| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 符号说明 | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第9-16页 |
| 1.1 植物响应非生物胁迫的研究进展 | 第10-12页 |
| 1.1.1 植物响应干旱逆境机制的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.1.2 植物响应盐碱逆境机制的研究进展 | 第11页 |
| 1.1.3 植物响应高温和低温逆境机制的研究进展 | 第11-12页 |
| 1.2 RNA-Seq技术 | 第12-13页 |
| 1.2.1 测序方法的发展 | 第12-13页 |
| 1.2.2 RNA-Seq技术的优势 | 第13页 |
| 1.3 转录组测序技术在玉米研究中的应用及展望 | 第13-14页 |
| 1.3.1 新基因挖掘及其功能预测 | 第13-14页 |
| 1.3.2 代谢网络研究领域的应用 | 第14页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第14-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-26页 |
| 2.1 实验材料 | 第16页 |
| 2.2 实验试剂与仪器设备 | 第16页 |
| 2.2.1 主要实验试剂 | 第16页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第16页 |
| 2.3 实验方法 | 第16-26页 |
| 2.3.1 总RNrA的提取、纯化与质检 | 第16-17页 |
| 2.3.2 转录组测序 | 第17-22页 |
| 2.3.2.1 RNA-Seq文库的构建 | 第18-22页 |
| 2.3.2.2 上机测序 | 第22页 |
| 2.3.3 转录组数据分析 | 第22-24页 |
| 2.3.3.1 数据预处理 | 第22页 |
| 2.3.3.2 基因组比对(Mapping genome) | 第22-23页 |
| 2.3.3.3 基因水平表达定量 | 第23页 |
| 2.3.3.4 差异基因表达分析 | 第23页 |
| 2.3.3.5 差异表达基因的GO富集分析 | 第23-24页 |
| 2.3.3.6 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第24页 |
| 2.3.4 第一链cDNA合成 | 第24-25页 |
| 2.3.5 qRT-PCR分析 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-37页 |
| 3.1 不同逆境条件下玉米叶片转录组测序 | 第26页 |
| 3.2 不同逆境条件下玉米叶片中基因表达的分析与验证 | 第26-29页 |
| 3.3 不同逆境条件下玉米叶片中基因差异表达分析 | 第29-31页 |
| 3.4 差异表达基因的功能聚类分析 | 第31-34页 |
| 3.5 差异表达基因中转录因子分析 | 第34-35页 |
| 3.6 ABA合成及信号转导途径对非生物胁迫的响应 | 第35-37页 |
| 4 讨论与结论 | 第37-41页 |
| 4.1 讨论 | 第37-40页 |
| 4.1.1 ABA的生物合成和信号转导相关的差异表达基因 | 第37-38页 |
| 4.1.2 转录因子相关的差异表达基因 | 第38页 |
| 4.1.3 极长链脂肪酸(VLCFA)和脂质信号有关的差异表达基因 | 第38-39页 |
| 4.1.4 玉米对不同非生物胁迫响应机制的差异 | 第39-40页 |
| 4.2 结论 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 攻读硕士期间参与发表的学术论文 | 第48-49页 |
