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保护斑马鱼(Danio rerio)胚胎免受细菌感染的新型母源性LPS结合蛋白ZRANB2的鉴定

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第13-33页
    1 斑马鱼简介第13-15页
    2 鱼类的免疫系统第15-23页
        2.1 免疫系统的个体发生第15-16页
        2.2 淋巴器官第16-17页
            2.2.1 胸腺第16页
            2.2.2 肾脏第16-17页
            2.2.3 脾第17页
        2.3 参与免疫反应的细胞第17页
        2.4 鱼类的非特异性免疫第17-22页
            2.4.1 物理屏障第17-18页
            2.4.2 非特异性细胞的细胞毒性第18页
            2.4.3 抗菌肽第18页
            2.4.4 吞噬作用第18页
            2.4.5 补体第18-19页
            2.4.6 肿瘤坏死因子(TNF)第19页
            2.4.7 干扰素(INF)第19-20页
            2.4.8 白介素(IL)第20页
            2.4.9 其它的细胞因子和趋化因子第20页
            2.4.10 蛋白激酶抑制剂第20页
            2.4.11 溶菌酶第20-21页
            2.4.12 天然抗体第21页
            2.4.13 正五聚蛋白第21页
            2.4.14 转铁蛋白第21-22页
        2.5 鱼类的特异性免疫第22-23页
            2.5.1 抗体第22页
            2.5.2 免疫记忆第22-23页
            2.5.3 细胞的细胞毒性第23页
            2.5.4 适应性免疫中的细胞因子第23页
    3 先天性免疫第23-29页
        3.1 先天性免疫系统的非自我识别第23-26页
        3.2 先天性免疫与疾病第26-28页
        3.3 母源性免疫与鱼类第28-29页
    4 高通量分离技术第29-30页
    5 锌指蛋白研究概况第30-31页
        5.1 锌指结构第30-31页
        5.2 锌指蛋白第31页
    6 ZRANB2的研究概况第31-32页
    7 本文的研究目的和技术路线第32-33页
        7.1 研究目的第32页
        7.2 技术路线第32-33页
第二章 斑马鱼母源性免疫因子的高通量分离与鉴定第33-95页
    1 前言第33页
    2 材料和方法第33-63页
        2.1 实验材料第33-36页
            2.1.1 实验动物第33页
            2.1.2 实验仪器第33-34页
            2.1.3 实验试剂第34-36页
        2.2 从斑马鱼胚胎提取液中高通量分离母源性免疫因子第36-40页
            2.2.1 斑马鱼卵液的制备第36-37页
            2.2.2 制备交联有LPS的琼脂糖凝胶柱第37页
            2.2.3 上样与洗脱第37-38页
            2.2.4 SDS-PAGE检测第38-39页
            2.2.5 质谱鉴定第39-40页
        2.3 Western blotting检测目的蛋白在不同组织和不同发育时期的存在情况第40-41页
            2.3.1 斑马鱼各组织和不同发育时期匀浆液的获得第40页
            2.3.2 Western blotting检测第40-41页
        2.4 斑马鱼zranb2基因序列的获得第41-47页
            2.4.1 斑马鱼胚胎总RNA提取第41-42页
            2.4.2 斑马鱼胚胎总cDNA的获得第42-45页
            2.4.3 斑马鱼zranb2基因的克隆第45-47页
        2.5 斑马鱼zranb2的序列分析、进化分析和基因组织结构分析第47-48页
        2.6 Real-time PCR技术检测斑马鱼zranb2的表达情况第48-50页
            2.6.1 Real-time PCR所用实验材料的获得第48页
            2.6.2 RNA的提取、cDNA模板的合成与检测第48页
            2.6.3 设计Real-time PCR特异性引物第48-49页
            2.6.4 Real-time PCR扩增第49-50页
        2.7 原位杂交技术检测斑马鱼zranb2的表达情况第50-53页
            2.7.1 合成探针第50页
            2.7.2 原位杂交技术第50-53页
        2.8 斑马鱼ZRANB2重组蛋白的体外表达第53-57页
            2.8.1 斑马鱼ZRANB2体外表达载体的构建第53-54页
            2.8.2 斑马鱼rZRANB2的体外表达第54-55页
            2.8.3 斑马鱼rZRANB2的纯化第55-56页
            2.8.4 斑马鱼rZRANB2的浓缩第56-57页
