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基于CRISPR/CAS9技术的EML4-ALK融合基因检测参考物质研究

英文缩略词第7-9页
中文摘要第9-11页
英文摘要第11-12页
前言第13-17页
1. 材料和方法第17-69页
    1.1 实验材料和试剂配制第17-29页
        1.1.1 实验仪器第17-18页
        1.1.2 实验耗材第18-19页
        1.1.3 实验试剂第19-22页
        1.1.4 溶液配制第22-26页
        1.1.5 细胞系第26页
        1.1.6 菌株及载体第26-29页
        1.1.7 实验动物第29页
    1.2 实验方法第29-69页
        1.2.1 HEK293T细胞系及各非小细胞肺癌细胞系的培养第29-32页
            1.2.1.1 细胞复苏第29-30页
            1.2.1.2 细胞换液第30页
            1.2.1.3 细胞计数及传代第30-32页
            1.2.1.4 细胞冻存第32页
        1.2.2 HEK293T细胞系EML4-ALK融合基因状态验证第32-34页
            1.2.2.1 HEK293T、H3122及H2228细胞总RNA提取第32-33页
            1.2.2.2 RT-qPCR方法验证HEK293T细胞EML4-ALK融合基因状态第33-34页
        1.2.3 CRISPR/Cas9技术构建EML4-ALK融合基因阳性细胞系第34-55页
            1.2.3.1 靶位点选择及sgRNA设计第34-38页
            1.2.3.2 CRISPR/Cas9表达载体的构建及鉴定第38-42页
            1.2.3.3 携带不同sgRNA的CRISPR/Cas9表达载体筛选第42-48页
            1.2.3.4 EML4-ALK融合基因阳性混合克隆制备及验证第48-54页
            1.2.3.5 EML4-ALK融合基因阳性单克隆细胞筛选第54-55页
        1.2.4 基于CRISPR/Cas9技术构建的EML4-ALK融合基因阳性细胞系验证第55-60页
            1.2.4.1 DNA水平验证第55页
            1.2.4.2 RNA水平验证第55-56页
            1.2.4.3 蛋白水平验证第56-60页
        1.2.5 携带相关EML4-ALK融合基因的异种移植动物模型建立第60-61页
            1.2.5.1 实验动物的准备第60页
            1.2.5.2 接种细胞悬液制备第60-61页
            1.2.5.3 动物接种第61页
            1.2.5.4 异种移植成瘤观察及动物处死第61页
        1.2.6 新型EML4-ALK融合基因参考物质制备及验证第61-68页
            1.2.6.1 新型EML4-ALK融合基因参考物质制备第62-63页
            1.2.6.2 新型EML4-ALK融合基因参考物质IHC方法验证第63-64页
            1.2.6.3 新型EML4-ALK融合基因参考物质FISH方法验证第64-65页
            1.2.6.4 新型EML4-ALK融合基因参考物质RT-qPCR方法验证第65-66页
            1.2.6.5 新型EML4-ALK融合基因参考物质NGS方法验证第66-68页
        1.2.7 新型EML4-ALK融合基因参考物质均一性及稳定性探究第68-69页
            1.2.7.1 新型EML4-ALK融合基因参考物质均一性研究第68页
            1.2.7.2 新型EML4-ALK融合基因参考物质稳定性研究第68-69页
2. 结果第69-107页
    2.1 HEK293T细胞系及各非小细胞肺癌细胞系的培养及EML4-ALK融合基因状态验证第69-71页
        2.1.1 HEK293T细胞系及各非小细胞肺癌细胞系的培养第69-70页
        2.1.2 HEK293T细胞系EML4-ALK融合基因状态验证第70-71页
    2.2 CRISPR/CAS9技术构建EML4-ALK融合基因阳性细胞系第71-94页
        2.2.1 EML4-ALK融合基因靶向sgRNA设计第71-72页
        2.2.2 pX330载体验证第72-73页
        2.2.3 pX330-sgRNA重组质粒载体验证第73-79页
        2.2.4 pX330-sgRNA重组质粒载体筛选第79-84页
        2.2.5 混合克隆制备及验证第84-88页
        2.2.6 单克隆细胞筛选第88-94页
    2.3 新型EML4-ALK融合基因阳性细胞系验证第94-99页
        2.3.1 DNA水平验证第94-96页
        2.3.2 RNA水平验证第96-98页
        2.3.3 蛋白质水平验证第98-99页
    2.4 异种移植动物模型建立第99-100页
    2.5 新型EML4-ALK融合基因参考物质制备及验证第100-105页
        2.5.1 新型EML4-ALK融合基因参考物质制备第100-101页
        2.5.2 新型EML4-ALK融合基因参考物质IHC方法验证第101-102页
        2.5.3 新型EML4-ALK融合基因参考物质FISH方法验证第102-103页
        2.5.4 新型EML4-ALK融合基因参考物质RT-qPCR方法验证第103-104页
        2.5.5 新型EML4-ALK融合基因参考物质NGS方法验证第104-105页
    2.6 新型EML4-ALK融合基因参考物质均一性及稳定性探究第105-107页
        2.6.1 新型EML4-ALK融合基因参考物质均一性验证第105-106页
        2.6.2 新型EML4-ALK融合基因参考物质稳定性验证第106-107页
3. 讨论第107-110页
参考文献第110-115页
论文综述第115-140页
    References第133-140页
附录第140-181页
    附录1 PX330载体信息第140-146页
        1. pX330载体结构第140页
        2. pX330载体位点第140-141页
        3. pX330载体序列第141-146页
    附录2 PEGFP-1载体信息第146-150页
        1. pEGFP-1载体结构第146页
        2. pEGFP-1载体位点第146-147页
        3. pEGFP-1载体序列第147-150页
    附录3 PMD18-T载体信息第150-153页
        1. pMD18-T载体结构第150页
        2. pMD18-T载体位点第150页
        3. pMD18-T载体序列第150-153页
    附录4 EML4-ALK融合基因V1型、V2型及V3型MRNA序列信息第153-161页
        1. EML4-ALK融合基因V1型mRNA序列信息第153-155页
        2. EML4-ALK融合基因V2型mRNA序列信息第155-157页
        3. EML4-ALK融合基因V3a型mRNA序列信息第157-158页
        4. EML4-ALK融合基因V3b型mRNA序列信息第158-161页
    附录5 EML4基因及ALK基因MRNA序列信息第161-168页
        1. EML4基因mRNA序列信息第161-163页
        2. ALK基因mRNA序列信息第163-168页
    附录6 EML4基因INTRON 13/INTRON 20/INTRON 6及ALK基因INTRON 19序列信息第168-181页
        1. EML4基因intron 13序列信息第168-170页
        2. EML4基因intron 20序列信息第170-171页
        3. EML4基因intron 6序列信息第171-179页
        4. ALK基因intron 19序列信息第179-181页
致谢第181-183页
个人简介第183-184页

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