摘要 | 第3-4页 |
ABSTRACT | 第4-5页 |
第一章 引言 | 第10-21页 |
1.1 植物寄生线虫简介 | 第10-13页 |
1.1.1 燕麦孢囊线虫的危害与特征 | 第10-11页 |
1.1.2 松材线虫的危害和特征 | 第11-12页 |
1.1.3 几种危害严重的根结线虫简介 | 第12-13页 |
1.2 植物基因工程遗传改良在抗线虫研究中的优势 | 第13页 |
1.3 植物寄生线虫效应因子 | 第13-18页 |
1.3.1 线虫食道腺细胞为效应蛋白的主要合成与分泌部位 | 第13-15页 |
1.3.2 植物寄生线虫效应因子的生物学功能 | 第15-16页 |
1.3.3 RxLR效应因子 | 第16页 |
1.3.4 利用PVX表达载体研究线虫效应因子 | 第16-17页 |
1.3.5 分泌蛋白质组的概念 | 第17-18页 |
1.4 高通量数据在植物寄生线虫学研究中的应用 | 第18-19页 |
1.4.1 植物寄生线虫测序项目和数据与日俱增 | 第18页 |
1.4.2 高通量数据和生物信息技术预测分泌蛋白 | 第18-19页 |
1.4.3 利用同源序列筛选RNAi靶标基因 | 第19页 |
1.5 本研究目的与意义 | 第19-21页 |
第二章 燕麦孢囊线虫寄生前、后转录组的比较与分析 | 第21-68页 |
2.1 材料与方法 | 第21-28页 |
2.1.1 线虫材料的收集 | 第21-22页 |
2.1.2 mRNA的制备以及454测序文库的建立 | 第22-23页 |
2.1.3 生物信息分析 | 第23-25页 |
2.1.4 qRT-PCR验证基因不同龄期发育表达模式 | 第25页 |
2.1.5 线虫组织原位杂交 | 第25-27页 |
2.1.6 效应因子对BAX引发的烟草细胞程序性死亡(BT-PCD)作用的检测 | 第27页 |
2.1.7 观察PVX介导烟草系统性表达线虫效应因子对其毒力的影响 | 第27-28页 |
2.2 结果分析与讨论 | 第28-66页 |
2.2.1 转录组测序、拼接及基本注释 | 第28-32页 |
2.2.2 不同生活方式线虫比较分析 | 第32-46页 |
2.2.3 寄生前、后两个混合虫态转录组比较分析 | 第46-50页 |
2.2.4 效应因子的挖掘 | 第50-62页 |
2.2.5 新效应因子初步功能验证 | 第62-65页 |
2.2.6 潜在的RNAi防治靶标预测 | 第65-66页 |
2.3 小结与展望 | 第66-68页 |
第三章 三种不同致病力松材线虫比较分泌组 | 第68-75页 |
3.1 材料与方法 | 第68-69页 |
3.1.1 线虫材料 | 第68页 |
3.1.2 数据来源 | 第68页 |
3.1.3 分析方法 | 第68-69页 |
3.2 结果分析 | 第69-74页 |
3.2.1 松材线虫和拟松材线虫基因组基本情况 | 第69-70页 |
3.2.2 分泌蛋白质组预测 | 第70-71页 |
3.2.3 分泌蛋白质组比较与分析 | 第71-74页 |
3.3 小结与讨论 | 第74-75页 |
第四章 三种植物线虫RNAI致死或发育障碍靶标基因挖掘 | 第75-81页 |
4.1 材料与方法 | 第75-76页 |
4.1.1 数据来源 | 第75页 |
4.1.2 分析方法 | 第75-76页 |
4.2 结果与分析 | 第76-80页 |
4.2.1 防治根结线虫RNAi靶标基因 | 第76-78页 |
4.2.2 防治大豆孢囊线虫RNAi靶标基因 | 第78-80页 |
4.3 小结与讨论 | 第80-81页 |
第五章 全文总结和展望 | 第81-82页 |
参考文献 | 第82-96页 |
附录 | 第96-99页 |
致谢 | 第99-100页 |
个人简介 | 第100页 |