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基于液相—串联质谱联用技术的靶向氨基酸代谢组学发现结直肠癌诊断的生物标志物

摘要第10-13页
Abstract第13-16页
缩略词表第17-21页
第一章 前言第21-27页
    1 课题研究背景第21-25页
        1.1 结直肠癌简介,以及流行病学现状第21页
        1.2 结直肠癌检诊、监测的重要意义,以及存在的问题第21-22页
        1.3 基于代谢组学研究肿瘤标志物的依据、方法及临床意义第22-23页
        1.4 结直肠癌氨基酸代谢组学的研究现状第23-25页
    2 课题研究意义第25-26页
    3 课题研究内容第26-27页
第二章 结直肠癌组织氨基酸的液相-串联质谱联用检测方法的建立第27-65页
    1 引言第27页
    2 实验仪器与材料第27-33页
        2.1 仪器第27-28页
        2.2 试剂与耗材第28页
        2.3 氨基酸对照品第28-33页
        2.4 组织样本第33页
    3 液相-串联质谱联用检测方法第33-43页
        3.1 相关溶液的配制及前处理第33-35页
            3.1.1 氨基酸对照品储备溶液的配制第33页
            3.1.2 内标氨基酸对照品储备溶液的配制第33页
            3.1.3 工作溶液的配制第33-34页
            3.1.4 标准曲线工作溶液的配制第34页
            3.1.5 标准曲线工作溶液的前处理第34-35页
            3.1.6 质量控制样本的配制第35页
            3.1.7 质量控制样本的前处理第35页
        3.2 色谱条件第35-36页
        3.3 质谱条件第36-40页
        3.4 组织样本的前处理第40页
        3.5 方法学验证第40-43页
            3.5.1 选择性第40页
            3.5.2 定量下限与检测限第40-41页
            3.5.3 线性与浓度范围第41页
            3.5.4 提取回收率与基质效应第41-42页
            3.5.5 准确度与精密度第42页
            3.5.6 稳定性第42页
            3.5.7 稀释效应第42-43页
            3.5.8 残留效应第43页
        3.6 数据处理第43页
    4 结果第43-62页
        4.1 方法学验证结果第43-60页
            4.1.1 选择性结果第43-47页
            4.1.2 定量下限与检测限结果第47页
            4.1.3 线性与浓度范围结果第47-51页
            4.1.4 提取回收率与基质效应结果第51-53页
            4.1.5 准确度与精密度结果第53-56页
            4.1.6 稳定性结果第56-59页
            4.1.7 稀释效应结果第59-60页
            4.1.8 残留效应结果第60页
        4.2 组织样本测定结果第60-62页
    5 讨论第62-64页
        5.1 氨基酸对照品储备溶液的配制浓度第62页
        5.2 质谱条件的优化第62页
        5.3 “模拟组织液”的选择第62-63页
        5.4 组织样本前处理方法的确定第63页
        5.5 内标氨基酸的选定第63-64页
    6 小结第64-65页
第三章 基于液相-串联质谱联用技术的结直肠癌组织靶向氨基酸代谢组学研究第65-79页
    1 引言第65页
    2 实验仪器与材料第65-66页
        2.1 仪器第65页
        2.2 试剂与耗材第65页
        2.3 氨基酸对照品第65页
        2.4 组织样本第65-66页
    3 液相-串联质谱联用检测方法第66-67页
        3.1 相关溶液的配制及前处理第66-67页
        3.2 色谱条件第67页
        3.3 质谱条件第67页
        3.4 组织样本前处理第67页
        3.5 数据处理及统计方法第67页
    4 结果第67-77页
        4.1 结直肠癌患者的基本信息第67-68页
        4.2 组织样本氨基酸总离子流图第68页
        4.3 组织样本氨基酸含量测定结果第68-70页
        4.4 组织样本氨基酸多维统计分析结果第70-77页
            4.4.1 主成分分析第70-71页
            4.4.2 正交偏最小二乘-判别分析第71-73页
            4.4.3 差异性变量分析第73-76页
            4.4.4 差异性代谢物可能相关的代谢通路第76-77页
    5 讨论第77页
        5.1 结直肠癌组织氨基酸代谢谱的特点第77页
        5.2 靶向氨基酸代谢组学用于癌症分期研究的不足第77页
    6 小结第77-79页
第四章 结直肠癌患者血浆氨基酸的液相-串联质谱联用检测方法的建立第79-105页
    1 引言第79-80页
    2 实验仪器与材料第80页
        2.1 仪器第80页
        2.2 试剂与耗材第80页
        2.3 氨基酸对照品第80页
        2.4 血浆样本第80页
    3 液相-串联质谱联用检测方法第80-84页
        3.1 相关溶液的配制与前处理第80-82页
            3.1.1 氨基酸对照品储备溶液的配制第80-81页
            3.1.2 内标氨基酸对照品储备溶液的配制第81页
            3.1.3 工作溶液的配制第81页
            3.1.4 标准曲线工作溶液的配制第81-82页
            3.1.5 标准曲线工作溶液的前处理第82页
            3.1.6 质量控制样本的配制第82页
            3.1.7 质量控制样本的前处理第82页
        3.2 色谱条件第82页
        3.3 质谱条件第82-83页
        3.4 血浆样本的前处理第83页
        3.5 方法学验证第83-84页
