| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第15-32页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第15页 |
| 1.2 反硝化脱硫研究进展 | 第15-24页 |
| 1.2.1 反应器的运行与调控 | 第15-17页 |
| 1.2.2 反应器构型 | 第17-19页 |
| 1.2.3 机理和模型 | 第19页 |
| 1.2.4 微生物群落 | 第19-21页 |
| 1.2.5 功能菌群 | 第21-22页 |
| 1.2.6 反硝化脱硫菌 | 第22-24页 |
| 1.3 环境蛋白质组学研究进展 | 第24-30页 |
| 1.3.1 蛋白质组学技术 | 第25-26页 |
| 1.3.2 纯培养微生物的蛋白质组学分析 | 第26-28页 |
| 1.3.3 微生物群落的宏蛋白质组学分析 | 第28页 |
| 1.3.4 污水生物处理系统中的蛋白质组学分析 | 第28-29页 |
| 1.3.5 微生物生态中的蛋白质组学分析 | 第29-30页 |
| 1.3.6 环境胁迫应答中的蛋白质组学分析 | 第30页 |
| 1.4 主要研究内容 | 第30-31页 |
| 1.5 研究技术路线 | 第31-32页 |
| 第2章 材料与方法 | 第32-40页 |
| 2.1 菌株来源 | 第32页 |
| 2.2 比较蛋白质组学分析 | 第32-35页 |
| 2.2.1 菌株培养条件 | 第32-33页 |
| 2.2.2 蛋白质样品制备 | 第33页 |
| 2.2.3 双向电泳 | 第33-34页 |
| 2.2.4 图像分析 | 第34页 |
| 2.2.5 蛋白质鉴定和数据分析 | 第34-35页 |
| 2.3 定量蛋白质组学分析 | 第35-37页 |
| 2.3.1 菌株培养条件 | 第35页 |
| 2.3.2 蛋白质样品制备 | 第35-36页 |
| 2.3.3 ITRAQ和色谱分析 | 第36页 |
| 2.3.4 基于TRIPLE TOF 5600的LC-ESI-MS/MS分析 | 第36-37页 |
| 2.3.5 数据分析 | 第37页 |
| 2.4 自然水体中的反硝化脱硫反应分析 | 第37-40页 |
| 2.4.1 采样地点及样品处理 | 第37-38页 |
| 2.4.2 水样水质分析 | 第38页 |
| 2.4.3 泥样微生物群落分析 | 第38-40页 |
| 第3章 自然水体中的反硝化脱硫反应 | 第40-50页 |
| 3.1 引言 | 第40-41页 |
| 3.2 水质分析 | 第41-42页 |
| 3.3 微生物群落分析 | 第42-45页 |
| 3.4 生物过程及优势菌群 | 第45-48页 |
| 3.4.1 河段B-C | 第45-46页 |
| 3.4.2 河段C-D | 第46-47页 |
| 3.4.3 河段D-E | 第47-48页 |
| 3.5 检测河段的水体自净 | 第48-49页 |
| 3.6 本章小结 | 第49-50页 |
| 第4章 不同胁迫条件下PSEUDOMONAS SP. C27反硝化脱硫的比较蛋白质组学分析 | 第50-80页 |
| 4.1 引言 | 第50-51页 |
| 4.2 硫化物胁迫下菌株C27反硝化脱硫的蛋白质组学分析 | 第51-64页 |
| 4.2.1 蛋白质分离和鉴定 | 第51-56页 |
| 4.2.2 蛋白质功能类群划分 | 第56页 |
| 4.2.3 蛋白质表达丰度变化 | 第56-60页 |
| 4.2.4 硫化物胁迫下菌株C27的硫代谢 | 第60-61页 |
| 4.2.5 硫化物胁迫下菌株C27的氮代谢 | 第61-63页 |
| 4.2.6 硫化物胁迫下菌株C27的碳代谢 | 第63-64页 |
| 4.3 微氧胁迫下菌株C27反硝化脱硫的蛋白质组学分析 | 第64-79页 |
| 4.3.1 蛋白质分离和鉴定 | 第64-68页 |
| 4.3.2 蛋白质功能类群划分 | 第68-70页 |
| 4.3.3 蛋白质表达丰度变化 | 第70-74页 |
| 4.3.4 微氧胁迫下菌株C27的特异性表达蛋白 | 第74-75页 |
| 4.3.5 微氧胁迫下菌株C27的细胞生长与防御系统 | 第75-76页 |
| 4.3.6 微氧胁迫下菌株C27的反硝化系统 | 第76-77页 |
| 4.3.7 微氧胁迫下菌株C27的碳代谢 | 第77-78页 |
| 4.3.8 微氧胁迫下菌株C27的硫代谢 | 第78-79页 |
| 4.4 本章小结 | 第79-80页 |
| 第5章 不同C/N比条件下PSEUDOMONAS SP. C27反硝化脱硫的定量蛋白质组学分析 | 第80-101页 |
| 5.1 引言 | 第80页 |
| 5.2 菌株C27总蛋白质分析 | 第80-85页 |
| 5.2.1 蛋白质鉴定 | 第80-82页 |
| 5.2.2 蛋白质COG分类 | 第82-83页 |
| 5.2.3 蛋白质GO分类 | 第83-85页 |
| 5.3 碳源不足对菌株C27蛋白质表达的影响 | 第85-93页 |
| 5.3.1 差异表达蛋白质的鉴定 | 第85-89页 |
| 5.3.2 差异表达蛋白质的功能分类 | 第89-93页 |
| 5.4 碳源不足对菌株C27碳、氮、硫代谢的影响 | 第93-99页 |
| 5.4.1 碳、氮、硫代谢相关蛋白 | 第93页 |
| 5.4.2 碳、氮、硫代谢途径 | 第93-97页 |
| 5.4.3 碳源不足对代谢途径的影响 | 第97-99页 |
| 5.5 本章小结 | 第99-101页 |
| 结论 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-122页 |
| 附录 | 第122-145页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文及其它成果 | 第145-147页 |
| 致谢 | 第147-148页 |
| 个人简历 | 第148页 |
