摘要 | 第4-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
第一章 引言 | 第13-22页 |
1. 大菱鲆概况 | 第13页 |
2. 分子标记辅助育种 | 第13-14页 |
3. 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP) | 第14-17页 |
3.1 SNP的特点 | 第15页 |
3.2 SNP位点的检测分型技术 | 第15-17页 |
4. SNP在遗传育种研究中的应用 | 第17-20页 |
4.1 遗传连锁图谱的构建 | 第17页 |
4.2 遗传多样性及亲缘关系研究 | 第17-18页 |
4.3 关联分析研究进展 | 第18-20页 |
5. 问题与展望 | 第20-21页 |
6. 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
第二章 大菱鲆生长性状与SNP位点的关联分析 | 第22-37页 |
1. 实验材料 | 第23-24页 |
1.1 实验材料 | 第23页 |
1.2 实验主要试剂 | 第23-24页 |
1.3 实验主要设备 | 第24页 |
2. 实验方法 | 第24-29页 |
2.1 基因组DNA的提取 | 第24-25页 |
2.2 基因组DNA质量及浓度检测 | 第25页 |
2.3 飞行质谱分型 | 第25-28页 |
2.4 数据分析 | 第28-29页 |
3. 实验结果 | 第29-33页 |
3.1 基因组DNA质量及浓度检测 | 第29页 |
3.2 SNP位点分型结果统计 | 第29-30页 |
3.3 SNP位点与生长性状关联分析 | 第30-31页 |
3.4 关联显著位点的多态性分析 | 第31-32页 |
3.5 单倍型及连锁不平衡分析 | 第32-33页 |
3.6 关联显著SNP位点基因功能预测 | 第33页 |
4. 讨论 | 第33-35页 |
4.1 SNP位点突变类型 | 第33页 |
4.2 生长性状的关联分析 | 第33-34页 |
4.3 SNP位点的多态性分析 | 第34页 |
4.4 连锁不平衡及单倍型分析 | 第34-35页 |
4.5 关联显著SNP位点基因功能预测 | 第35页 |
5. 小结 | 第35-37页 |
第三章 四个大菱鲆家系的遗传多样性分析 | 第37-55页 |
1. 实验材料 | 第37-38页 |
1.1 实验材料 | 第37-38页 |
2. 实验方法 | 第38页 |
2.1 基因组DNA的提取 | 第38页 |
2.2 基因组DNA质量及浓度检测 | 第38页 |
2.3 飞行质谱分型 | 第38页 |
2.4 数据分析 | 第38页 |
3. 实验结果 | 第38-42页 |
3.1 基因组DNA质量及浓度检测 | 第38页 |
3.2 SNP位点的基因分型结果统计 | 第38-40页 |
3.3 家系间遗传多样性分析 | 第40页 |
3.4 家系间遗传分化分析 | 第40-41页 |
3.5 家系间遗传距离及聚类分析 | 第41-42页 |
4. 讨论 | 第42-44页 |
4.1 四个大菱鲆家系的遗传多样性分析 | 第42页 |
4.2 四个大菱鲆家系间的遗传分化分析 | 第42-43页 |
4.3 家系间遗传距离及亲缘关系分析 | 第43-44页 |
第四章 大菱鲆生长性状相关基因克隆及表达分析 | 第44页 |
1. 实验材料 | 第44-45页 |
1.1 实验材料 | 第44页 |
1.2 实验主要试剂 | 第44页 |
1.3 实验主要设备 | 第44-45页 |
2. 实验方法 | 第45-49页 |
2.1 总RNA的提取 | 第45-46页 |
2.2 cDNA第一链的合成 | 第46页 |
2.3 大菱鲆NOTCH1基因片段克隆 | 第46-48页 |
2.4 大菱鲆NOTCH1基因mRNA的组织表达分析 | 第48-49页 |
3. 实验结果 | 第49-53页 |
3.1 大菱鲆各组织RNA提取质量检测 | 第49-50页 |
3.2 大菱鲆NOTCH1基因cDNA片段克隆 | 第50-52页 |
3.3 大菱鲆NOTCH1基因在两个生长时期幼鱼不同组织表达 | 第52-53页 |
4. 讨论 | 第53-55页 |
结论与展望 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-64页 |
附录 | 第64-72页 |
硕士在读期间发表的文章 | 第72-73页 |
致谢 | 第73页 |