| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 绪论 | 第13-27页 |
| 1.1 研究背景 | 第13-15页 |
| 1.2 机械力调控的细胞粘附分子 | 第15-17页 |
| 1.3 单链DNA与单链DNA结合蛋白的相互作用 | 第17-18页 |
| 1.4 分子动力学模拟方法 | 第18-25页 |
| 1.4.1 蛋白质粗粒化模型 | 第20-21页 |
| 1.4.2 配体粗粒化模型 | 第21-23页 |
| 1.4.3 DNA粗粒化模型 | 第23-25页 |
| 1.5 论文结构 | 第25-27页 |
| 2 力信号调控的细胞粘附蛋白CD44逆锁键效应产生机制研究 | 第27-41页 |
| 2.1 引言 | 第27-28页 |
| 2.2 模型建立 | 第28-31页 |
| 2.2.1 CD44受体蛋白结构 | 第28页 |
| 2.2.2 双势阱模型 | 第28-30页 |
| 2.2.3 配体相互作用 | 第30-31页 |
| 2.2.4 反应坐标定义 | 第31页 |
| 2.3 模型参数优化 | 第31-34页 |
| 2.3.1 透明质酸配体在CD44受体蛋白不同构象下的结合寿命 | 第32-33页 |
| 2.3.2 CD44受体蛋白核心结构域构象变化 | 第33-34页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第34-37页 |
| 2.5 总结 | 第37-41页 |
| 3 单链DNA在结合蛋白的折叠组装动力学及其力学调控研究 | 第41-53页 |
| 3.1 引言 | 第41-42页 |
| 3.2 模型建立 | 第42-45页 |
| 3.2.1 DNA相互作用 | 第42-43页 |
| 3.2.2 反应坐标定义 | 第43-45页 |
| 3.2.3 体系结构 | 第45页 |
| 3.3 模型参数优化 | 第45-47页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第47-50页 |
| 3.4.1 ssDNA的折叠组装过程模拟 | 第47-49页 |
| 3.4.2 力学调控的ssDNA折叠组装过程模拟 | 第49-50页 |
| 3.5 总结 | 第50-53页 |
| 4 总结与展望 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录A 科研成果 | 第63-64页 |
