| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-23页 |
| 1.1 引言 | 第12-13页 |
| 1.2 盐胁迫对植物的影响 | 第13-15页 |
| 1.2.1 土壤盐碱化对植物影响 | 第13-14页 |
| 1.2.2 盐胁迫对棉花的影响 | 第14-15页 |
| 1.3 植物在盐胁迫下的应答机制 | 第15-18页 |
| 1.3.1 CBL-CIPK信号网络 | 第15-17页 |
| 1.3.2 ABA信号网络 | 第17页 |
| 1.3.3 ROS调控通路 | 第17-18页 |
| 1.4 棉花抗盐碱的研究 | 第18-20页 |
| 1.5 半野生棉资源及其对新疆次生盐碱的抗感性 | 第20-21页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第二章 半野生棉次生盐碱抗性鉴定方法 | 第23-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-24页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23-24页 |
| 2.1.2 盐碱土样选择 | 第24页 |
| 2.1.3 主要的试剂与耗材 | 第24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-26页 |
| 2.2.1 大田采集土样 | 第24页 |
| 2.2.2 合适土样检测 | 第24-25页 |
| 2.2.3 土样主要离子测定 | 第25页 |
| 2.2.4 温室鉴定半野生棉材料方法 | 第25-26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-32页 |
| 2.3.1 合适土样筛选 | 第26-28页 |
| 2.3.2 土样中主要离子含量 | 第28-30页 |
| 2.3.3 温室模拟大田次生盐碱环境 | 第30-31页 |
| 2.3.4 室内鉴定半野生棉萌发期盐碱抗性的筛选方法标准 | 第31-32页 |
| 2.4 讨论 | 第32-34页 |
| 第三章 半野生棉复合盐碱胁迫转录组分析 | 第34-55页 |
| 3.1 实验材料 | 第34页 |
| 3.2 实验方法 | 第34-41页 |
| 3.2.1 材料种植 | 第34-36页 |
| 3.2.2 表型指标测定 | 第36页 |
| 3.2.3 生理指标的测定 | 第36-38页 |
| 3.2.4 RNA提取 | 第38-40页 |
| 3.2.5 转录组测序与数据组装 | 第40页 |
| 3.2.6 基因表达量分析 | 第40页 |
| 3.2.7 差异基因筛选与注释 | 第40-41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-54页 |
| 3.3.1 复合盐碱胁迫下的表型分析 | 第41-42页 |
| 3.3.2 复合盐碱胁迫下的生理生化分析 | 第42-43页 |
| 3.3.3 RNA-Seq数据分析 | 第43-44页 |
| 3.3.4 比对分析 | 第44-46页 |
| 3.3.5 差异表达分析 | 第46-50页 |
| 3.3.6 GO功能分析 | 第50-51页 |
| 3.3.7 ROS相关差异基因能分析 | 第51-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-55页 |
| 第四章 克劳茨基棉盐胁迫响应转录组分析 | 第55-74页 |
| 4.1 实验材料 | 第55页 |
| 4.2 实验方法 | 第55-57页 |
| 4.2.1 种植、处理和取样 | 第55-56页 |
| 4.2.2 RNA提取 | 第56页 |
| 4.2.3 ABA、H2O2、GSSH、GSH含量测定 | 第56页 |
| 4.2.4 转录组测序与数据组装 | 第56页 |
| 4.2.5 转录组数据组装与差异基因筛选 | 第56-57页 |
| 4.2.6 荧光定量分析 | 第57页 |
| 4.3 结果与分析 | 第57-71页 |
| 4.3.1 克劳茨基棉盐胁迫后的表型分析 | 第57-58页 |
| 4.3.2 ABA、H2O2、GSSH和GSH含量 | 第58-59页 |
| 4.3.3 克劳茨基棉转录组质控 | 第59-60页 |
| 4.3.4 差异基因基因富集分析 | 第60-63页 |
| 4.3.5 荧光定量验证转录组数据准确性 | 第63-64页 |
| 4.3.6 差异基因GO和KEGG富集 | 第64-67页 |
| 4.3.7 植物激素ABA相关差异基因 | 第67-69页 |
| 4.3.8 氧化还原反应相关的差异基因 | 第69-70页 |
| 4.3.9 离子平衡相关的差异基因 | 第70-71页 |
| 4.4 讨论与结论 | 第71-74页 |
| 参考文献 | 第74-87页 |
| 附录 | 第87-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 作者简介 | 第96-97页 |
