| 致谢 | 第6-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-35页 |
| 1.1 萜类化合物 | 第14-26页 |
| 1.1.1 萜类化合物的分类及功能 | 第14-15页 |
| 1.1.2 植物萜类化合物的合成途径 | 第15-20页 |
| 1.1.2.1 甲羟戊酸(MVA)途径 | 第17-18页 |
| 1.1.2.2 2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(MEP)途径 | 第18-19页 |
| 1.1.2.3 MVA和MEP途径之间的关系 | 第19-20页 |
| 1.1.3 MVA途径中关键酶HMGR的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.1.4 萜类合成酶(TPS)的研究进展 | 第22-26页 |
| 1.2 棉酚 | 第26-30页 |
| 1.2.1 棉酚的功能及用途 | 第27页 |
| 1.2.2 棉酚的生物合成途径 | 第27-28页 |
| 1.2.3 棉酚合成关键基因 | 第28-30页 |
| 1.2.3.1 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR) | 第28-29页 |
| 1.2.3.2 棉花杜松烯合成酶(CDNS) | 第29-30页 |
| 1.3 比较基因组学和基因家族的进化 | 第30-33页 |
| 1.3.1 植物基因组测序的进展 | 第30-31页 |
| 1.3.2 棉花基因组测序 | 第31页 |
| 1.3.3 比较基因组学 | 第31-32页 |
| 1.3.4 基因组的倍增 | 第32页 |
| 1.3.5 基因家族的扩增 | 第32-33页 |
| 1.3.6 基因家族发生复制后功能的分化 | 第33页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第33-35页 |
| 第二章 绿色植物萜类合成途径相关基因家族的全基因组鉴定和系统发育研究 | 第35-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第35-37页 |
| 2.1.1 不同植物基因组中MVA途径相关基因的检索和鉴定 | 第35-36页 |
| 2.1.2 序列比对和进化树构建 | 第36页 |
| 2.1.3 染色体定位和基因复制分析 | 第36-37页 |
| 2.1.4 基因复制后环境选择压力分析 | 第37页 |
| 2.2 结果与分析 | 第37-44页 |
| 2.2.1 植物MVA途径相关基因家族的鉴定结果 | 第37-38页 |
| 2.2.2 绿色植物中MVA途径及相关基因的分布 | 第38-39页 |
| 2.2.3 HMGR基因的系统发育分析 | 第39-41页 |
| 2.2.4 HMGR基因的染色体定位及基因复制 | 第41-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-45页 |
| 2.4 结论 | 第45-47页 |
| 第三章 雷蒙德氏棉和亚洲棉HMGR基因家族的全基因组分析 | 第47-67页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-50页 |
| 3.1.1 雷蒙德氏棉和亚洲棉中HMGR基因的检索 | 第47-48页 |
| 3.1.2 雷蒙德氏棉和亚洲棉中MVA途径其它相关基因的鉴定 | 第48页 |
| 3.1.3 染色体定位和基因结构分析 | 第48页 |
| 3.1.4 序列比对和进化树构建 | 第48页 |
| 3.1.5 雷蒙德氏棉和亚洲棉的种植及取样 | 第48页 |
| 3.1.6 RNA的提取和荧光定量PCR | 第48-50页 |
| 3.2 结果与分析 | 第50-62页 |
| 3.2.1 雷蒙德氏棉和亚洲棉HMGR基因的鉴定结果 | 第50-53页 |
| 3.2.2 雷蒙德氏棉和亚洲棉HMGR及其它基因的分布 | 第53-57页 |
| 3.2.3 雷蒙德氏棉和亚洲棉HMGR基因结构和蛋白质结构的比较 | 第57-59页 |
| 3.2.4 亚洲棉HMGR假基因位点的鉴定 | 第59-60页 |
| 3.2.5 雷蒙德氏棉和亚洲棉HMGR基因的表达分析 | 第60-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-65页 |
| 3.4 结论 | 第65-67页 |
| 第四章 雷蒙德氏棉和亚洲棉萜类合成酶(TPS)基因家族的全基因组分析 | 第67-97页 |
| 4.1 材料与方法 | 第67-68页 |
| 4.1.1 雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组TPS基因的检索和鉴定 | 第67-68页 |
| 4.1.2 染色体定位和基因结构分析 | 第68页 |
| 4.1.3 序列比对和进化树构建 | 第68页 |
| 4.2 结果与分析 | 第68-92页 |
| 4.2.1 雷蒙德氏棉和亚洲棉中TPS基因的鉴定结果 | 第68-78页 |
| 4.2.2 雷蒙德氏棉和亚洲棉TPS基因的系统发育分析 | 第78-81页 |
| 4.2.3 雷蒙德氏棉和亚洲棉TPS基因的染色体定位 | 第81-87页 |
| 4.2.4 雷蒙德氏棉和亚洲棉TPS基因的结构 | 第87-88页 |
| 4.2.5 雷蒙德氏棉和亚洲棉CDNS基因的鉴定 | 第88-90页 |
| 4.2.6 雷蒙德氏棉和亚洲棉CDNS基因结构比较 | 第90-92页 |
| 4.3 讨论 | 第92-96页 |
| 4.4 结论 | 第96-97页 |
| 第五章 总结与展望 | 第97-98页 |
| 参考文献 | 第98-112页 |
| 附录 | 第112-118页 |
