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重金属镉诱导果蝇DNA甲基化相关基因表达改变及数字基因表达谱分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
英文縮写词表第12-13页
第1章 前言第13-31页
    1.1 重金属镉的毒性研究及分子机制概述第13-16页
        1.1.1 重金属镉的性质及来源第13-14页
        1.1.2 重金属镉的毒性及其分子机制第14-16页
    1.2 模式生物黑腹果蝇概述第16-17页
    1.3 果蝇DNA甲基化研究第17-23页
        1.3.1 真核生物DNA甲基化概述第17-19页
        1.3.2 果蝇DNA甲基化修饰特点第19-20页
        1.3.3 果蝇DNA甲基化修饰系统研究进展第20-23页
    1.4 果蝇细胞凋亡概述第23-27页
        1.4.1 真核生物细胞凋亡简介第23-25页
        1.4.2 果蝇细胞凋亡特点第25页
        1.4.3 果蝇细胞凋亡相关基因研究进展第25-27页
    1.5 数字基因表达谱技术简介第27-28页
    1.6 本研究的内容及意义第28-31页
第2章 镉对黑腹果蝇DNA甲基化修饰相关基因表达的影响第31-47页
    2.1 实验材料第31-32页
        2.1.1 实验动物第31页
        2.1.2 实验仪器设备第31页
        2.1.3 实验主要试剂第31-32页
    2.2 实验方法第32-35页
        2.2.1 果蝇的收集与处理第32页
        2.2.2 果蝇组织的解剖第32页
        2.2.3 果蝇总RNA提取第32-33页
        2.2.4 总RNA质量的检测第33-34页
        2.2.5 反转录合成cDNA单链第34页
        2.2.6 引物设计及合成第34-35页
        2.2.7 Real-time PCR第35页
        2.2.8 数据分析第35页
    2.3 结果与分析第35-42页
        2.3.1 RNA完整性及纯度结果第35-36页
        2.3.2 Real-time PCR引物扩增第36-38页
        2.3.3 镉对亲代(F_0)果蝇精巢、卵巢dDNMT2及dMBD2/3基因表达的影响第38-39页
        2.3.4 镉对亲代(F_0)果蝇非精巢、卵巢体细胞dDNMT2及dMBD2/3基因表达的影响第39-40页
        2.3.5 镉对亲代(F_0)果蝇完整个体dDNMT2及dMBD2/3基因表达的影响第40页
        2.3.6 镉对子代(F_1)果蝇dDNMT2和dMBD2/3基因表达的影响第40-41页
        2.3.7 镉对不同组别果蝇dDNMT2和dMBD2/3基因表达的影响比较第41-42页
    2.4 讨论第42-45页
        2.4.1 镉诱导果蝇DNA甲基化相关基因的表达改变呈现剂量效应第42-43页
        2.4.2 镉诱导果蝇DNA甲基化相关基因的表达改变呈现性别和组织差异第43-44页
        2.4.3 镉诱导果蝇DNA甲基化相关基因表达改变的可遗传性分析第44-45页
    2.5 结论第45-47页
第3章 数字基因表达谱测序分析与果蝇凋亡相关基因的筛选第47-61页
    3.1 实验材料第47页
        3.1.1 实验动物的收集与处理第47页
        3.1.2 实验仪器设备第47页
        3.1.3 实验主要试剂第47页
    3.2 实验方法第47-49页
        3.2.1 果蝇的收集与处理第47-48页
        3.2.2 果蝇总RNA提取第48页
        3.2.3 总RNA质量的检测第48页
        3.2.4 mRNA的纯化与cDNA文库构建、测序第48-49页
    3.3 实验结果第49-56页
        3.3.1 RNA完整性及纯度结果第49页
        3.3.2 表达谱测序原始数据统计第49-50页
        3.3.3 CK与TG样本间相关性分析第50-52页
        3.3.4 表达差异基因分析第52页
        3.3.5 Go基因注释分析及KEGG通路分析第52页
        3.3.6 与果蝇DNA甲基化相关基因筛选与分析第52-53页
        3.3.7 与果蝇细胞凋亡相关基因筛选与分析第53-56页
    3.4 讨论第56-58页
        3.4.1 清洁标签的获取与比对第56-57页
        3.4.2 果蝇DNA甲基化及细胞凋亡相关基因的筛选第57-58页
    3.5 结论第58-61页
第4章 重金属镉对果蝇凋亡相关基因表达的影响第61-71页
    4.1 实验材料第61页
        4.1.1 实验动物第61页
        4.1.2 实验仪器设备第61页
        4.1.3 实验主要试剂第61页
    4.2 实验方法第61-63页
        4.2.1 果蝇的收集与处理第61页
        4.2.2 果蝇总RNA提取第61-62页
        4.2.3 总RNA质量的检测第62页
        4.2.4 反转录合成cDNA单链第62页
        4.2.5 引物设计及合成第62-63页
        4.2.6 Real-time PCR第63页
        4.2.7 数据分析第63页
    4.3 结果与分析第63-68页
        4.3.1 RNA完整性及纯度结果第63-64页
        4.3.2 Real-time PCR引物扩增结果第64-66页
        4.3.3 镉对亲代(F_0)p53通路相关基因表达的影响第66-67页
        4.3.4 镉对亲代(F_0)果蝇Caspase-3通路相关基因表达的影响第67-68页
    4.4 讨论第68-70页
        4.4.1 镉对p53-tefu凋亡通路基因的影响第68-69页
        4.4.2 镉对Caspase-3凋亡信号通路基因的影响第69-70页
    4.5 结论第70-71页
参考文献第71-85页
致谢第85-87页
攻读硕士学位期间研究成果第87页

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