| 摘要 | 第2-3页 |
| Abstract | 第3-4页 |
| 引言 | 第7-9页 |
| 第一章 南海冷泉区贻贝（Bathymodiolus platifrons）附生菌的分离培养与多样性分析 | 第9-18页 |
| 1 材料与方法 | 第9-12页 |
| 1.1 实验材料 | 第9-10页 |
| 1.1.1 样品来源 | 第9页 |
| 1.1.2 主要实验试剂 | 第9-10页 |
| 1.1.3 主要实验仪器 | 第10页 |
| 1.2 实验方法 | 第10-12页 |
| 1.2.1 材料处理 | 第10页 |
| 1.2.2 菌株的分离与培养 | 第10-11页 |
| 1.2.3 细菌DNA提取及 16S rDNA序列聚类分析 | 第11-12页 |
| 2 结果与讨论 | 第12-17页 |
| 2.1 贻贝附生菌的多样性分析 | 第12-15页 |
| 2.2 贻贝附生菌群落结构的变化 | 第15-17页 |
| 2.2.1 适应性培养中贻贝附生菌群落结构的变化 | 第15-16页 |
| 2.2.2 现场培养中贻贝附生菌群落结构的变化 | 第16-17页 |
| 3 小结 | 第17-18页 |
| 第二章 沿吕宋海峡-雅浦海山断面水体微生物多样性研究 | 第18-36页 |
| 1 材料与方法 | 第18-25页 |
| 1.1 实验材料 | 第18-20页 |
| 1.1.1 样品来源 | 第18-19页 |
| 1.1.2 主要实验试剂 | 第19页 |
| 1.1.3 主要实验仪器 | 第19-20页 |
| 1.2 实验方法 | 第20-25页 |
| 1.2.1 环境基因组的提取 | 第20-21页 |
| 1.2.2 PCR扩增 | 第21页 |
| 1.2.3 样品多样性评估 | 第21-25页 |
| 1.2.4 高通量测序 | 第25页 |
| 1.2.5 数据分析 | 第25页 |
| 2 结果与讨论 | 第25-35页 |
| 2.1 样品多样性评估 | 第25-26页 |
| 2.2 水体的环境特征 | 第26-27页 |
| 2.3 序列信息 | 第27-29页 |
| 2.4 稀释曲线及Shannon指数分析 | 第29-30页 |
| 2.5 微生物群落结构分析 | 第30-31页 |
| 2.6 基于Beta多样性距离的非度量多维尺度分析 | 第31-33页 |
| 2.7 微生物群落Heatmap分布 | 第33-35页 |
| 3 小结 | 第35-36页 |
| 第三章 结论 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-41页 |
| 综述 | 第41-61页 |
| 一、微生物多样性概述 | 第41-42页 |
| 二、海洋微生物多样性研究方法 | 第42-46页 |
| 2.1 克隆文库的构建 | 第42-43页 |
| 2.2 指纹图谱的构建 | 第43-44页 |
| 2.3 荧光定量PCR | 第44页 |
| 2.4 流式细胞技术 | 第44-45页 |
| 2.5 高通量测序技术 | 第45-46页 |
| 三、海洋微生物多样性研究进展 | 第46-48页 |
| 3.1 深海微生物多样性研究进展 | 第46-47页 |
| 3.2 深海微生物多样性的影响因素 | 第47-48页 |
| 四、海洋微生物多样性研究的意义 | 第48-52页 |
| 4.1 海洋微生物参与生物地球化学循环的意义 | 第48-51页 |
| 4.1.1 海洋微生物参与碳循环 | 第48-49页 |
| 4.1.2 海洋微生物参与氮循环 | 第49-50页 |
| 4.1.3 海洋微生物参与硫循环 | 第50-51页 |
| 4.2 海洋共附生微生物研究的意义 | 第51-52页 |
| 4.2.1 海绵共附生微生物研究的意义 | 第51页 |
| 4.2.2 珊瑚共附生微生物研究的意义 | 第51-52页 |
| 4.2.3 贻贝共附生微生物研究的意义 | 第52页 |
| 五、南海冷泉区及吕宋海峡-雅浦海山的环境概述 | 第52-53页 |
| 5.1 南海冷泉区的环境概述 | 第52页 |
| 5.2 吕宋海峡-雅浦海山断面的环境概述 | 第52-53页 |
| 六、展望 | 第53-55页 |
| 综述参考文献 | 第55-61页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
