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四膜虫捕食对嗜水气单胞菌群体与基因转录水平的影响

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一篇 文献综述第11-38页
    第一章 嗜水气单胞菌毒力因子研究进展第11-22页
        1 病原学第11页
        2 嗜水气单胞菌的毒力因子第11-15页
            2.1 黏附因子第12-14页
            2.2 胞外产物第14页
            2.3 分泌系统第14-15页
            2.4 铁离子获取系统第15页
            2.5 群体感应系统第15页
        3 小结第15-17页
        参考文献第17-22页
    第二章 原生动物与细菌的相互关系第22-38页
        1 自由生活原生动物第22-24页
            1.1 自由生活原生动物的定义及其形态学第22-23页
            1.2 自由生活原生动物在生态学中的重要性第23-24页
            1.3 自由生活原生动物在自然环境和人类生存环境中的分布第24页
        2 常见的与细菌互作的原生动物第24-25页
            2.1 棘阿米巴第25页
            2.2 四膜虫第25页
        3 细菌在原生动物中的生活史第25-26页
        4 环境和生物因素影响原生动物内细菌存活第26-27页
        5 细菌与原生动物之间的相互作用第27-30页
            5.1 自由生活原生动物成为细菌的环境“储存器”第27页
            5.2 环境中细菌通过自由生活原生动物传播第27-28页
            5.3 自由生活原生动物是细菌的传播载体或“特洛伊木马”第28页
            5.4 细菌毒力增强第28页
            5.5 原生动物胞内细菌受到保护第28-30页
        参考文献第30-38页
第二篇 试验研究第38-94页
    第三章 嗜水气单胞菌不同毒力菌株与四膜虫共培养过程中的相互作用第38-52页
        1 材料与方法第39-41页
            1.1 试验菌株、虫株、实验动物第39页
            1.2 培养基、试剂及仪器第39-40页
            1.3 嗜水气单胞菌对斑马鱼毒力测定第40页
            1.4 虫菌共培养对嗜水气单胞菌群体生长的影响第40-41页
            1.5 虫菌共培养对四膜虫群体生长的影响第41页
            1.6 细菌上清对四膜虫群体生长的影响第41页
            1.7 统计学分析第41页
        2 结果第41-47页
            2.1 嗜水气单胞菌LD_(50)测定第41-42页
            2.2 虫菌共培养对嗜水气单胞菌群体生长的影响第42-45页
            2.3 虫菌共培养对四膜虫群体生长的影响第45-46页
            2.4 细菌上清对四膜虫群体生长的影响第46-47页
        3 讨论第47-49页
        参考文献第49-52页
    第四章 四膜虫捕食对嗜水气单胞菌不同毒力菌株虫体内存活的影响第52-64页
        1 材料与方法第53-55页
            1.1 试验菌株、虫株及其来源第53页
            1.2 培养基、试剂及仪器第53-54页
            1.3 绿色荧光蛋白标记嗜水气单胞菌第54页
            1.4 四膜虫与Ah~(GFP)共培养第54-55页
            1.5 四膜虫中细菌细胞活性检测第55页
            1.6 透射电镜观察第55页
        2 结果第55-58页
            2.1 绿色荧光蛋白标记嗜水气单胞菌第55-56页
            2.2 四膜虫捕食嗜水气单胞菌第56-57页
            2.3 细菌在四膜虫中的命运第57-58页
        3 讨论第58-60页
        参考文献第60-64页
    第五章 SCOTS筛选嗜水气单胞菌暴露在四膜虫环境中的差异转录基因第64-94页
        1 材料与方法第65-76页
            1.1 试验菌株、虫株及其来源第65页
            1.2 工具酶和试剂第65-66页
            1.3 主要仪器第66页
            1.4 引物设计第66-67页
            1.5 嗜水气单胞菌NJ-35基因组DNA的提取第67-68页
            1.6 生物素标记嗜水气单胞菌NJ-35基因组第68页
            1.7 嗜水气单胞菌NJ-35 16S rDNA和23S rDNA的扩增第68-69页
            1.8 嗜水气单胞菌NJ-35 rDNA的扩增产物连接pMD19-T vector第69页
            1.9 超声破碎生物素标记的NJ-35基因组DNA和rDNA重组质粒第69页
            1.10 四膜虫捕食嗜水气单胞菌NJ-35样品的采集第69-70页
            1.11 总RNA的提取第70-71页
            1.12 合成双链cDNA第71-72页
            1.13 双扩增和回收链cDNA第72页
            1.14 选择性捕获转录序列(SCOTS)第72-75页
            1.15 PCR鉴定SCOTS克隆第75页
            1.16 斑点杂交筛选阳性克隆第75-76页
            1.17 阳性SCOTS克隆的测序和分析第76页
            1.18 实时定量PCR验证差异表达的基因第76页
        2 结果第76-86页
            2.1 嗜水气单胞菌NJ-35基因组的提取第76-77页
            2.2 嗜水气单胞菌NJ-35 rDNA的扩增及克隆载体的构建第77页
            2.3 嗜水气单胞菌NJ-35基因组DNA及rDNA重组质粒的破碎第77-78页
            2.4 双链cDNA的PCR扩增第78-79页
            2.5 SCOTS结果第79-80页
            2.6 差异转录基因的克隆第80-81页
            2.7 斑点杂交筛选第81页
            2.8 差异转录基因的Real-time RT-PCR验证第81-82页
            2.9 差异转录基因的分类和功能注释第82-86页
        3 讨论第86-89页
        参考文献第89-94页
全文总结第94-96页
硕士期间发表的论文第96-98页
致谢第98页

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