| DECLARATION | 第3-4页 |
| CERTIFICATION | 第4-5页 |
| DEDICATION | 第5-6页 |
| ACKNOWLEDGEMENTS | 第6-8页 |
| CONTENTS | 第8-18页 |
| ABSTRACT | 第18页 |
| Resume | 第21-23页 |
| CHAPTER 1 LITERATURE REVIEW | 第23-54页 |
| 1.1 Rice blast disease | 第23-31页 |
| 1.1.1 Introduction | 第23-26页 |
| 1.1.1.1 The economic problem | 第23页 |
| 1.1.1.2 Distribution of the rice blast disease | 第23-24页 |
| 1.1.1.3 Symptoms | 第24-26页 |
| 1.1.2 The causal organism | 第26-31页 |
| 1.1.2.1 Nomenclature of the rice blast pathogen | 第26页 |
| 1.1.2.2 Morphology | 第26-27页 |
| 1.1.2.3 Epidemiology | 第27-28页 |
| 1.1.2.3.1 Infection | 第27页 |
| 1.1.2.3.2 The infection cycle | 第27-28页 |
| 1.1.2.4 Life cycle of the rice blast fungus | 第28-30页 |
| 1.1.2.4.1 The asexual reproduction cycle | 第28-29页 |
| 1.1.2.4.2 The sexual reproduction cycle | 第29-30页 |
| 1.1.2.5 Host plants and host specialization of the blast | 第30-31页 |
| 1.2 The perfect stage of the rice blast fungus | 第31-33页 |
| 1.2.1 Mating types and fertility in Magnaporthe grisea | 第31-32页 |
| 1.2.2 Mating type occurrence in China | 第32-33页 |
| 1.3 Pathotype diversity in Magnaporthe grisea population | 第33-35页 |
| 1.3.1 Pathotypes diversity of the rice blast fungus in china | 第34-35页 |
| 1.4 Population genetic of fungi | 第35-43页 |
| 1.4.1 Population variation and evolution | 第36页 |
| 1.4.2 Population genetic analysis of Magnaporthe grisea | 第36-37页 |
| 1.4.3 Genetic diversity of the blast fungus in China | 第37-38页 |
| 1.4.4 Factors influencing the fungal genetic diversity | 第38-39页 |
| 1.4.5 Molecular genetic tools used to study fungal populations | 第39-43页 |
| 1.4.3.1 Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) | 第39-40页 |
| 1.4.3.2 Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) markers | 第40-41页 |
| 1.4.3.3 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLPs) | 第41页 |
| 1.4.3.4 Sequence Characterized Amplified Regions (scars) | 第41-42页 |
| 1.4.3.5 Repetitive element-based polymerase chain reaction (rep-PCR) and endogenous repetitive DNA sequences | 第42页 |
| 1.4.3.6 Iso-enzymatic markers | 第42-43页 |
| 1.5 Objectives | 第43-44页 |
| REFERENCES | 第44-54页 |
| CHAPTER 2 DISTRIBUTION OF MATING TYPE AND IDENTIFICATION OF PATHOTYPES IN MAGNAPORTHE GRISEA ISOLATES COLLECTED FROM BLAST NURSERIES IN HUNAN PROVINCE, CHINA | 第54-73页 |
| Abstract | 第54-55页 |
| 2.1 Introduction | 第55页 |
| 2.2 Materials and methods | 第55-61页 |
| 2.2.1 Collection | 第55-57页 |
| 2.2.2 Isolation and storage of the blast fungus | 第57页 |
| 2.2.3 Standard isolates for mating types determination | 第57-58页 |
| 2.2.4 Crossing method for mating types determination | 第58-59页 |
| 2.2.5 Asci and ascospores formation | 第59页 |
| 2.2.6 Pathogenicity assay and determination of the pathotype of each isolate | 第59页 |
| 2.2.7 Coding of the pathotypes | 第59-61页 |
| 2.3 Results | 第61-66页 |
| 2.3.1 Isolation of the blast fungus Magnaporthe grisea | 第61页 |
| 2.3.2 Distribution of the mating types and female isolates of Magnaporthe grisea in different collection sites | 第61-63页 |
| 2.3.3 Crosses among fertile isolates of M.grisea from Hunan | 第63页 |
| 2.3.4 Chinese race identification of isolates of Magnaporthe grisea from Hunan province | 第63-66页 |
| 2.3.5 Relation between fertility and Chinese race of Magnaporthe grisea | 第66页 |
| 2.4 Discussion | 第66-71页 |
| 2.4.1 Diversity of the mating types of Magnaporthe grisea in blast nurseries in Hunan province | 第66-68页 |
| 2.4.2 Diversity of the Chinese races of Magnaporthe grisea in blast nurseries in Hunan province | 第68-71页 |
| REFERENCES | 第71-73页 |
| CHAPTER 3 POPULATION GENETIC DIVERSITY OF THE RICE BLAST FUNGUS MAGNAPORTHE GRISEA IN BLAST NURSERIES OF HUNAN PROVINCE | 第73-93页 |
| Abstract | 第73-74页 |
| 3.1 Introduction | 第74-75页 |
| 3.2 Materials and methods | 第75-79页 |
| 3.2.1 Isolates of Magnaporthe grisea | 第75页 |
| 3.2.2 Culture medium | 第75-76页 |
| 3.2.3 Preparation of the fungal mycelium | 第76-77页 |
| 3.2.4 Composition and preparation of buffers solutions | 第77页 |
| 3.2.5 DNA extraction | 第77-78页 |
| 3.2.6 Selection of RAPD primers and amplification reaction | 第78页 |
| 3.2.7 Electrophoresis of the amplified products | 第78页 |
| 3.2.8 Clustering analysis | 第78-79页 |
| 3.3 RESULTS AND DISCUSSION | 第79-91页 |
| 3.3.1 Results | 第79-89页 |
| 3.3.1.1 Selection of primers | 第79页 |
| 3.3.1.2 RAPD amplification | 第79-81页 |
| 3.3.1.3 Genetic lineage and diversity of Magnaporthe grisea | 第81-89页 |
| 3.3.2 Discussion | 第89-91页 |
| 3.3.2.1 Population genetic diversity of the rice blast fungus in nurseries | 第89页 |
| 3.3.2.2 Relation between mating types, fertility and pathotype of isolates | 第89-91页 |
| REFERENCES | 第91-93页 |
| CHAPTER 4 Population Genetic Diversity of Fertile Magnaporthe grisea Isolates from Blast Nurseries in Hunan Province | 第93-110页 |
| Abstract | 第93页 |
| 4.1 Introduction | 第93-94页 |
| 4.2 Materials and methods | 第94-98页 |
| 4.2.1 Fungi strains | 第170页 |
| 4.2.2 Extraction of the genomic DNA | 第170页 |
| 4.2.3 Scars primers | 第170-171页 |
| 4.2.4 Scars-PCR amplification conditions | 第171页 |
| 4.2.5 Analysis of SCAR molecular data and construction of the dendrogram | 第171-98页 |
| 4.3 Results | 第98-107页 |
| 4.3.1 Scars amplification | 第98-99页 |
| 4.3.2 Lineage structure of fertile Magnaporthe grisea isolates | 第99-106页 |
| 4.3.3 Discussion | 第106-107页 |
| References | 第107-110页 |
| CHAPTER 5 GENERAL CONCLUSION | 第110-111页 |
| Publications | 第111页 |
