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基于转录组学分析的赖氨酸调控肉鸡生长发育的分子机制

摘要第5-7页
abstract第7-9页
第一章 文献综述第13-20页
    1.1 赖氨酸研究进展第13-14页
        1.1.1 赖氨酸特性第13页
        1.1.2 赖氨酸代谢第13页
        1.1.3 赖氨酸的生物学功能第13-14页
    1.2 赖氨酸在家禽生产中的作用第14-15页
        1.2.1 赖氨酸与家禽生长性能第14页
        1.2.2 赖氨酸与家禽组织器官发育第14页
        1.2.3 赖氨酸与家禽血清生化指标第14-15页
    1.3 家禽对赖氨酸需要量的研究进展第15-16页
    1.4 转录组学的发展第16-18页
        1.4.1 转录组学基本定义第16页
        1.4.2 转录组学研究的方法历程概述第16-17页
        1.4.3 转录组测序在家禽相关研究中的应用第17-18页
    1.5 本研究的目的和意义第18-19页
    1.6 研究技术路线第19-20页
第二章 日粮赖氨酸水平对肉鸡生长性能、主要组织器官发育和血清生化指标的影响第20-28页
    2.1 材料与方法第20-22页
        2.1.1 试验动物第20页
        2.1.2 试验设计及日粮第20页
        2.1.3 饲养管理第20-21页
        2.1.4 试验指标测定及方法第21-22页
        2.1.5 数据分析第22页
    2.2 结果分析第22-25页
        2.2.1 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡生长性能的影响第22-23页
        2.2.2 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡组织器官生长发育的影响第23-24页
        2.2.3 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡血清生化指标的影响第24-25页
        2.2.4 采用二次回归模型估测1-21日龄肉鸡的赖氨酸最佳需要量第25页
    2.3 讨论第25-27页
        2.3.1 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡生长性能的影响第25-26页
        2.3.2 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡主要组织器官生长发育影响第26页
        2.3.3 日粮赖氨酸水平对肉仔鸡血清生化指标影响第26-27页
    2.4 小结第27-28页
第三章 日粮赖氨酸缺乏或过量对肉鸡肌肉发育及蛋白质代谢相关基因表达的影响第28-36页
    3.1 材料方法第28-31页
        3.1.1 试验动物第28页
        3.1.2 试验设计及日粮第28-29页
        3.1.3 饲养管理第29页
        3.1.4 样品采集第29页
        3.1.5 试验测定指标及方法第29-31页
        3.1.6 数据分析第31页
    3.2 结果分析第31-33页
        3.2.1 日粮赖氨酸水平对肉鸡肌肉发育的影响第31-32页
        3.2.2 日粮赖氨酸水平对肉鸡肌肉组织蛋白质代谢相关基因表达的影响第32-33页
    3.3 讨论第33-35页
        3.3.1 日粮赖氨酸水平对肉鸡肌肉组织蛋白质合成基因表达影响第33-34页
        3.3.2 日粮赖氨酸水平对肉鸡肌肉组织蛋白质分解代谢基因表达影响第34-35页
    3.4 小结第35-36页
第四章 基于转录组分析的赖氨酸调控肉鸡胸肌蛋白质代谢及生长发育的分子机制第36-49页
    4.1 材料与方法第36-39页
        4.1.1 试验动物第36页
        4.1.2 试验设计及日粮第36页
        4.1.3 饲养管理第36-37页
        4.1.4 样品采集第37页
        4.1.5 生长性能试验指标及分析第37-38页
        4.1.6 mRNA文库建立和测序第38页
        4.1.7 测序序列统计、质控及与参考基因组比对第38页
        4.1.8 基因水平差异表达研究第38页
        4.1.9 差异基因功能分析第38页
        4.1.10 实时荧光定量验证第38-39页
    4.2 结果分析第39-45页
        4.2.1 生长性能第39页
        4.2.2 胸肌组织转录组测序第39-45页
    4.3 讨论第45-48页
    4.4 小结第48-49页
第五章 赖氨酸对肉鸡肝脏LncRNA和转录组基因差异表达的联合影响第49-72页
    5.1 材料与方法第49-54页
        5.1.1 试验动物第49页
        5.1.2 试验设计及日粮第49页
        5.1.3 饲养管理第49-50页
        5.1.4 样品采集第50页
        5.1.5 生长发育指标及分析第50-51页
        5.1.6 测序文库的构建及测序数据质控第51页
        5.1.7 生信分析方法与流程第51-52页
        5.1.8 测序数据与参考基因组比对第52-53页
        5.1.9 差异表达基因研究第53页
        5.1.10 差异表达基因功能分析第53页
        5.1.11 实时荧光定量验证第53-54页
        5.1.12 LncRNA与mRNA联合分析第54页
    5.2 结果分析第54-68页
        5.2.1 生长发育第54页
        5.2.2 测序数据质量评估第54-55页
        5.2.3 基因组比对第55页
        5.2.4 转录本表达结果第55-56页
        5.2.5 差异基因表达第56-60页
        5.2.6 功能分析第60-66页
        5.2.7 LncRNA预测分析第66页
        5.2.8 LncRNA-mRNA联合分析第66-68页
    5.3 讨论第68-71页
    5.4 小结第71-72页
第六章 结论及建议第72-73页
    6.1 本研究的主要结论第72页
    6.2 本研究的创新点第72页
    6.3 需要进一步研究的问题第72-73页
参考文献第73-79页
附录第79-80页
致谢第80-81页
作者简介第81页

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