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离心操控的微液滴快速生成新方法及其在单分子单细胞核酸分析中的应用

摘要第11-12页
Abstract第12页
第一章 绪论第13-40页
    1.1 核酸分子检测技术的发展与应用第13-26页
        1.1.1 PCR技术的发展概述第13-17页
        1.1.2 微流控技术在dPCR的发展与应用第17-26页
    1.2 单细胞全基因组研究技术发展第26-37页
        1.2.1 单细胞的研究意义第26-29页
        1.2.2 单细胞全基因组扩增方法第29-37页
    1.3 本论文的研究设计第37-40页
第二章 基于离心力驱动的微液滴生成新方法第40-57页
    2.1 引言第40-43页
    2.2 实验材料第43页
    2.3 实验方法第43-49页
        2.3.1 掩膜板的设计与制作第43-44页
        2.3.2 SU-8模具制作第44-46页
        2.3.3 PDMS芯片制作第46-47页
        2.3.4 基于离心式芯片的液滴生成过程第47-48页
        2.3.5 液滴大小的影响因素考察及不同直径液滴生成第48-49页
    2.4 结果与讨论第49-56页
        2.4.1 芯片的制作结果第49-50页
        2.4.2 基于离心式芯片的液滴生成效果第50-51页
        2.4.3 芯片中液滴稳定性验证结果第51-53页
        2.4.4 离心转速与通道几何结构对液滴直径的影响结果第53-56页
    2.5 本章小结第56-57页
第三章 基于离心式微液滴芯片的单分子核酸检测第57-71页
    3.1 引言第57-58页
    3.2 实验材料第58-59页
    3.3 实验方法第59-62页
        3.3.1 芯片制作第59-60页
        3.3.2 PCR反应体系配置第60-61页
        3.3.3 PCR反应体系的液滴生成与芯片密封第61-62页
        3.3.4 芯片上的液滴PCR第62页
        3.3.5 液滴荧光成像与数据分析第62页
    3.4 结果与讨论第62-69页
        3.4.1 PCR反应体系在芯片上的液滴生成结果第62-63页
        3.4.2 PCR变温条件下液滴在芯片中的稳定性考察结果第63-64页
        3.4.3 芯片上液滴PCR数据处理与分析第64-66页
        3.4.4 ddPCR与Q-PCR对比第66-67页
        3.4.5 变体积液滴芯片设计第67-69页
    3.5 本章小结第69-71页
第四章 离心式微液滴芯片在单细胞全基因组扩增中的应用第71-85页
    4.1 引言第71-72页
    4.2 实验材料第72-73页
    4.3 实验方法第73-78页
        4.3.1 芯片制作与处理第73-74页
        4.3.2 单细胞挑取、裂解及扩增体系配置第74-75页
        4.3.3 标准MDA与液滴内MDA的单细胞全基因组扩增第75-76页
        4.3.4 液滴破乳回收第76页
        4.3.5 琼脂糖凝胶电泳第76页
        4.3.6 扩增产物测序第76-78页
    4.4 结果与讨论第78-83页
        4.4.1 液滴内单细胞全基因组扩增动力学过程表征第78-79页
        4.4.2 液滴内单细胞全基因组扩增背景DNA污染表征第79-80页
        4.4.3 液滴内单细胞全基因组扩增的琼脂糖凝胶电泳表征第80页
        4.4.4 测序质量评估及覆盖度对比分析第80-82页
        4.4.5 液滴内单细胞全基因组MDA与传统MDA扩增偏差对比第82-83页
    4.5 本章小结第83-85页
第五章 结论与展望第85-87页
参考文献第87-97页
作者攻读硕士期间发表论文第97-98页
致谢第98页

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