摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-9页 |
第一章 绪论 | 第13-21页 |
1.1 结肠癌的流行病学知识 | 第13-14页 |
1.2 FOX转录因子基因家族 | 第14-15页 |
1.3 FOXQ1基因研究现状 | 第15-16页 |
1.4 上皮间质转化和FOXQ1 | 第16-18页 |
1.5 大肠癌中的FOXQ1基因研究 | 第18-19页 |
1.6 本实验总体设计思路 | 第19页 |
1.7 实验流程 | 第19-21页 |
第二章 实验材料和仪器 | 第21-23页 |
材料 | 第21-22页 |
仪器 | 第22-23页 |
第三章 实验内容 | 第23-100页 |
第一部分 利用基因芯片探究FOXQ1在结肠癌中的作用 | 第23-72页 |
1.1 实验过程 | 第23-35页 |
1.1.1 RNA的获取 | 第23页 |
1.1.2 QRT-PCR进行验证FOXQ1敲低效率 | 第23-25页 |
1.1.3 Western blot验证FOXQ1蛋白表达量差异 | 第25-30页 |
1.1.4 芯片样本准备与芯片杂交 | 第30-32页 |
1.1.5 芯片扫描与结果分析 | 第32页 |
1.1.6 芯片结果的验证 | 第32-35页 |
1.2 结果 | 第35-69页 |
1.2.1 FOXQ1敲低效率验证 | 第35页 |
1.2.2 RNA质量验证 | 第35-36页 |
1.2.3 mRNA芯片测定的基因表达量差异原始数据 | 第36-39页 |
1.2.4 mRNA芯片GO分析 | 第39-51页 |
1.2.5 mRNA芯片Pathway分析 | 第51-54页 |
1.2.6 伴随FOXQ1敲低,microRNA的表达改变 | 第54-55页 |
1.2.7 MicroRNA芯片的GO分析 | 第55-66页 |
1.2.8 MicroRNA下调,mRNA上调结果关联分析 | 第66-67页 |
1.2.9 MicroRNA上调,mRNA下调结果交联分析 | 第67-68页 |
1.2.10 芯片结果qRT-PCR验证结果 | 第68-69页 |
1.3 讨论 | 第69-72页 |
1.3.1 片技术讨论 | 第69-70页 |
1.3.2 FOXQ1相关基因的聚类分析和功能探究 | 第70-71页 |
1.3.3 FOXQ1相关microRNA功能分析 | 第71-72页 |
第二部分 利用双荧光素酶报告系统探究FOXQ1在结肠癌中直接转录激活的靶基因 | 第72-100页 |
2.1 实验过程 | 第72-82页 |
2.1.1 启动子结合位点预测 | 第72页 |
2.1.2 萤火虫荧光素酶质粒的构建 | 第72-80页 |
2.1.3 细胞转染和荧光检测 | 第80-82页 |
2.2 实验结果 | 第82-93页 |
2.2.1 获取启动子区域序列信息 | 第82页 |
2.2.2 利用JASPAR预测结果 | 第82-84页 |
2.2.3 五个基因PCR扩增结果 | 第84-86页 |
2.2.4 五个基因测序的结果 | 第86-92页 |
2.2.5 荧光素酶报告系统检测荧光强度 | 第92-93页 |
2.3 讨论 | 第93-100页 |
2.3.1 转录机制研究的重要意义 | 第93页 |
2.3.2 JASPAR数据库 | 第93-94页 |
2.3.3 双荧光素酶报告系统 | 第94-98页 |
2.3.4 五个基因的选取依据 | 第98-99页 |
2.3.5 实验失败原因分析 | 第99-100页 |
第四章 结论 | 第100-101页 |
参考文献 | 第101-106页 |
附录 | 第106-108页 |
附录A:攻读学位其间发表论文目录 | 第106页 |
附录B:攻读学位其间参与科研项目 | 第106-107页 |
附录C:部分词汇缩写中英文对照表 | 第107-108页 |
附件 | 第108-119页 |
致谢 | 第119页 |