            3.5.1 选择性第83页
            3.5.2 定量下限与检测限第83页
            3.5.3 线性与浓度范围第83页
            3.5.4 提取回收率与基质效应第83-84页
            3.5.5 准确度与精密度第84页
            3.5.6 稳定性第84页
            3.5.7 稀释效应第84页
            3.5.8 残留效应第84页
        3.6 数据处理第84页
    4 结果第84-102页
        4.1 方法学验证结果第84-100页
            4.1.1 选择性结果第84-88页
            4.1.2 定量下限与检测限结果第88页
            4.1.3 线性与浓度范围结果第88-92页
            4.1.4 提取回收率与基质效应结果第92-94页
            4.1.5 准确度与精密度结果第94-97页
            4.1.6 稳定性结果第97-100页
            4.1.7 稀释效应结果第100页
            4.1.8 残留效应结果第100页
        4.2 血浆样本测定结果第100-102页
    5 讨论第102-104页
        5.1 血浆待测氨基酸种类的确定第102-103页
        5.2 分析条件的优化第103页
        5.3 “模拟血浆”的选择第103页
        5.4 内标氨基酸的选定第103-104页
    6 小结第104-105页
第五章 基于液相-串联质谱联用技术的结直肠癌患者血浆靶向氨基酸代谢组学研究第105-127页
    1 引言第105页
    2 实验仪器与材料第105-107页
        2.1 仪器第105页
        2.2 试剂与耗材第105页
        2.3 氨基酸对照品第105页
        2.4 受试人员血浆样本收集第105-107页
            2.4.1 结直肠癌患者血浆样本收集第105-106页
            2.4.2 健康志愿者血浆样本收集第106页
            2.4.3 结直肠癌前病变患者血浆样本收集第106-107页
        2.5 受试人员分组第107页
            2.5.1 训练集第107页
            2.5.2 测试集第107页
    3 液相-串联质谱联用检测方法第107-108页
        3.1 相关溶液的配制及前处理第107页
        3.2 色谱条件第107页
        3.3 质谱条件第107页
        3.4 血浆样本前处理第107页
        3.5 数据处理及统计方法第107-108页
    4 结果第108-124页
        4.1 训练集人员基本信息第108页
        4.2 训练集血浆样本氨基酸总离子流图第108-109页
        4.3 训练集血浆样本氨基酸含量测定结果第109-110页
        4.4 训练集血浆样本氨基酸多维统计分析结果第110-117页
            4.4.1 主成分分析第110-111页
            4.4.2 正交偏最小二乘-判别分析第111-114页
            4.4.3 差异性变量分析第114-117页
            4.4.4 差异性代谢物可能相关的代谢通路第117页
        4.5 结直肠癌诊断模型的建立第117-120页
            4.5.1 结直肠癌诊断单因子模型第117-118页
            4.5.2 结直肠癌诊断联合因子模型第118-120页
        4.6 结直肠癌诊断模型的验证第120-124页
            4.6.1 测试集人员基本信息第120-121页
            4.6.2 测试集血浆样本氨基酸总离子流图第121-122页
            4.6.3 测试集血浆样本氨基酸含量测定结果第122-123页
            4.6.4 联合因子模型诊断测试集的价值第123页
            4.6.5 结直肠癌诊断模型的诊断价值第123-124页
    5 讨论第124-125页
        5.1 结直肠癌患者血浆氨基酸代谢谱的特点第124页
        5.2 基于联合因子建立的结直肠癌诊断模型第124-125页
        5.3 测试集样本的选择及诊断模型的验证第125页
    6 小结第125-127页
第六章 结直肠癌患者的色氨酸代谢通路第127-137页
    1 引言第127-128页
    2 IDO1酶含量第128-129页
        2.1 实验仪器与材料第128-129页
            2.1.1 仪器第128页
            2.1.2 试剂与耗材第128页
            2.1.3 血浆样本第128-129页
        2.2 检测方法第129页
            2.2.1 酶联免疫检测操作第129页
            2.2.2 数据处理及统计方法第129页
        2.3 IDO1酶含量检测结果第129页
    3 IDO1酶相对活性第129-132页
        3.1 IDO1酶相对活性计算方法第129-130页
        3.2 数据处理及统计方法第130页
        3.3 血浆IDO1酶相对活性计算结果第130-131页
        3.4 组织IDO1酶相对活性计算结果第131-132页
    4 讨论第132-137页
        4.1 色氨酸代谢通路及IDO酶的作用及临床意义第132页
        4.2 结直肠癌组织色氨酸代谢发生改变的病因机制第132-133页
        4.3 其它差异性氨基酸在结直肠癌代谢改变中的意义第133-134页
        4.4 联合因子诊断模型对于结直肠癌诊断的优势第134页
        4.5 靶向氨基酸代谢组学研究的不足第134-137页
第七章 研究总结及展望第137-139页
    1 研究总结第137-138页
    2 展望第138-139页
参考文献第139-149页
附录第149-151页
文献综述第151-169页
    参考文献第164-169页
在读期间发表论文和参加科研工作情况说明第169-171页
致谢第171页

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