| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第12-19页 |
| 1.1 细菌分类的重要鉴定指标 | 第12-15页 |
| 1.1.1 表型特征 | 第12-14页 |
| 1.1.2 遗传学特征 | 第14页 |
| 1.1.3 系统发育信息 | 第14-15页 |
| 1.2 难培养微生物 | 第15-17页 |
| 1.2.1 改良生长培养基 | 第15-16页 |
| 1.2.2 改善培养方法 | 第16-17页 |
| 1.3 本研究的内容及意义 | 第17-19页 |
| 1.3.1 本研究的内容 | 第17-18页 |
| 1.3.2 本研究的意义 | 第18-19页 |
| 第2章 三株原核微生物新属种的多相分类 | 第19-49页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-22页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第19页 |
| 2.1.2 实验培养基 | 第19-20页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第20页 |
| 2.1.4 实验试剂 | 第20-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-33页 |
| 2.2.1 菌株的活化与保藏 | 第22页 |
| 2.2.2 提取基因组DNA | 第22-23页 |
| 2.2.3 PCR扩增 16S rRNA基因 | 第23-24页 |
| 2.2.4 16S rRNA基因的克隆测序和系统发育分析 | 第24-26页 |
| 2.2.5 形态学特征鉴定 | 第26-28页 |
| 2.2.6 生理生化特征鉴定 | 第28-30页 |
| 2.2.7 磷酸类脂测定 | 第30-31页 |
| 2.2.8 脂肪酸测定 | 第31-32页 |
| 2.2.9 醌型测定 | 第32-33页 |
| 2.2.10 DNA（G+C）mol%含量测定 | 第33页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第33-46页 |
| 2.3.1 16S rRNA基因克隆测序和系统发育分析 | 第33-35页 |
| 2.3.2 形态学特征 | 第35-37页 |
| 2.3.3 生理生化特征 | 第37-39页 |
| 2.3.4 磷酸类脂组分分析 | 第39-40页 |
| 2.3.5 脂肪酸组分分析 | 第40-41页 |
| 2.3.6 醌型组分分析 | 第41-42页 |
| 2.3.7 DNA（G+C）mol%含量 | 第42页 |
| 2.3.8 与相关模式菌株特征比较 | 第42-46页 |
| 2.4 本章小结 | 第46-49页 |
| 第3章 不同营养因子对微生物新物种分离的影响 | 第49-83页 |
| 3.1 实验材料 | 第49-51页 |
| 3.1.1 土壤材料来源 | 第49页 |
| 3.1.2 实验培养基 | 第49-50页 |
| 3.1.3 实验仪器 | 第50页 |
| 3.1.4 实验试剂 | 第50-51页 |
| 3.2 实验方法 | 第51-53页 |
| 3.2.1 土壤样品的处理 | 第51页 |
| 3.2.2 常规稀释分离 | 第51页 |
| 3.2.3 大量稀释分离 | 第51-52页 |
| 3.2.4 提取基因组DNA | 第52页 |
| 3.2.5 细菌通用引物的 16S rRNA基因的PCR扩增 | 第52-53页 |
| 3.2.6 PCR产物检测 | 第53页 |
| 3.2.7 构建系统发育树 | 第53页 |
| 3.3 实验结果 | 第53-79页 |
| 3.3.1 分离所得菌株的种类及数量 | 第53-54页 |
| 3.3.2 细菌通用引物扩增图谱 | 第54页 |
| 3.3.3 土样1常规稀释的分离效果 | 第54-55页 |
| 3.3.4 土样1大量稀释的分离效果 | 第55-57页 |
| 3.3.5 土样2常规稀释的分离效果 | 第57-59页 |
| 3.3.6 土样2大量稀释的分离效果 | 第59-62页 |
| 3.3.7 土样3常规稀释的分离效果 | 第62-64页 |
| 3.3.8 土样3大量稀释的分离效果 | 第64-68页 |
| 3.3.9 菌株的分类地位 | 第68-79页 |
| 3.4 本章小结 | 第79-83页 |
| 第4章 结论 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 攻读学位期间取得的科研成果 | 第93页 |
