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大黄鱼Rab相关基因的分子特征及功能研究

摘要第4-6页
abstract第6-8页
第1章 引言第15-21页
    1.1 大黄鱼简介第15-16页
        1.1.1 大黄鱼综合概述第15页
        1.1.2 营养和经济价值第15页
        1.1.3 大黄鱼养殖概况第15-16页
        1.1.4 主要病害第16页
    1.2 鱼类免疫系统的研究第16-17页
        1.2.1 免疫组织及免疫器官第16-17页
        1.2.2 免疫应答系统第17页
    1.3 Rab GTPase研究现状第17-20页
        1.3.1 小G蛋白研究进展第17-18页
        1.3.2 Rab GTPase在免疫中的作用第18-19页
        1.3.3 Rab5A研究现状第19页
        1.3.4 Rab11研究现状第19页
        1.3.5 Rab13研究现状第19-20页
    1.4 本论文研究目的及意义第20-21页
第2章 Rab5A分子特征和功能研究第21-55页
    2.1 材料第21-24页
        2.1.1 实验动物第21页
        2.1.2 免疫刺激剂第21页
        2.1.3 菌株和质粒第21-22页
        2.1.4 主要试剂和药品第22页
        2.1.5 其他试剂配制第22-23页
        2.1.6 引物第23-24页
        2.1.7 仪器设备第24页
    2.2 实验方法第24-34页
        2.2.1 总RNA的提取和检测第24-25页
        2.2.2 c DNA第一条链的纯化第25页
        2.2.3 目的片段特异性扩增第25页
        2.2.4 割胶纯化目的片段第25-26页
        2.2.5 质粒提取第26页
        2.2.6 目的基因与质粒的重组第26页
        2.2.7 大肠杆菌感受态制备第26-27页
        2.2.8 原核表达目的基因第27-28页
        2.2.9 生物信息学分析第28页
        2.2.10 孵化刺激隐核虫第28页
        2.2.11 刺激隐核虫感染大黄鱼第28页
        2.2.12 免疫攻毒实验第28-29页
        2.2.13 荧光定量PCR反应条件第29页
        2.2.14 重组蛋白纯化第29-30页
        2.2.15 制备多克隆抗体第30页
        2.2.16 Protein A法纯化抗血清第30-31页
        2.2.17 酶联免疫分析(ELISA)第31页
        2.2.18 Western Blot蛋白检测第31-33页
        2.2.19 免疫电镜第33页
        2.2.20 GST pull-down assay第33-34页
        2.2.21 蛋白质质谱检测分析第34页
    2.3 结果与分析第34-54页
        2.3.1 大黄鱼总RNA的提取与检测第34-35页
        2.3.2 大黄鱼Rab5A基因ORF扩增第35页
        2.3.3 Rab5A基因序列特征第35-37页
        2.3.4 大黄鱼Rab5A氨基酸结构及功能分析第37页
        2.3.5 Rab5A的进化分析第37-40页
        2.3.6 熔解曲线分析第40-41页
        2.3.7 大黄鱼Rab5A基因的组织表达谱第41页
        2.3.8 刺激隐核虫感染后大黄鱼Rab5A基因在组织中表达变化第41-42页
        2.3.9 免疫刺激后大黄鱼Rab5A基因组织表达差异情况第42-44页
        2.3.10 大黄鱼Rab5A基因ORF扩增第44页
        2.3.11 pGEX-4T-2 表达质粒提取第44页
        2.3.12 菌落PCR鉴定重组菌株第44-45页
        2.3.13 重组质粒双酶切鉴定第45-46页
        2.3.14 菌落测序第46页
        2.3.15 融合蛋白表达的分析第46-47页
        2.3.16 融合蛋白的可溶性分析第47-48页
        2.3.17 融合蛋白纯化第48页
        2.3.18 抗体制备第48-49页
        2.3.19 抗体的效价测定第49-50页
        2.3.20 Western blot鉴定Rab5A蛋白在大黄鱼各组织中的表达谱第50页
        2.3.21 Western blot分析免疫刺激后大黄鱼Rab5A蛋白的表达变化第50-51页
        2.3.22 GST pull-down assay第51-52页
        2.3.23 Rab5A互作蛋白质谱分析第52页
        2.3.24 大黄鱼Rab5A蛋白的亚细胞定位第52-54页
    2.4 讨论第54-55页
第3章 Rab11分子特征和功能研究第55-66页
    3.1 材料第55-56页
        3.1.1 实验动物第55页
        3.1.2 免疫刺激剂第55页
        3.1.3 菌株和质粒第55页
        3.1.4 主要试剂和药品第55页
        3.1.5 其他配制试剂第55页
        3.1.6 引物第55-56页
        3.1.7 仪器设备第56页
    3.2 实验方法第56-57页
        3.2.1 总RNA的提取和检测第56页
        3.2.2 c DNA第一条链的合成与纯化第56页
        3.2.3 目的片段特异性扩增第56页
        3.2.4 割胶纯化目的片段第56页
        3.2.5 生物信息学分析第56页
        3.2.6 免疫相关研究第56-57页
    3.3 结果与分析第57-64页
        3.3.1 大黄鱼Rab11基因ORF扩增第57页
        3.3.2 Rab11基因序列特征第57-59页
        3.3.3 大黄鱼Rab11氨基酸结构及功能分析第59页
        3.3.4 Rab11的进化分析第59-61页
        3.3.5 熔解曲线分析第61-62页
        3.3.6 大黄鱼Rab11基因的组织表达谱第62页
        3.3.7 刺激隐核虫感染后大黄鱼Rab11基因在组织中表达变化第62-63页
        3.3.8 免疫刺激后大黄鱼Rab11基因在各组织中差异表达情况第63-64页
    3.4 讨论第64-66页
第4章 Rab13分子特征和功能研究第66-79页
    4.1 材料第66-67页
        4.1.1 实验动物第66页
        4.1.2 免疫刺激剂第66页
        4.1.3 菌株和质粒第66页
        4.1.4 主要试剂和药品第66页
        4.1.5 其他配制试剂第66页
        4.1.6 引物第66-67页
        4.1.7 仪器设备第67页
    4.2 实验方法第67-68页
        4.2.1 总RNA的提取和检测第67页
        4.2.2 cDNA第一条链的纯化第67页
        4.2.3 3'RACE和目的片段特异性扩增第67-68页
        4.2.4 割胶纯化目的片段第68页
        4.2.5 生物信息学分析第68页
        4.2.6 免疫相关研究第68页
    4.3 结果与分析第68-78页
        4.3.1 大黄鱼Rab13基因 3` RACE扩增第68-69页
        4.3.2 大黄鱼Rab13基因ORF扩增第69-70页
        4.3.3 Rab13基因序列特征第70-71页
        4.3.4 大黄鱼Rab13氨基酸结构及功能分析第71页
        4.3.5 Rab13的进化分析第71-73页
        4.3.6 熔解曲线分析第73-74页
        4.3.7 大黄鱼Rab13基因的组织表达谱第74-75页
        4.3.8 刺激隐核虫感染后大黄鱼Rab13基因在组织中表达变化第75页
        4.3.9 免疫刺激后大黄鱼Rab13基因在各组织中差异表达情况第75-77页
        4.3.10 亚细胞定位大黄鱼Rab13蛋白第77-78页
    4.4 讨论第78-79页
第5章 总结第79-81页
    5.1 结论第79页
    5.2 创新点第79页
    5.3 展望第79-81页
致谢第81-82页
参考文献第82-89页
在学期间发表的学术论文第89页

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