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大菱鲆生长性状相关SNP位点的筛选鉴定及生物信息学分析

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-9页
第一章 引言第13-22页
    1. 大菱鲆概况第13页
    2. 分子标记辅助育种第13-14页
    3. 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)第14-17页
        3.1 SNP的特点第15页
        3.2 SNP位点的检测分型技术第15-17页
    4. SNP在遗传育种研究中的应用第17-20页
        4.1 遗传连锁图谱的构建第17页
        4.2 遗传多样性及亲缘关系研究第17-18页
        4.3 关联分析研究进展第18-20页
    5. 问题与展望第20-21页
    6. 本研究的目的和意义第21-22页
第二章 大菱鲆生长性状与SNP位点的关联分析第22-37页
    1. 实验材料第23-24页
        1.1 实验材料第23页
        1.2 实验主要试剂第23-24页
        1.3 实验主要设备第24页
    2. 实验方法第24-29页
        2.1 基因组DNA的提取第24-25页
        2.2 基因组DNA质量及浓度检测第25页
        2.3 飞行质谱分型第25-28页
        2.4 数据分析第28-29页
    3. 实验结果第29-33页
        3.1 基因组DNA质量及浓度检测第29页
        3.2 SNP位点分型结果统计第29-30页
        3.3 SNP位点与生长性状关联分析第30-31页
        3.4 关联显著位点的多态性分析第31-32页
        3.5 单倍型及连锁不平衡分析第32-33页
        3.6 关联显著SNP位点基因功能预测第33页
    4. 讨论第33-35页
        4.1 SNP位点突变类型第33页
        4.2 生长性状的关联分析第33-34页
        4.3 SNP位点的多态性分析第34页
        4.4 连锁不平衡及单倍型分析第34-35页
        4.5 关联显著SNP位点基因功能预测第35页
    5. 小结第35-37页
第三章 四个大菱鲆家系的遗传多样性分析第37-55页
    1. 实验材料第37-38页
        1.1 实验材料第37-38页
    2. 实验方法第38页
        2.1 基因组DNA的提取第38页
        2.2 基因组DNA质量及浓度检测第38页
        2.3 飞行质谱分型第38页
        2.4 数据分析第38页
    3. 实验结果第38-42页
        3.1 基因组DNA质量及浓度检测第38页
        3.2 SNP位点的基因分型结果统计第38-40页
        3.3 家系间遗传多样性分析第40页
        3.4 家系间遗传分化分析第40-41页
        3.5 家系间遗传距离及聚类分析第41-42页
    4. 讨论第42-44页
        4.1 四个大菱鲆家系的遗传多样性分析第42页
        4.2 四个大菱鲆家系间的遗传分化分析第42-43页
        4.3 家系间遗传距离及亲缘关系分析第43-44页
    第四章 大菱鲆生长性状相关基因克隆及表达分析第44页
    1. 实验材料第44-45页
        1.1 实验材料第44页
        1.2 实验主要试剂第44页
        1.3 实验主要设备第44-45页
    2. 实验方法第45-49页
        2.1 总RNA的提取第45-46页
        2.2 cDNA第一链的合成第46页
        2.3 大菱鲆NOTCH1基因片段克隆第46-48页
        2.4 大菱鲆NOTCH1基因mRNA的组织表达分析第48-49页
    3. 实验结果第49-53页
        3.1 大菱鲆各组织RNA提取质量检测第49-50页
        3.2 大菱鲆NOTCH1基因cDNA片段克隆第50-52页
        3.3 大菱鲆NOTCH1基因在两个生长时期幼鱼不同组织表达第52-53页
    4. 讨论第53-55页
结论与展望第55-57页
参考文献第57-64页
附录第64-72页
硕士在读期间发表的文章第72-73页
致谢第73页

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