        2.9 斑马鱼rZRANB2与LPS结合能力的鉴定第57-58页
            2.9.1 用NHS-LC-biotin标记rZRANB2和BSA第57页
            2.9.2 ELISA技术检测rZRANB2与LPS的结合情况第57-58页
            2.9.3 ELISA技术检测rZRANB2与脂质A的结合情况第58页
            2.9.4 ELISA技术检测rZRANB2与单糖的结合情况第58页
        2.10 斑马鱼rZRANB2与细菌结合能力的鉴定第58-59页
            2.10.1 大肠杆菌、鳗弧球菌和嗜水气单胞菌的培养第58-59页
            2.10.2 Western bloting技术分析重组蛋白与细菌的结合情况第59页
            2.10.3 用异硫氰酸荧光素(FITC)标记法分析rZRANB2与细菌的结合能力第59页
        2.11 斑马鱼rZRANB2的抗菌活性的验证第59-60页
            2.11.1 大肠杆菌、鳗弧球菌和嗜水气单胞菌的培养第59页
            2.11.2 斑马鱼rZRANB2对大肠杆菌和鳗弧球菌的抗菌活性的验证第59-60页
            2.11.3 斑马鱼rZRANB2对嗜水气单胞菌的抗菌活性的验证第60页
        2.12 斑马鱼rZRANB2流式细胞术检测第60-61页
        2.13 斑马鱼胚胎中ZRANB2的抗菌活性的验证第61-62页
            2.13.1 检测斑马鱼胚胎提取液中ZRANB2的抗菌活性第61页
            2.13.2 检测斑马鱼体内ZRANB2是否有胚胎防御作用第61-62页
        2.14 斑马鱼胚胎中ZRANB2的浓度测定第62页
        2.15 斑马鱼ZRANB2活性中心的探寻第62-63页
    3 结果第63-92页
        3.1 从斑马鱼胚胎提取液中高通量分离母源性免疫因子第63-65页
            3.1.1 高通量分离斑马鱼母源性免疫因子的质谱结果第63-64页
            3.1.2 Western blotting检测斑马鱼ZRANB2在不同组织中的分布情况第64-65页
            3.1.3 Western blotting检测斑马鱼ZRANB2在不同时期胚胎中的表达情况第65页
        3.2 斑马鱼zranb2基因的序列分析、结构分析、进化分析和共线性分析第65-72页
            3.2.1 斑马鱼zranb2基因序列的获得第65-66页
            3.2.2 斑马鱼zranb2基因的序列分析第66-70页
            3.2.3 斑马鱼ZRANB2结构分析第70-71页
            3.2.4 斑马鱼ZRANB2进化分析第71页
            3.2.5 斑马鱼zranb2基因的共线性分析第71-72页
        3.3 斑马鱼zranb2在不同组织和不同时期的表达模式第72-78页
            3.3.1 qRT-PCR检测的斑马鱼zranb2在不同组织中的表达模式第72-74页
            3.3.2 qRT-PCR检测的斑马鱼zranb2在不同时期的表达模式第74-76页
            3.3.3 WISH检测的斑马鱼zranb2在不同组织中的表达模式第76-78页
        3.4 斑马鱼rZRANB2的体外重组表达第78-80页
            3.4.1 pET-28a/zranb2表达载体的构建第78-79页
            3.4.2 斑马鱼rZRANB2的体外表达和纯化第79-80页
            3.4.3 斑马鱼rZRANB2的Western blotting鉴定第80页
        3.5 斑马鱼rZRANB2与LPS结合情况的验证第80-81页
        3.6 斑马鱼rZRANB2与细菌结合情况的验证第81-83页
            3.6.1 Western blotting检测结果第81-82页
            3.6.2 FITC标记法的检测结果第82-83页
        3.7 斑马鱼rZRANB2体外抗菌活性的验证第83页
        3.8 斑马鱼rZRANB2流式细胞术检测第83-84页
        3.9 斑马鱼早期胚胎中ZRANB2的免疫防护作用的验证第84-87页
            3.9.1 斑马鱼早期胚胎提取液中ZRANB2抗菌活性的验证第84-85页
            3.9.2 斑马鱼早期胚胎中ZRANB2抗菌活性的验证第85-87页
        3.10 斑马鱼早期胚胎中ZRANB2浓度的确定第87-89页
        3.11 斑马鱼ZRANB2截短后多肽的抗菌活性的验证第89-92页
            3.11.1 斑马鱼ZRANB2截短示意图第89页
            3.11.2 Z_(38/198)、Z_(1/37)和Z_(11/37)体外抗菌活性以及与LPS结合能力的验证第89-92页
            3.11.3 Z_(38/198)、Z_(1/37)和Z_(11/37)体内抗菌活性的验证第92页
    4 讨论第92-95页
总结与展望第95-96页
参考文献第96-109页
致谢第109-110页
个人简历第110页
发表的文章第110页

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