骨架的化合物有效地抑制 LpxC 脱乙酰酶第30-32页
   ·LPC-009 抑制剂和 EcLpxC 脱乙酰酶结合体的晶体结构第32-36页
   ·不同 LpxC 脱乙酰酶的内在构向差异第36-39页
     ·插入区I(Insert I)和活性部位的差异第36-37页
     ·插入区II(Insert II)基质结合通道的差异第37-39页
   ·配体引起的 LpxC 脱乙酰酶构向变化第39页
   ·结果与讨论第39-41页
   ·研究意义第41-42页
   ·实验部分第42-50页
     ·抑制剂的合成第42-47页
     ·蛋白提纯第47页
     ·酶的抑制活性测试第47-48页
     ·最低抑菌浓度(MICs)测试第48页
     ·蛋白结晶和X-ray 数据收集第48-49页
     ·晶体结构的解析和精修第49-50页
第三章 以丁二炔为骨架的 LpxC 脱乙酰酶的抑制剂的合成及结构-抑制活性关系研究第50-76页
   ·LPC-009 衍生物的合成第50-54页
   ·结构-活性之间的关系(SAR)第54-60页
     ·远端苯环的修饰第54-59页
     ·苏氨酸基团立体化学第59-60页
   ·讨论与结论第60-62页
   ·实验部分第62-76页
     ·抑制剂合成第62-72页
     ·E. coli W3110PA 的构建第72-73页
     ·最底抑菌浓度(MICs)的测定第73页
     ·蛋白的纯化及酶抑制性的测试第73页
     ·X-ray 晶体结构第73-76页
第四章 以 LpxC 为靶标的 LPC-011 衍生物的合成及其结构-抑菌活性关系第76-110页
   ·LPC-011 衍生物的合成第76-84页
   ·结构与抗菌性之间的关系第84-86页
   ·小结第86页
   ·实验部分第86-110页
     ·最低抑菌浓度测试(MICs )第86页
     ·抑制剂的合成第86-110页
第五章 结论第110-114页
   ·耐药性的产生及发展历程第110-111页
   ·抑制剂的研发第111-114页
参考文献第114-120页
攻读博士学位期间已发表及待发表的论文第120-122页
致谢第122-124页
作者简历第124-126页
附录第126-212页

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