| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-32页 |
| 1.1 细菌非编码RNA概述 | 第16-22页 |
| 1.1.1 细菌非编码RNA的定义及分类 | 第16-17页 |
| 1.1.2 细菌非编码RNA的作用机制 | 第17-20页 |
| 1.1.3 细菌非编码RNA的调控功能 | 第20-22页 |
| 1.2 细菌非编码RNA调控氧化胁迫抗性的研究进展 | 第22-30页 |
| 1.2.1 细菌中氧化胁迫抗性调控系统的研究 | 第22-24页 |
| 1.2.2 细菌中非编码RNA在氧化胁迫应答中的功能研究 | 第24-30页 |
| 1.3 立题依据和技术路线 | 第30-32页 |
| 1.3.1 立题依据 | 第30-31页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第31-32页 |
| 第二章 非编码RNANfiS在氧化胁迫抗性调节中的作用 | 第32-40页 |
| 2.1 材料 | 第32-33页 |
| 2.1.1 菌株 | 第32页 |
| 2.1.2 培养基配方 | 第32-33页 |
| 2.1.3 抗生素配置及工作浓度 | 第33页 |
| 2.1.4 酶、试剂盒和化学试剂 | 第33页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第33页 |
| 2.2 方法 | 第33-36页 |
| 2.2.1 非编码RNA二级结构预测及靶标预测 | 第33-34页 |
| 2.2.2 过氧化氢冲击实验 | 第34页 |
| 2.2.3 提取细菌总RNA | 第34页 |
| 2.2.4 cDNA的合成 | 第34-35页 |
| 2.2.5 实时定量PCR | 第35-36页 |
| 2.3 实验结果 | 第36-39页 |
| 2.3.1 NfiS对H_2O_2胁迫信号的响应分析 | 第36-37页 |
| 2.3.2 H_2O_2冲击条件下A1501中氧化胁迫相关基因的表达分析 | 第37页 |
| 2.3.3 NfiS参与氧化胁迫抗性调控可能靶标的生物信息学预测 | 第37-38页 |
| 2.3.4 nfiS基因突变对氧化胁迫相关基因表达的影响 | 第38-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-40页 |
| 第三章 NfiS参与氧化胁迫抗性调节的靶标基因的功能分析 | 第40-50页 |
| 3.1 材料 | 第40-41页 |
| 3.1.1 菌株与质粒 | 第40-41页 |
| 3.1.2 培养基、试剂与仪器 | 第41页 |
| 3.2 方法 | 第41-44页 |
| 3.2.1 细菌质粒的提取 | 第41页 |
| 3.2.2 双酶切、连接及转化实验 | 第41-42页 |
| 3.2.3 PCR反应 | 第42-43页 |
| 3.2.4 三亲结合实验 | 第43-44页 |
| 3.2.5 过氧化氢冲击实验 | 第44页 |
| 3.2.6 过氧化氢酶活测定实验 | 第44页 |
| 3.3 实验结果 | 第44-49页 |
| 3.3.1 katB插入突变株的构建 | 第44-46页 |
| 3.3.2 katB回补株的构建 | 第46-47页 |
| 3.3.3 katB基因突变对H2O2冲击条件下菌株生存率的影响 | 第47-48页 |
| 3.3.4 katB基因突变对菌株过氧化氢酶活的影响 | 第48-49页 |
| 3.4 讨论 | 第49-50页 |
| 第四章 NfiS参与氧化胁迫抗性调节的靶标基因鉴定和作用机制研究 | 第50-72页 |
| 4.1 材料 | 第50-52页 |
| 4.1.1 菌株与质粒 | 第50-51页 |
| 4.1.2 培养基、试剂与仪器 | 第51-52页 |
| 4.2 方法 | 第52-55页 |
| 4.2.1 微量热泳动实验 | 第52-53页 |
| 4.2.2 半衰期实验 | 第53-54页 |
| 4.2.3 固氮酶活测定实验 | 第54-55页 |
| 4.3 结果 | 第55-70页 |
| 4.3.1 NfiS参与氧化胁迫应答调控的二级结构区域分析 | 第55-61页 |
| 4.3.2 NfiS与katBmRNA作用位点分析 | 第61-64页 |
| 4.3.3 NfiS与katBmRNA的互作 | 第64页 |
| 4.3.4 nfiS缺失对katBmRNA稳定性的影响 | 第64-66页 |
| 4.3.5 固氮条件下氧化胁迫相关基因的表达情况 | 第66页 |
| 4.3.6 不同氧浓度下katB突变对固氮酶活的影响 | 第66-67页 |
| 4.3.7 不同施氏假单胞菌中NfiS上katBmRNA作用位点分析 | 第67-70页 |
| 4.4 讨论 | 第70-72页 |
| 第五章 全文结论 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 作者简历 | 第82页 |
