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粟酒裂殖酵母核糖体蛋白RPL32-2的基因转录调控因子筛选研究

摘要第7-8页
Abstract第8-9页
第1章 绪论第10-22页
    1.1 核糖体蛋白的相关研究第10-15页
        1.1.1 核糖体蛋白研究的历史及其意义第10-11页
        1.1.2 核糖体蛋白功能的研究第11-14页
            1.1.2.1 维持核糖体稳定第11页
            1.1.2.2 超核糖体功能第11-14页
        1.1.3 RPL32同源基因的不同功能和差异表达的相关研究第14-15页
    1.2 转录调控因子相关的研究进展第15-17页
        1.2.1 转录调控因子的结构第15-16页
        1.2.2 转录因子调节基因转录的机制第16-17页
    1.3 启动子DNA结合蛋白研究策略第17-20页
        1.3.1 酵母单杂交技术第17-18页
        1.3.2 DNA迁移率变动试验(DNA mobility shift assay,EMSA)第18-19页
        1.3.3 染色质免疫共沉淀实验第19-20页
    1.4 本文研究目的与内容第20-22页
第2章 从粟酒裂殖酵母的cDNA文库筛选RPL32-2启动子的结合蛋白第22-47页
    2.1 构建cDNA文库第22-33页
        2.1.1 实验材料第22-24页
            2.1.1.1 菌株和质粒第22页
            2.1.1.2 培养基的配制第22页
            2.1.1.3 主要试剂及来源第22-23页
            2.1.1.4 其他试剂第23页
            2.1.1.5 主要仪器设备及其来源第23页
            2.1.1.6 引物第23-24页
        2.1.2 实验方法第24-30页
            2.1.2.0 野生型粟酒裂殖酵母972h-的总RNA的提取第24-25页
            2.1.2.1 RNA的验证第25-27页
            2.1.2.2 mRNA的纯化第27页
            2.1.2.3 合成单链cDNA第27-28页
            2.1.2.4 LD-PCR扩增双链cDNA第28-29页
            2.1.2.5 纯化dscDNA第29-30页
        2.1.3 实验结果第30-33页
            2.1.3.1 野生型粟酒裂殖酵母(972h-)总RNA的提取第30-31页
            2.1.3.2 验证粟酒裂殖酵母(972h-)总RNA的基因组是否除尽第31页
            2.1.3.3 mRNA的纯化第31页
            2.1.3.4 LD-PCR扩增双链cDNA结果第31-32页
            2.1.3.5 纯化ds cDNA结果第32-33页
        2.1.4 讨论第33页
    2.2 单杂交筛选RPL32-2启动子的转录因子第33-46页
        2.2.1 实验材料第33-35页
            2.2.1.1 菌株和质粒第33页
            2.2.1.2 培养基的配制第33-34页
            2.2.1.3 主要试剂及来源第34-35页
            2.2.1.4 其他试剂第35页
            2.2.1.5 引物第35页
        2.2.2 实验方法第35-40页
            2.2.2.1 确定菌株AbA抗性本底浓度第35-36页
            2.2.2.2 文库转化至酵母细胞第36-37页
            2.2.2.3 文库滴度的检测第37页
            2.2.2.4 酵母阳性克隆的确认第37-40页
        2.2.3 实验结果第40-46页
            2.2.3.1 诱饵菌株AbA抗性本底浓度第40-41页
            2.2.3.2 文库滴度的测定第41页
            2.2.3.3 酵母菌落PCR结果第41-42页
            2.2.3.4 NCBI比对结果第42-46页
    2.3 本章讨论第46-47页
第3章 酵母单杂交技术初步确定RPL32-2启动子的转录因子第47-59页
    3.1 酵母的再转化实验第47-56页
        3.1.1 实验材料第47-48页
            3.1.1.1 菌株和质粒第47页
            3.1.1.2 培养基的配制第47页
            3.1.1.3 其他试剂第47页
            3.1.1.4 引物第47-48页
        3.1.2 实验方法第48-52页
            3.1.2.1 构建pGADT7+Rps6-1,Rps10-1,Rpl5-1,Rpl5-2,Rpl27-1,EeF1B重组质粒第48-51页
            3.1.2.2 重组质粒化转诱饵菌株SC-Y1HGold(L32-2-AbAr)初步验证第51-52页
        3.1.3 实验结果第52-56页
            3.1.3.1 pGADT7+rps6-1,rps10-1,rpl5-1,rpl5-2,rpl27-1,ef1b重组质粒的构建结果第52-55页
            3.1.3.2 重组质粒再转化诱饵菌株SC-Y1HGold(L32-2-AbAr)初步验证第55-56页
    3.2 点圈实验验证RPS6-1,RPL5-1,RPL5-2与rpl32-2启动子有无相互作用第56-58页
        3.2.1 实验材料第56页
        3.2.2 实验方法第56页
        3.2.3 实验结果第56-58页
    3.3 本章讨论第58-59页
第4章 ChIP-PCR验证RPL32-2核糖体蛋白启动子与RPL5-1相互作用关系第59-77页
    4.1 构建带有PRL5-1-HA标签的酵母菌株第59-67页
        4.1.1 实验材料第59-60页
            4.1.1.1 菌株和质粒第59页
            4.1.1.2 培养基的配制第59页
            4.1.1.3 主要试剂及来源第59页
            4.1.1.4 主要仪器设备第59页
            4.1.1.5 引物第59-60页
        4.1.2 实验方法第60-65页
            4.1.2.1 运用三步融合法PCR扩增替换片段第60-63页
            4.1.2.2 构建PRL5-1-HA标签的SP-Q01酵母菌株第63-65页
        4.1.3 实验结果第65-67页
            4.1.3.1 构建PRL5-1-HA替换片段第65-66页
            4.1.3.2 菌落PCR验证转化子正确性第66-67页
    4.2 ChIP-PCR验证rpl32-2启动子与RPL5-1相互作用第67-74页
        4.2.1 实验材料第67-69页
            4.2.1.1 菌株和质粒第67页
            4.2.1.2 培养基的配制第67页
            4.2.1.3 主要试剂及其来源第67页
            4.2.1.4 其它试剂第67-68页
            4.2.1.5 主要仪器设备第68页
            4.2.1.6 引物第68-69页
        4.2.2 实验方法第69-72页
            4.2.2.1 甲醛固定酵母细胞第69页
            4.2.2.2 超声剪切染色质第69-70页
            4.2.2.3 Western Blot检验免疫共沉淀效果第70-71页
            4.2.2.4 免疫共沉淀DNA以及纯化DNA第71页
            4.2.2.5 PCR扩增靶基因第71-72页
        4.2.3 实验结果第72-74页
            4.2.3.1 检测染色质剪切效果第72页
            4.2.3.2 Western Blot检验免疫共沉淀效果第72-73页
            4.2.3.3 PCR扩增靶基因片段第73-74页
    4.3 本章讨论第74-77页
第5章 全文总结第77-78页
参考文献第78-82页
在读期间发表的学术论文及研究成果第82-83页
致谢第83页

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