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应用表达谱芯片和荧光素酶报告系统筛选并鉴定大肠癌FOXQ1基因的潜在下游靶基因

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 绪论第13-21页
    1.1 结肠癌的流行病学知识第13-14页
    1.2 FOX转录因子基因家族第14-15页
    1.3 FOXQ1基因研究现状第15-16页
    1.4 上皮间质转化和FOXQ1第16-18页
    1.5 大肠癌中的FOXQ1基因研究第18-19页
    1.6 本实验总体设计思路第19页
    1.7 实验流程第19-21页
第二章 实验材料和仪器第21-23页
    材料第21-22页
    仪器第22-23页
第三章 实验内容第23-100页
    第一部分 利用基因芯片探究FOXQ1在结肠癌中的作用第23-72页
        1.1 实验过程第23-35页
            1.1.1 RNA的获取第23页
            1.1.2 QRT-PCR进行验证FOXQ1敲低效率第23-25页
            1.1.3 Western blot验证FOXQ1蛋白表达量差异第25-30页
            1.1.4 芯片样本准备与芯片杂交第30-32页
            1.1.5 芯片扫描与结果分析第32页
            1.1.6 芯片结果的验证第32-35页
        1.2 结果第35-69页
            1.2.1 FOXQ1敲低效率验证第35页
            1.2.2 RNA质量验证第35-36页
            1.2.3 mRNA芯片测定的基因表达量差异原始数据第36-39页
            1.2.4 mRNA芯片GO分析第39-51页
            1.2.5 mRNA芯片Pathway分析第51-54页
            1.2.6 伴随FOXQ1敲低,microRNA的表达改变第54-55页
            1.2.7 MicroRNA芯片的GO分析第55-66页
            1.2.8 MicroRNA下调,mRNA上调结果关联分析第66-67页
            1.2.9 MicroRNA上调,mRNA下调结果交联分析第67-68页
            1.2.10 芯片结果qRT-PCR验证结果第68-69页
        1.3 讨论第69-72页
            1.3.1 片技术讨论第69-70页
            1.3.2 FOXQ1相关基因的聚类分析和功能探究第70-71页
            1.3.3 FOXQ1相关microRNA功能分析第71-72页
    第二部分 利用双荧光素酶报告系统探究FOXQ1在结肠癌中直接转录激活的靶基因第72-100页
        2.1 实验过程第72-82页
            2.1.1 启动子结合位点预测第72页
            2.1.2 萤火虫荧光素酶质粒的构建第72-80页
            2.1.3 细胞转染和荧光检测第80-82页
        2.2 实验结果第82-93页
            2.2.1 获取启动子区域序列信息第82页
            2.2.2 利用JASPAR预测结果第82-84页
            2.2.3 五个基因PCR扩增结果第84-86页
            2.2.4 五个基因测序的结果第86-92页
            2.2.5 荧光素酶报告系统检测荧光强度第92-93页
        2.3 讨论第93-100页
            2.3.1 转录机制研究的重要意义第93页
            2.3.2 JASPAR数据库第93-94页
            2.3.3 双荧光素酶报告系统第94-98页
            2.3.4 五个基因的选取依据第98-99页
            2.3.5 实验失败原因分析第99-100页
第四章 结论第100-101页
参考文献第101-106页
附录第106-108页
    附录A:攻读学位其间发表论文目录第106页
    附录B:攻读学位其间参与科研项目第106-107页
    附录C:部分词汇缩写中英文对照表第107-108页
附件第108-119页
致谢第119页

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