应用于蛋白质折叠分析的大规模NoC众核计算平台
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 引言 | 第7-10页 |
| 1.1 研究背景 | 第7-8页 |
| 1.2 研究发展现状 | 第8-9页 |
| 1.3 本文的贡献 | 第9页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第9-10页 |
| 第二章 蛋白质折叠问题 | 第10-17页 |
| 2.1 蛋白质折叠问题综述 | 第10-12页 |
| 2.2 蛋白质的结构组成 | 第12-13页 |
| 2.3 蛋白质的HP模型 | 第13-15页 |
| 2.4 蛋白质结构的编解码方法 | 第15-17页 |
| 第三章 遗传算法 | 第17-25页 |
| 3.1 NPC问题与探索性算法 | 第17-18页 |
| 3.2 遗传算法的基本概念 | 第18-21页 |
| 3.3 蛋白质折叠的并行遗传算法 | 第21-25页 |
| 第四章 网状拓扑的单岛平台 | 第25-47页 |
| 4.1 单岛平台总体架构 | 第25-27页 |
| 4.2 主从处理器设计 | 第27-30页 |
| 4.3 片上网络NoC设计 | 第30-47页 |
| 4.3.1 片上网络NoC总体架构 | 第33-35页 |
| 4.3.2 路由算法 | 第35-37页 |
| 4.3.3 流量控制 | 第37-44页 |
| 4.3.4 路由结构 | 第44-47页 |
| 第五章 基于交换Hub的多岛平台 | 第47-57页 |
| 5.1 单岛平台的瓶颈 | 第47-50页 |
| 5.1.1 有限网络容量和加速比饱和 | 第47-49页 |
| 5.1.2 局部最小陷阱 | 第49-50页 |
| 5.2 多岛平台总体架构 | 第50-52页 |
| 5.3 交换Hub设计 | 第52-55页 |
| 5.4 基于健康度的动态移民算法 | 第55-57页 |
| 第六章 平台验证 | 第57-65页 |
| 6.1 平台验证设置 | 第57页 |
| 6.2 单岛平台验证 | 第57-60页 |
| 6.3 多岛平台验证 | 第60-65页 |
| 第七章 总结与展望 | 第65-68页 |
| 7.1 总结 | 第65页 |
| 7.2 展望 | 第65-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 个人发表论文目录 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
